Leonard e Sheldon incontrano una giovane donna di nome Katie che piange sul marciapiede, essendo stata lasciata senza casa dopo la rottura con il suo fidanzato. Leonard, nonostante le obiezioni di Sheldon, la invita a cena e poi a stare alcuni giorni nel loro appartamento. È dura, sexy e sarcastica, ma si ammorbidisce un po 'quando scopre che i ragazzi non stanno cercando di ottenere qualcosa da lei.

Leonard e Sheldon, due ricercatori di un istituto di fisica universitario dall'elevato QI, fanno conoscenza di Penny, la loro nuova vicina di casa che ha appena traslocato. Gentile e molto carina, la ragazza conquista subito il cuore di Leonard che è subito disposto a tutto pur di renderle meno faticoso il primo giorno nel nuovo appartamento nonostante lo scetticismo di Sheldon e degli altri due loro amici ricercatori Howard e Rajesh, tutti convinti che un nerd mai e poi mai potrà avere una relazione sentimentale con una ragazza come Penny.

Penny chiede a Leonard e Sheldon di ricevere, in sua assenza, la consegna di un grosso pacco e lascia loro le chiavi di casa. Ma Sheldon, ossessivamente meticoloso, resta sconvolto dal disordine che regna nella casa della ragazza e durante la notte, mente lei dorme, si intrufola nell'appartamento per mettere ordine.

Leonard resta sconvolto nel vedere Penny baciare un ragazzo sul pianerottolo e su consiglio dell'amico Howard decide di chiedere un appuntamento a Leslie Winkle, una collega ricercatrice, nerd quanto lui. Ma dopo un bacio sperimentale, Leslie lo scarica brutalmente e Leonard, preso il coraggio a due mani, prova ad invitare Penny a cena.

Nel laboratorio universitario arriva un nuovo dirigente che Sheldon considera assolutamente incompetente. Questa convinzione, esternata in pubblico, porta al licenziamento del geniale fisico che si rinchiude in casa in preda alla depressione. L'impossibile carattere di Sheldon metterà a dura prova la convivenza con Leonard che si vede costretto a chiedere l'intervento di Mary Cooper, madre di Sheldon, per convinecere lo scienziato a chiedere scusa al suo superiore così da riottenere il proprio incarico.

Mentre sono a cena nel locale dove lavora Penny, Leonard e Sheldon incontrano la loro collega Leslie che chiede a Leonard se è intenzionato a far parte di un quartetto d'archi. Lo scienziato accetta e dopo una prova nel salotto di casa, Leslie gli fa chiaramente capire di essere disposta ad andare a letto con lui. Sheldon, rientrato in casa, trova una cravatta appesa alla maniglia della porta della camera di Leonard ed indeciso sul significato del segnale decide di chiedere consiglio a Penny.

Halloween, Penny invita i quattro amici nerd alla sua festa in costume e dopo avere deciso faticosamente cosa indossare, Leonard e gli altri si recano a casa della ragazza. Ma tra gli invitati c'è anche l'ex boyfriend di Penny che mette a dura prova la pazienza di Leonard.

Un'amica di Penny, molto libera sessualmente, arriva in città e si fa ospitare dalla ragazza. Howard intraprende subito una relazione con lei e questo turba gli equilibri e le dinamiche all'interno del gruppo di amici che si vedono costretti a chiedere a Penny di essere il quarto elemento del team durante le serate dedicate al videogioco Halo 3.

I genitori di Koothrappali organizzano dall'india un appuntamento con scopi matrimoniali al proprio figlio con una ragazza del loro paese appena arrivata negli USA, ma Rajesh non riesce a dire una sola parola in presenza di esponenti del sesso femminile. Per aiutare Penny con un nuovo incarico di barista al ristorante i quattro amici si offrono di sperimentare le bevande da lei preparate e Rajesh scopre che l'alcol riesce a fargli superare la sua limitazione nei confronti delle ragazze. Decide allora di andare all'appuntamento con la giovane indiana completamente ubriaco.

Sheldon e Leonard sono invitati a presentare le conclusioni di una loro ricerca ad una conferenza, ma Sheldon rifiuta suscitando il disappunto di Leonard. Penny tenta di mediare tra i due amici, ma con conseguenze ancora più disastrose.

Penny invita Leonard e Sheldon ad uno spettacolo musicale dove deve esibirsi come cantante, ma i due amici sono consapevoli del fatto che la ragazza è completamente stonata. Per sottrarsi all'invito, Leonard le dice di avere un'importante conferenza proprio nel giorno della rappresentazione, ma Sheldon, non convinto della validità della bugia, ne inventa un'altra molto più complicata ed inestricabile.

Sheldon è colpito da una banale influenza, ma tutte le sue manie vengono acutizzate dalla febbre rendendo la vita impossibile agli amici che uno dopo l'altro lo isolano. Penny, all'oscuro di tutto, è costretta a prendersi cura dell'ammalato.

Nel laboratorio universitario arriva un giovanissimo fisico coreano di soli 14 anni e subito il ragazzo rende la vita difficile a Sheldon che non sopporta l'idea che possa esistere qualcuno più intelligente e dotato di lui. Il geniale scienziato, in crisi di identità, allora tenta di intromettersi nel lavoro dei suoi amici scatenando le loro inevitabili reazioni.

Arriva il momento delle "Olimpiadi della Fisica" e Leonard, Howard e Rajesh convincono Sheldon a partecipare nella loro squadra. Ma le velleità dittatoriali dell'egocentrico Dott. Cooper fanno sì che ben presto gli amici gli chiedano di lasciare il team. Sheldon allora decide di competere con una squadra tutta sua.

Leonard, con l'aiuto degli amici, acquista ad un'asta in rete una macchina del tempo usata durante le riprese di un vecchio b-movie di fantascienza. Quando Penny vede troneggiare nel salotto lo strano marchingegno accusa i ragazzi di essere infantili e Leonard, punto nel vivo, decide di liberarsi di tutta la sua collezione di oggetti da nerd pur di rientrare nei favori della ragazza.

Arriva in città la sorella gemella di Sheldon, sicuramente non geniale come il fratello, ma dotata di una bellezza fuori dal comune e tra Leonard, Howard e Rajesh si scatena subito la competizione feroce per attirare l'attenzione della ragazza. Per eliminare la concorrenza, Leonard convince Sheldon ad occuparsi in prima persona della scelta del compagno adeguato alle potenzialità della sorella, così da salvaguardare il patrimonio genetico di famiglia.

Si avvicina il compleanno di Leonard e Penny decide di organizzare una festa a sorpresa con l'aiuto degli amici assegnando loro i vari compiti per la riuscita del party. Arrivato il giorno della festa, Howard è costretto a fingere un grave attacco di allergia pur di trattenere Leonard lontano da casa durante gli ultimi preparativi.

Penny è molto giù di morale per la definitiva rottura con il suo ultimo boyfriend e Leonard prova invano a consolarla, infine si fa coraggio e le chiede un appuntamento. La ragazza accetta però ha paura di rovinare l'amicizia e non ha altra scelta che domandare consiglio al miglior amico di Leonard: Sheldon.

Penny si apre con Sheldon dopo un poco esaltante appuntamento con Leonard, mettendolo nella spiacevole situazione di dover tenere un segreto.

La sofferenza di vedere Penny con altri uomini spinge Leonard di nuovo verso Leslie Winkle.

Sheldon crea un mostro quando fa scoprire a Penny i videogame online.

Raj se la tira e ci prova con Penny dopo essere stato citato in una rivista scientifica.

Leonard e i suoi amici si danno da fare per obbligare Sheldon ad affrontare la sua paura di guidare.

Sheldon ed il resto del gruppo sono confusi quando una giovane studentessa sembra essere attratta da lui.

Quando Sheldon proibisce a Penny di frequentare l'appartamento a causa di numerose infrazioni minori, lei decide di vendicarsi.

Senza accorgersene, Leonard porta via la nuova donna di Wolowitz che crede sia l'amore della sua vita.

Sheldon è eccitato quando Leonard inizia a vedersi con una donna che corrisponde ai propri rigidi standard.

Leonard chiede un consiglio a Penny quando la sua nuova relazione inizia a procedere troppo velocemente.

Penny inizia a vederesi con il bel collega di Leonard. Leonard ed i suoi amici vengono ossessionati dalla mania di Sheldon con il galateo dei regali.

Le critiche di Penny nei confronti della vita romantica di Wolowitz lo spingono in depressione e lo tengono lontano da un combattimento robotico dove i suoi amici richiedono il suo aiuto.

Sheldon crea una procedura scientifica per costruire degli amici.

La soluzione di Sheldon per le difficoltà finanziarie di Penny portano ad uno scontro tra Leonard e l'ex fidanzato di Penny.

Leonard e Penny si avvicinano tra loro dopo una visita disastrosa della mamma di Leonard.

Una partita a paintball porta ad uno scontro tra Sheldon e Penny ed una relazione tre Leslie e Wolowitz.

Leonard, Sheldon e Wolowitz sono eccitati quando scoprono che una famosa attrice di fantascienza (Summer Glau) è a bordo del treno che li sta portando a San Francisco.

I lavori di casa di Penny si trasformano in un completo incubo quando Sheldon prende il sopravvento.

Penny squadra la nuova bella ragazza che viene ad abitare nel palazzo e che potrebbe diventare la "nuova Penny".

Un appassionato di fumetti che cerca di provarci con Penny fa andare Leonard e Howard nel locale Ladies' Night.

Leonard e Koothwappali scortano Wolowitz con il cuore spezzato fino a Las Vegas. Sheldon rimane chiuso fuori dal suo appartamento e deve rimanere con Penny.

Al secondo appuntamento con Stuart, Penny fa un commento che da a Leonard nuove speranze per una relazione con lei. Wolowitz scopre che c'è un errore critico in un progetto della NASA su cui sta lavorando.

Il piano dei ragazzi per organizzare l'estate al Polo Nord fa rivalutare a Penny i suoi sentimenti per Leonard.

Quando Sheldon viene a sapere che i suoi amici hanno sabotato i dati raccolti nella spedizione polare, parte affranto per il Texas. Questo costringe i ragazzi ad andarlo a riprendere, il che intralcia con la speranza di Leonard di avere momenti romantici con Penny e mette a rischio l'amicizia tra i ragazzi.

Leonard e Penny fanno fatica a passare oltre una goffa prima volta, mentre Sheldon e Howard mettono in palio i loro migliori fumetti in una scommessa a proposito di un grillo.

Howard e Raj vanno a rimorchiare in un locale Goth, mentre Sheldon cerca di "modellare" Penny sperimentando la tecnica di modifica del comporamento basata sul cioccolato...

Raj deve trovare un nuovo lavoro o verrà rimandato in India, ma Sheldon ha una soluzione, che però lascia Penny e Leonard a ritrovarsi Howard come terzo incomodo...

Sheldon si prepara a dare battaglia contro l'attore dell'universo di Star Trek che lui detesta: Wil Wheaton. Intanto Wolowitz chiede a Penny di presentargli una delle sue amiche.

Sheldon insegna a Leonard le regole del football, mentre un incidente crea una frattura tra Wolowitz e Raj.

Sheldon fa da mediatore tra Leonard e Penny per via di un battibecco tra innamorati, tuttavia le sue motivazioni non sono per niente altruistiche...

Leonard, Raj e Wolowitz sono fuori città per un campeggio nel desertoo e Sheldon si ritrova a dover soccorrere Penny che subisce un infortunio.

Barry Kripke mette in imbarazzo Sheldon e gli amici si organizzano per fargliela pagare. Wolowitz è disperato perchè la storia con Bernadette si sta affievolendo e chiede consiglio a una visione di Katee Sackhoff.

Penny chiede aiuto a Sheldon per capire meglio gli esperimenti di fisica di Leonard. Intanto Wolowitz si ingelosisce perchè Leonard invita la sua ragazza Bernadette ad assistere ad un suo esperimento.

Leonard teme per la sua relazione con Penny a causa di una visita della madre. Sheldon è invece elettrizzato per la presenza di Beverly.

Leonard rimane scioccato quando scopre che Penny crede nel paranormale. Intanto Sheldon cerca di aiutare Raj a conquistare una ragazza durante una festa universitaria.

Quando Leonard e Sheldon subiscono un furto nel loro appartamento, si rivolgono ai loro amici per creare un sistema antifurto ipertecnologico.

La ricerca della risposta ad un problema di fisica porta Sheldon a lavorare con Penny alla Fabbrica del Cheesecake.

Leonard può portare solo una persona in un viaggio in Svizzera per visitare l'acceleratore di particelle del CERN.. il giorno di S.Valentino..

Sheldon è chiamato in giudizio per una multa presa a causa di Penny.

I ragazzi in un mercatino trovano un anello che sembra provenire dal set de "Il signore degli Anelli" e che è causa dell'ennesima discussione.

Gli amici di Sheldon intervengono in suo aiuto quando la sua paura di parlare in pubblico si frappone tra lui ed un ambito premio.

Sheldon e il suo arcinemico, Wil Wheaton, si battono nuovamente, stavolta sulla pista da bowling, mentre Leonard e Penny affrontano una discussione.

Una lite fa sì che Leonard e Penny non si parlino più e Sheldon fa di tutto per rendere entrambi felici.

Sheldon ospita una scienziata in visita la cui intelligenza è pari solo alla sua carica sessuale.

Dopo una discussione sulla temperatura dell'appartamento, Leonard si confida con Penny e le racconta come e quando ha conosciuto Sheldon.

Howard e Raj cercano di trovare la ragazza perfetta per Sheldon usando un sito internet. Penny è preoccupata perchè convinta che dopo aver avuto Leonard come fidanzato, non riuscirà ad uscire con ragazzi normali.

Howard possiede un braccio robotico e mostra le sue potenzialità agli amici.

L'episodio vede protagonista Sheldon che, dopo aver calcolato approssimativamente l'anno della sua morte e aver constatato che non raggiungerà l'anno in cui le anime umane si fonderanno con i robot per vivere in eterno, cerca di fare una vita più sana.

Il gruppo di amici è continuamente esasperato dagli inverventi puntigliosi e spesso fuori luogo degli "Shamy", ma è proprio il carattere troppo simile e competitivo dei due scienziati a portarli alla rottura del loro rapporto. Nonostante Sheldon inizialmente non sembri accusare il colpo, la mancanza di quest'ultima lo spinge a sostituire la ragazza con un gatto, il Dott. Robert Hoppenheimer.

L'episodio ruota intorno al tentantivo di Howard di rifidanzarsi con Bernadette, biologa e cameriera come Penny alla Fabbrica del Cheesecake. Wolowitz confessa imbarazzato alla bionda amica che lui e la ragazza si sono lasciati, senza aver mai consumato sessualmente il rapporto.

Quando Amy Farrah Fowler chiede a Sheldon di incontrare sua madre, lo preoccupa molto. Lui insiste ancora nel dire che Amy è una sua amica ma non la sua ragazza. Quando Leonard gli rivela che è una cosa che adesso non può più dire, Sheldon impazzisce e cerca subito di interrompere il rapporto con Amy.

Pryia, la sorella di Raj, è in visita a Pasadena e subito crea dei problemi fra gli amici. Lei e Leonard apparentemente hanno una storia, nonostante lui e Howard abbiano giurato che non avrebbero mai interagito con lei per rispetto verso Raj.

L'episodio comincia all'ora di pranzo nella mensa dell'università, dove Howard informa i suoi amici che gli verrà affidato un lavoro estremamente importante e che loro dovranno quindi sostenere un colloquio con un agente dell'FBI per fornire delle credenziali riguardo l'ingegnere.

Questa puntata si apre con Penny e i ragazzi che stanno guardando il film "Indiana Jones e i predatori dell'arca perduta" e successivamente nel discorso salterà fuori che andranno a vederlo di nuovo al cinema nell'edizione con 21 secondi extra. Amy decide di aggregarsi alle ragazze invece di andare al cinema.

Leonard rimane piacevolemente sorpreso quando, dopo aver bussato alla porta di Penny, riceve un bacio dalla stessa. Più tardi lei lo informa che suo padre Wyatt (Keith Carradine) è in visita, e che lei gli ha detto che sono tornati insieme perché lui è l'unico ragazzo che suo padre abbia mai accettato.

Amy si invaghisce di uno degli ex di Penny, mentre Raj e Wolowitz discutono su chi dei due possa essere migliore come supereroe.

I ragazzi spingono Zack ad inscriversi al loro concorso per il miglior costume della Justice League.

L'amicizia tra Sheldon e Leonard è messa a repentaglio da una discussione tra i due riguardo l'idea per un'applicazione per smartphone.

Bernadette si imbatte in un suo ex ad una convention scientifica in un hotel e Wolowitz è preoccupato di non riuscire a dimostrarsi all'altezza del rivale.

Nella speranza che questo lo renda un insegnante migliore, Sheldon riceve lezioni di recitazione da Penny. Raj fantastica sulla ragazza di un amico.

Un'anziana ma benestante finanziatrice della Caltech chiede di fare sesso con Leonard in cambio di un'altra donazione.

Bernadette dice ad Howard che è il momento di scegliere tra trasferirsi con lei o restare con la madre. Leonard scopre che la sorella di Raj, Priya, è tornata in città e si riavvicina a lei ed Amy cerca di confortare Penny quando scopre dei due.

Il gruppo si sposta a casa di Raj per seguire Leonard ed il suo rapporto con Priya, così Sheldon cerca di formare un nuovo gruppo di amici di cui può essere il fulcro.

Sheldon è confuso dai trucchi di magia di Wolowitz. Intanto Leonard capisce che il suo rapporto con Priya sta rendendo impossibile restare amico con Penny.

L'account online di Sheldon viene hackerato ed il suo personaggio rubato. Il gruppo si dà da fare per scoprire il colpevole.

Sheldon ed Amy decidono di dar vita a molte voci su di loro come test. Intanto Howard fa un ulteriore passo avanti nella sua relazione con Bernadette.

Sheldon va a ballare con le ragazze, mentre Priya cerca di annullare il roommate agreement usando teorie legali.

Raj spera di curare la sua incapacità di parlare alle donne. Intanto Penny recluta Bernadette per spiare Leonard e Priya.

La signora Wolowitz finisce in ospedale dopo l'annuncio di Howard del suo fidanzamento con Bernadette. Mentre si trovano lì, Leonard non è contento dell'intesa tra Penny e Priya.

Stanco di ascoltare i giochi a base di Star Trek tra Leonard e Priya, Raj va a vivere con Sheldon. Il titolo di studio di Bernadette le permette di guadagnare più di Howard ed il ragazzo è oggetto delle prese in giro degli amici.

Il gruppo deve affrontare le conseguenze del finale della stagione precedente. Penny teme di aver rovinato tutto con i suoi amici; intanto Sheldon prende il comando della squadra di paintball.

Un litigio tra Penny e Sheldon fa sì che Amy si ritrovi nel mezzo. Intanto Leonard cerca di movimentare la sua relazione a distanza con Priya.

Un litigio tra Penny e Sheldon fa sì che Amy si ritrovi nel mezzo. Intanto Leonard cerca di movimentare la sua relazione a distanza con Priya.

Penny fa da cupido per conto di Raj, cosa che finalmente da' dei buoi risultati.

Sheldon e Leonard sono invitati ad una festa da Wil Wheaton mentre Howard riceve un'offerta che si verifica solo una volta nella vita.

La madre di Sheldon arriva in visita in città ma Sheldon è sorpreso e dispiaciuto che sua madre non è più quella di prima.

Durante il periodo di Halloween Sheldon decide di voler spaventare i suoi amici. Leonard intanto si ritrova coinvolto con ragazza appassionata di fumetti.

Amy si sente tradita quando scopre che Penny e Bernadette sono andate a fare shopping senza di lei.

Sheldon cerca di superare la sua fobia verso gli uccelli mentre Leonard e Penny cercano di trascorrere un po' di tempo da soli.

Sheldon scopre di essere geloso quando Amy esce per un appuntamento con Stuart.

Leonard viene contattato su Facebook da un compagno di scuola del suo passato che non faceva altro che seviziarlo. Riluttante accetta di incontrarlo e scopre che il tizio lo ha contattato per avere una mano in un folle progetto finanziario. Mentre si trova con le sue amiche, Penny si rende conto di non essere stata una brava compagna di classe e cerca un modo per rimediare ai suoi errori.

Amy rimane delusa quando Sheldon non si congratula sinceramente con lei per un risultato conseguito. Howard scopre che Bernadette ha un'avversione per i bambini.

Spinto dall'emotività del momento, Leonard chiede a Penny di uscire di nuovo insieme. Sheldon è deluso dopo aver ricevuto un gadget di Star Trek ordinato online.

Leonard e Penny scrivono una lista di difetti della loro relazione con l'intento di fortificarla. Sheldon e Amy creano una web series su Youtube chiamata Fun with Flags e Raj sviluppa un'ossessione per Siri sul suo iPhone.

Leonard non ce la fa' più a sopportare l'egoismo di Sheldon e decide di dissolvere il contratto tra loro due. Howard vorrebbe avere un soprannome fico per quando diventerà astronauta.

Sheldon è costretto a usare i suoi giorni di festa e decide di passare il tempo libero nel laboratorio di Amy. Bernadette confida alle ragazze che suo padre vuole far firmare a Howard un accordo prematrimoniale.

All'università si rende disponibile un nuovo ufficio e Sheldon si sfida con Kripke per aggiudicarselo. I due decidono di risolvere la questione giocando a basket. Amy regala un quadro inquietante a Penny.

Sheldon è costretto ad alterare la sua routine quando il suo barbiere si ammala. Nel frattempo il training per diventare astronauta è più duro del previsto e Howard si chiede se ha la stoffa per farcela.

Sheldon fa arrabbiare Amy quando preferisce trascorrere un weekend con i suoi amici e videogames piuttosto che andare alla festa di compleanno di sua zia.

Penny regala due rari teletrasporti giocattolo di Star Trek a Sheldon e Leonard. Convinto dall'apparizione del signor Spock in sogno, Sheldon apre il suo, lo rompe e lo sostituisce di nascosto con quello di Leonard.

Questo speciale mostra varie aree dello spettacolo, incluso il guardaroba, i set, e include colloqui con i consulenti scientifici. Festeggia il centesimo episodio, presentato da Rick Edwards.

Celebrando il 100 ° episodio di The Big Bang Theory, Rick Edwards guarda ad alcune delle scene più divertenti e memorabili della sitcom americana con il cast e la troupe sul set di Hollywood.

Gli attori condividono i loro momenti preferiti e rivelano alcuni segreti sulla realizzazione dello spettacolo.

Wolowitz dovrà fare da assistente a Stephen Hawking che si trova a Pasadena per tenere delle lezioni.

Durante l’addio al celibato di Howard vengono rivelati episodi "piccanti" della sua vita che fanno infuriare Bernadette.

La data della missione che Howard deve compiere nello spazio viene riprogrammata e questo crea conflitto con le nozze.

Bernadette decide di voler sposare Howard a tutti i costi prima della sua missione nello spazio.

Sheldon ed Amy festeggiano il loro bi-anniversario, ma il protagonista farà arrabbiare Amy invitando Raj, alle prese con un brutto problema di solitudine. Leonard e Penny decideranno di passare del tempo insieme, con il primo disposto a trascorrere una serata birra e football pur di parlare con la seconda della loro relazione; le cose saranno però rovinate da Raj, che dopo aver lasciato Sheldon e Amy piomberà nell’appartamento e tenterà di costringere Penny a rivelare i veri sentimenti per Leonard. Anche dallo spazio, infine, Howard sarà costretto a sentire le discussioni tra sua madre e Bernadette.

Sheldon , venuto a sapere che Penny pensa di rompere con Leonard , deciderà di prendere in mano la situazione, mentre nello spazio Howard avrà qualche problema di convivenza con gli altri astronauti.

Sheldon assume un'avvenente collaboratrice di nome Alex, la quale scatena la gelosia prima di Amy e poi di Penny. Nel frattempo, Howard comunica a Bernadette che dovrà rimanere nello spazio una decina di giorni oltre il previsto.

Quando Wolowitz ritorna dallo spazio non ha il benvenuto che si aspettava: Bernadette è ammalata, sua madre è in dolce compagnia e Raj lo ha rimpiazzato con Stuart. Nel frattempo un gioco di società a quattro tra Penny, Leonard, Amy e Sheldon diventa una vera e propria battaglia dei sessi.

I ragazzi celebrano Halloween nel negozio di fumetti di Stuart, mentre Leonard seduce Penny con la scienza. Howard è accusato da tutti di cogliere qualsiasi occasione per parlare della sua esperienza nello spazio.

Sheldon sfida Stephen Hawking ad un gioco on-line e l'idea di poterlo considerare suo amico lo manda in estasi. Nel frattempo, all'insaputa di Leonard, Penny si iscrive ad un corso di storia al college.

Wolowitz è alle prese con il trasloco dalla casa di sua madre a quella che ha preso con sua moglie Bernadette: ad aiutarlo ci saranno Leonard e Raj. Wil Wheaton ritorna nel ruolo di se stesso, quando Sheldon lo invita ad uno speciale di Sheldon Cooper Presents: Fun With Flags (lo show che Sheldon e Amy diffondono su YouTube per insegnare vessilologia, lo studio delle bandiere) dedicato a Star Trek. Il personaggio di Jim Parsons si ritroverà però intrappolato in una discussione tra il suo amico/nemico e la sua fidanzata Amy, che non si piacciono e non fanno nulla per nasconderlo.

Raj e Howard vogliono capire come mai Sheldon ogni santo giorno, alle 2:45 del pomeriggio, scompaia per venti minuti in uno sgabuzzino nel sotterraneo del dipartimento di fisica alla Caltech. Leonard è invece geloso di Cole uno studente inglese che lavora ad un progetto per il college insieme a Penny: la ragazza si arrabbierà moltissimo con Leonard, e questo porterà ad una sorprendente rivelazione. Rivedremo infine Alex Jensen, che è ancora l’assistente di Sheldon e deciderà di provarci con Leonard.

Quando Howard si comprerà un’auto, l’università riassegnerà il posto del parcheggio di Sheldon a Wolowitz, il litigio tra i due influisce su tutti [incluse Bernadette e Amy] e Sheldon non esiterà a passare alle maniere forti: come si concluderà l’escalation di dispetti?

Amy finge di avere l'influenza per essere accudita da Sheldon, mentre Howard è costretto da Bernadette a partire per una battuta di pesca con suo padre.

Leonard organizza una serata "dungeons & dragons" a tema natalizio a cui partecipano tutti i ragazzi del gruppo. Penny, Bernadette ed Amy, arrabbiate per essere state lasciate sole, escono per una serata "solo ragazze" dove con scarso successo tentano di trovare una ragazza per Raj.

Alex chiede a Leonard di uscire una sera a cena, la cosa provoca grande entusiasmo a Leonard, rabbia e insicurezza a Penny e totale confusione a Sheldon.

Sheldon, Leonard, Raj e Howard partono alla volta di Bakersfield per partecipare al locale comic-con, ma nel bel mezzo del viaggio vengono derubati della macchina e di tutti gli oggetti personali. Nel frattempo le ragazze si appassionano ai fumetti.

Sheldon è costretto a lavorare con Barry Kripke e arriva a mettere in dubbio le sue capacità. Nel frattempo, Howard (Kunal Nayyar) e Raj (Simon Helberg) spendono mille dollari per una serie di action figures che li ritraggono.

Quando Sheldon e Leonard litigano, la cosa sconvolgerà le vite di Penny ed Amy. A causa dell’assenza di Howard, Raj è invece costretto a prendersi cura di Mrs. Wolowitz; nell’episodio, in onda stasera, ritroveremo anche Margo Harshman nel ruolo di Alex, assistente di Sheldon vista l’ultima volta qualche episodio fa.

Ii ragazzi devono trovare il regalo perfetto per le loro mogli o fidanzate. le cose non saranno facili per Sheldon, mentre Raj e Stuart organizzano alla fumetteria un party per persone sole.

Raj e' depresso perche' la ragazza conosciuta in fumetteria alla festa di san Valentino fugge nel bel mezzo del loro primo appuntamento. Sheldon viene obbligato da Amy ad assistere a uno spettacolo teatrale di Penny.

Leonard, Howard e Sheldon sono obbligati dall'università a promuovere le scienze nelle scuole medie mentre le ragazze saltano il lavoro per passare la giornata a Disneyland. Raj ha invece il primo appuntamento con Lucy, la ragazza conosciuta in fumetteria.

Howardè alle prese con il dilemma se aprire o meno una lettera di suo padre, mentre Leonard e Penny decidono di ospitare un cocktail per adulti nel loro appartamento.

Leonard, Sheldon e Raj lottano per un posto accademico all'università e lo scontro si fa ancora più duro quando vengono coinvolte anche le ragazze.

La serie Alphas viene cancellata e Sheldon non riesce a farsene una ragione. Nel frattempo Raj scopre che Lucy lo ha descritto nel suo blog come un ragazzo dai modi molto femminili.

Sheldon rintraccia l'idolo della propria infanzia, il professor Proton, conduttore di una trasmissione di esperimenti scientifici per bambini e gli chiede di organizzare uno spettacolo privato per lui e Leonard.

Complice una partita a Dungeons & Dragons, Sheldon e Amy affrontano l'argomento dei rapporti intimi nella loro relazione. Nel frattempo Raj e Lucy si scambiano il primo bacio.

Howard fa il nome di Leonard per sostituire un fisico sperimentale nella spedizione del team di Stephen Hawking nel mare del Nord per degli studi sui buchi neri e viene scelto. Questo sconvolge sia Penny, per il fatto che la spedizione durerà 4 mesi e si svolgerà su una nave, il che rende impossibile il vedersi fisicamente, sia Sheldon, che però lo è soprattutto per gelosia. Nel frattempo Raj vuole presentare Lucy ai suoi amici, quasi costringendola. Alla fine lei non si presenta all'incontro e lo lascia con un sms e Raj ne soffre molto, però quest'esperienza si rivela positiva per quanto riguarda il suo blocco con le donne. La mattina dopo, infatti, Penny va a casa sua per consolarlo e sfogarsi per la partenza di Leonard e, mentre i due piangono e Raj si auto-critica, quest'ultimo fa notare che non beve dalla sera precedente ma riesce lo stesso a parlare con Penny, e i due piangono di gioia.

Vista l’assenza di Leonard (che sta lavorando in una barca sul Mare del Nord), Sheldon e Penny sono costretti a stare insieme scambiandosi segreti intimi, mentre Wolowitz aiuta Raj a superare la rottura con Lucy.

L’amicizia tra Leonard e Sheldon viene messa alla prova e la relazione di Wolowitz con sua madre minaccia la mascolinità del giovane.

Alla Cheesecake Factory i protagonisti parlano delle cene con delitto e decidono di organizzare una caccia al tesoro. Le coppie verranno “scoppiate” e le squadre saranno formate dalla sorte dopo aver estratto i nomi da un cappello, ecco gli accoppiamenti: Sheldon e Penny, Howard e Amy, Leonard e Bernadette. A organizzare la caccia al tesoro ci pensa Raj e il tesoro è una moneta. Penny e Sheldon iniziano dal loro appartamento, il negozio di fumetti, la lavanderie, il laboratorio di geologia e finiscono nell’appartamento 4A.

Dopo aver visto I predatori dell’arca perduta insieme, Amy fa notare un errore nella trama a Sheldon: un particolare che rovina il film al fisico e per vendicarsi tenta di trovare qualcosa che possa rovinare Amy. I due, poi, guardano La casa nella prateria insieme e Sheldon non fa che farle notare i copiosi errori con l’intento di rovinarle la visione.

Amy ha l'occasione di lavorare nella stessa università di Sheldon; Howard mette in guardia l'amico dagli svantaggi che comporta avere il proprio partner come compagno di lavoro. Sheldon ne discute con Amy e il conseguente litigio coinvolge anche Howard e Bernadette.

Sheldon fa una scoperta eccezionale, ma la sua eccitazione dura pochissimo perché scopre di aver commesso un errore. Dopo che Howard scrive una canzone per celebrare l'anniversario del primo incontro con Bernadette, Penny pensa a un gesto romantico per Leonard. Per mettere in atto il suo piano romantico, Penny chiede aiuto a Raj. Sheldon dà la colpa a Amy del suo errore e le chiede di baciarla, ma è solo un sogno!

L'idolo d'infanzia di Sheldon, il professor Proton, chiede a Leonard di collaborare a una sua ricerca. Ciè ovviamente farà impazzire di gelosia Sheldon.

Leonard tenta di calmare Sheldon prima che perda la testa a causa di un errore commesso in passato che torna alla luce. Sheldon però decide di fargli vedere cosa si prova dall’altra parte. Penny, invece, incontra la ex di Raj , Lucy (la guest star Kate Micucci). Penny la vede alla Cheese Factory e va su tutte le furie e le dice perché ha lasciato Raj. Il ragazzo se la prende con Penny e scopre, poi, che Lucie ha un altro ragazzo. Sheldon fa indossare un vecchio maglione a Leonard per punirlo per non aver restituito un film noleggiato sette anni prima con la sua tessera.

Sheldon protesta quando il gruppo lo trascina a festeggiare la festa del Ringraziamento a casa della signora Wolowitz. Nel frattempo, Pennye e Leonard devono fare i conti con un errore commesso dalla ragazza nel passato. Oltre alla signora Wolfowitz (la voce di Carol Ann Susi), a casa ci sarà anche il padre di Bernadette (Casey Sander).

Will Wheaton aiuta Sheldon a fare i conti con il suo nuovo status da star, Leonard smonta la teoria dimostrata da Sheldon. Leonard e Amy aiutano Sheldon a fare i conti con l’umiliazione che prova dopo aver fallito a contribuire alla storia della scienza. Raj , intanto, deve passare una settimana a casa di Howard e Bernardette. Raj finirà nei guai per qualche consiglio di troppo.

Mentre Sheldon è in Texas per le feste di Natale, perché la sorella Missy è appena diventata mamma, tutti quanti si ritrovano a casa di Leonard per addobbare l’albero di Natale e si rendono conto di quanto sono cambiate le loro vite grazie a Sheldon. Bernardette realizza che non avrebbe mai incontrato Howard se non fosse stato per lui, Howard e Raj pensano che sarebbero diventati grassi. Mentre Penny starebbe ancora insieme a Stuart. Amy divide un cupcake con Stuart è Leonard tenta di approcciare Penny al Cheesecake Factory.

Quando il debutto di Penny in NCIS è un flop, Leonard fa fatica ad aiutarla, con il risultato che Penny fa a Leonard una domanda importante relativa alla loro relazione. Nel frattempo, Sheldon tenta di imparare a essere divertente e Raj prova a lavorare sulle sue mosse prima di parlare alle ragazze.

Sheldon tenta ti rilassarsi visto che è in vacanza. Nel frattempo, dopo aver chiarito il malinteso creato dall'impulsiva proposta di matrimonio, Penny informa Leonard di essersi licenziata dal suo lavoro di cameriera per perseguire a tempo pieno la sua carriera da attrice. Bernadette chiede aiuto a Stuart per cambiare un fumetto di Howard. Josh Peck interpreta Jesse un rivale di Stuart.

Non essendo riuscito ad aggiudicarsi i biglietti per il comic-con e rifiutandosi di acquistarli dai bagarini, Sheldon decide di dare vita ad una propria convention.

Per festeggiare San Valentino, Amy organizza una cena con Sheldon su un treno d'epoca, ma non tutto andrà secondo i suoi desideri.

Leonard decide di acquistare un tavolo da pranzo ma Sheldon, ostile a qualsiasi cambiamento, si oppone. Nel frattempo la Nasa offre ad Howard di tornare nello spazio.

Bernadette convince Howard a migliorare i suoi rapporti con Sheldon così Howard lo invita alla Nasa ad assistere ad una conferenza a cui e' stato invitato.

Di ritorno dalla Nasa, Sheldon decide di fare una visita a sorpresa a sua madre, ma la trova in compagnia di un uomo. Nel frattempo Raj coinvolge gli amici in una delle sue "cene con delitto".

Mentre Sheldon non riesce a decidere se comprare la PS4 o l'XBOX ONE, Penny si rivolge a Wil Wheaton per un consiglio professionale.

In occasione di un'uscita a quattro, Howard scopre di aver già conosciuto Emily, la ragazza che Raj frequenta. Nel frattempo Sheldon è alla ricerca di un nuovo campo di studio.

Dopo aver ripristinato l'usanza del "giovedì del tutto può accadere", Sheldon e Penny scoprono che Amy e Bernadette hanno detto loro delle bugie per poter uscire da sole.

L'improvvisa scomparsa del professor Proton mette Sheldon in uno stato di tristezza e di confusione e proprio nel giorno dello Star Wars Day.

Raj entra in crisi perché incontra Emily al cinema con un altro ragazzo. Penny viene cacciata dal set, ma entrambi gli avvenimenti sono destinati a volgere positivamente.

In questo finale della settima stagione: L'università non vuole che abbandoni la teoria delle stringhe, Leonard progetta di andare a vivere con Penny. Il negozio di fumetti ha preso fuoco: è troppo per Sheldon, che opta per una soluzione radicale.

Dopo essere stato derubato di tutto, Sheldon è costretto a chiamare Leonard per farsi aiutare visto che è bloccato in Arizona. L'amico va a prenderlo accompagnato da Amy, furiosa per non essere stata interpellata dal fidanzato, che oltretutto ha lasciato la città senza salutarla. Sheldon ammette però che non l'ha chiamata perché si vergognava del fatto di non essere stato capace di cavarsela da solo. Amy, però, gli fa capire che lo stima ugualmente, anche se non è perfetto. Nel frattempo Bernadette procura a Penny un colloquio di lavoro nella sua ditta farmaceutica come rappresentante; inizialmente le cose non vanno bene, ma poi sia Penny che l'addetto al colloquio capiscono di avere una cosa in comune: entrambi hanno paura di Bernadette, così Penny ottiene il lavoro. Intanto, nonostante la signora Wolowitz si sia ripresa, Stuart continua a vivere a casa sua, provocando grosse gelosie in Howard.

Penny e Bernadette entrano in conflitto dato che la prima non mostra particolare interesse per lo studio dei materiali che la seconda le ha fornito per il suo nuovo lavoro e quest'ultima è fin troppo assillante. Amy allora, per sentirsi al centro dell'attenzione, prende le parti di ciascuna all'oscuro dell'altra; alla fine però le due si riconciliano e studiano insieme. Nel frattempo la signora Davis informa Sheldon che l'università ha deciso di consentirgli di passare dallo studio della teoria delle stringhe a quello della materia oscura a patto che accetti la promozione a professore associato: il fisico accetta, ma a causa della sua fama nessuno si iscrive al suo corso; Howard, allora, intenzionato a prendere il dottorato come tutti i suoi amici, si candida come alunno, ma Sheldon, ritenendolo non all'altezza, lo sottopone a prove molto dure. I due si comportano male a vicenda fino a che Howard tira una pallina di carta nella bocca di Sheldon, che lo denuncia alle risorse umane, provocando la rinuncia al corso del suo unico studente.

Durante un'uscita a quattro tra Sheldon, Amy, Penny e Leonard, il primo afferma di avere con la sua ragazza una relazione molto più solida rispetto ai due fidanzati e, una volta giunti al ristorante, propone loro di verificare la profondità del loro rapporto facendo lo stesso test che hanno fatto lui ed Amy. Penny e poi Leonard, tuttavia, si rifiutano di fare il test, per poi confessarsi di essere spaventati dal matrimonio, ma di volerlo affrontare insieme. Nel frattempo Howard viene scelto dalla NASA per effettuare un lancio con i Los Angeles Angels e Bernadette si offre di aiutarlo. Dati gli scarsi risultati atletici, il ragazzo decide di effettuare il lancio sfruttando la scienza utilizzando un prototipo del Mars Rover, ma, data la lentezza del mezzo, viene deriso dall'intero stadio.

Raj presenta finalmente Emily a tutti i suoi amici ma, dopo la serata insieme, Penny ha la sensazione di non piacerle: la ragazza ammette quindi di non sopportarla in quanto ha avuto in passato un'avventura con l'astrofisico. Nonostante i tentativi di chiarimento, una volta sole ammettono di non sopportarsi. Nel frattempo i ragazzi, orfani della fumetteria di Stuart, decidono di aiutarlo a riaprire investendo i loro soldi nel nuovo negozio, diventandone anche proprietari: la cosa ovviamente eccita tantissimo i quattro; il sogno però svanisce in quanto Stuart ha già ricevuto tutti i soldi che gli servono dalla madre di Howard, il quale va su tutte le furie.

I ragazzi, una volta consci del fatto che hanno smesso di dedicarsi alle invenzioni a causa delle loro ragazze, decidono di organizzare una specie di ritiro scientifico per il weekend solo tra loro quattro, così da riprendere alcune delle ricerche che stavano portando avanti; nonostante i tentantivi di Leonard però, finiscono sempre col distrarsi guardando vecchi film e video su internet. Nel frattempo Penny, Bernadette ed Amy vanno a Las Vegas per un week end di festeggiamenti che vengono interrotti per l'ex attrice quando una comunicazione del suo capo la costringerà a passare la serata a studiare per il suo nuovo lavoro mentre le due scienziate passeranno la serata a bere e divertirsi.

Raj viene a sapere che il Governo ha finanziato un importante esperimento per rilevare la materia oscura organizzando una spedizione in una miniera; l'astrofisico propone a Sheldon di partecipare, ma, viste le difficoltà nel passare tante ore in una miniera, decidono di fare una simulazione trascorrendo del tempo nei tunnel per il vapore sotto l'università. Nel frattempo Penny e Leonard discutono per una questione di soldi, quando lei vende l'auto ricevuta in regalo dal fidanzato e vuole dargli la somma ottenuta. Decidono allora di chiedere consiglio alla coppia sposata del gruppo, salvo scoprire che i due litigano moltissimo proprio sullo stesso argomento, in quanto Howard guadagna molto meno di Bernadette

Bernadette racconta alle amiche che una rivista vuole fare un articolo sulle 50 scienziate più sexy della California e la vorrebbe tra le protagoniste, provocando il disappunto di Amy che reputa la cosa sbagliata in quanto dovrebbero essere giudicate solo per il proprio lavoro. Quando però a causa di una lettera di Amy l'articolo viene annullato, lei litiga con la sua amica scienziata che la accusa di aver fatto tutto questo per gelosia. Nel frattempo Sheldon incontra nel condominio il dottor Oliver Lorvis, un medico cliente di Penny, mentre sta portando alla ragazza dei fiori, ingannato dalle sue carinerie a scopo di vendita. Sconvolto dalla notizia viene invitato nella casa dei ragazzi, i quali fanno amicizia con lui scoprendo così che è un medico di celebrità, lavoro che nel corso degli anni gli ha permesso di accumulare molti cimeli relativi a film e serie TV. I quattro vengono invitati nel seminterrato del dottore per vederli e rimangono estasiati da tutto ciò, ma il dottor Oliver, interpretando male le parole di Sheldon, rinchiude i quattro per tornare a casa di Penny, anche se poi finisce per concentrarsi su Amy quando si mostra gentile con lui, rivelandosi come una persona che assilla qualsiasi ragazza si comporti nello stesso modo con lui.

La maggior parte dei ragazzi non ha un bel ricordo del ballo di fine anno del liceo, per cui decidono di organizzarne uno sul tetto del palazzo di Penny, Leonard e Sheldon. I due fidanzati, mentre aspettano gli altri, riflettono sul fatto che se si fossero conosciuti al liceo, Leonard non avrebbe mai trovato il coraggio di chiedere a Penny di ballare, per poi cominciare a danzare senza la musica. Sheldon, non appena vede Amy e riceve da questa un complimento, si agita e decide di non andare più alla festa: la ragazza gli chiede perché si comporti così e il fisico, allora, esprime il suo disagio dicendo che ha paura che, finito il ballo, i due saranno costretti dalle convenzioni sociali a fare sesso, ma lei lo rassicura dicendogli che vuole solo godersi il ballo; alla fine Sheldon le confessa di amarla e i due si recano alla festa. Howard, Bernadette, Raj e Emily raggiungono il ballo in limousine dando un passaggio a Stuart, il quale porta con sé Jeanie, la cugina di Howard (conosciuta tramite Debbie), con la quale l'ingegnere perse la verginità, ma questo non fa altro che accrescere l'astio dell'ingegnere nei suoi confronti. Una volta che tutti sono arrivati al ballo si fanno scattare delle foto da Raj, ma Stuart pianta in asso Jeanie quando Debbie gli telefona.

Leonard decide di sottoporsi ad un intervento per eliminare la deviazione del setto nasale, ma Sheldon si oppone essendo molto preoccupato per l'amico, che però, con un piccolo inganno, si sottopone comunque all'intervento, che riesce perfettamente. Nel frattempo i genitori di Raj, alla soglia dei quarant'anni di matrimonio, si separano e Bernadette, pensando al suo rapporto, vorrebbe che il marito le rivelasse tutto ciò che li infastidisce dell'altro per non covare per anni odio come i due indiani; Howard però, restìo a rivelare alla moglie cosa lo infastidisce, decide che sia meglio parlare di ciò che amano l'uno dell'altro, ma finiscono per rinfacciarsi le altrui mancanze e litigare.

Leonard, Howard e Raj si occupano di svuotare l'ufficio del defunto professor Abbott e, tra tutti gli appunti, trovano una bottiglia di champagne che la madre gli regalò per celebrare la sua prima scoperta; trovandola ancora chiusa dopo cinquant'anni, i tre cominciano a esaminare le ricerche per trovarne una degna di essere celebrata, ma parlando col vecchio collega di Abbott, il professor Sharpe, capiscono che egli non ha mai scoperto nulla di importante: decidono allora di usare la bottiglia per la prima grande scoperta di uno di loro. Sheldon ed Amy girano l'ultimo episodio di "Divertiamoci con le bandiere", cosa che rende il ragazzo molto triste; dopo aver pubblicato il video e aver ricevuto un commento positivo, tuttavia, il fisico decide di continuare con la serie e stappa la bottiglia di champagne solo per sentire il rumore. Penny, durante una cena organizzata dalla casa farmaceutica, rivela a Bernadette che in molti nell'azienda la temono per via del suo carattere talvolta aggressivo; la ragazza si scusa quindi con Dan e, per mantenere i benefici derivanti dalla paura instillata nei colleghi, comincia a fare le sue richieste piangendo.

Raj, a causa della presenza del padre, scosso dal divorzio, non è in grado di preparare come di consueto la cena natalizia e si offre al suo posto Amy, proponendo come tema l'età vittoriana. Sheldon, seccato dall'obbligo della ragazza di celebrare il Natale, decide di metterla in imbarazzo contravvenendo alla regola del non scambiarsi doni e facendole il più bel regalo che gli venisse in mente; il piano però fallisce quando Amy gli dona, in cambio del suo regalo, una scatola di biscotti fatti con la ricetta della nonna del fisico. Nel frattempo Howard e Leonard, impegnati in un esperimento nella camera bianca dell'università, la contaminano facendo entrare un piccione; nonostante l'aiuto di Raj, la situazione peggiora quando entra un corvo al posto del primo volatile. Non sapendo come porre rimedio, i tre, come suggerito da Penny, decidono di cancellarsi dal registro delle presenze per non assumersi la colpa.

Leonard e Sheldon vengono convinti da Penny ed Amy a fare qualcosa che piaccia alle ragazze e i quattro vanno a fare shopping. Mentre le due si provano dei vestiti, i due scienziati hanno una discussione sui compromessi che hanno dovuto fare e decidono che Leonard potrà dormire una notte la settimana a casa della fidanzata, salvo ritrovarsi Sheldon, incapace di vivere senza l'amico, sul divano di Penny. Nel frattempo Raj è molto teso perché la sonda che inviò assieme ad una squadra su Plutone nove anni prima sta per giungere a destinazione; Howard, per confortarlo, si offre di accompagnarlo al tempio induista, dove il ragazzo indiano sfoga la sua frustrazione su un anziano che colpisce con lo sportello la sua auto, ma il messaggio che la sonda si è riattivata lo fa tornare alla consueta calma.

Sheldon non riesce a fare progressi riguardo alla ricerca sulla materia oscura e arriva alla conclusione che probabilmente riuscirebbe a raggiungere risultati migliori se fosse sotto tensione: decide quindi di sottoporsi a stimoli negativi che incrementino l'ansia, ma ciò non fa altro che rendere la vita impossibile a chi gli sta intorno. Alla fine Penny e Leonard lo costringono a dormire contro la sua volontà facendolo stendere sul letto e cantandogli "Soffice Kitty". Intanto Howard ha creato un gioco, chiamato "Emily o Cannella", in cui i partecipanti devono indovinare quali frasi di Raj sono indirizzate alla fidanzata e quali alla cagnolina, solo per mettere in evidenza il fatto che lui spesso tratta Cannella come se fosse un essere umano a causa del suo eccessivo affetto nei suoi confronti; Emily, tuttavia, afferma di non sentirsi a disagio a causa di questo, ma anzi trova attraente il fatto che Raj sia così apprensivo nei riguardi della cagnolina, salvo trovarsi dei peli di cane in bocca quando lo bacia.

Durante una cena con Penny, Leonard ha un'intuizione riguardo ai superfluidi e assieme a Sheldon elabora una teoria che i due decidono di pubblicare in un forum che si occupa di teorie non ancora pubblicate: la maggior parte dei commenti è entusiasta, ma un account anonimo li sbeffeggia apertamente. Leonard e Sheldon, assieme a Raj e Howard, scoprono che il loro denigratore è Stephen Hawking, che dice loro di essere anch'egli impressionato dal loro risultato e di averli solo voluti prendere in giro per noia. Penny, Bernadette e Amy, intanto, passano la serata a prendersi in giro rivangando nel loro passato: prima vedono il film sul gorilla assassino cui ha partecipato Penny, poi il concorso di bellezza cui prese parte Bernadette e infine la fanfiction su La casa nella prateria che Amy ha scritto e pubblicato su un forum, che tuttavia alla fine le appassiona.

Sheldon scopre che Amy ha aiutato Kripke nelle sue ricerche sulla teoria delle stringhe e si arrabbia; parlandone con Penny, le rivela che Amy l'ha segretamente sottoposta ad alcuni test per vedere se fosse più intelligente delle scimmie che sta studiando. Nel frattempo Stuart riesce a riaprire il suo negozio di fumetti, ma quando Howard scopre che sua madre, oltre ad un importante aiuto economico e all'ospitalità che gli ha offerto, gli ha anche regalato alcuni mobili della casa si arrabbia. Alla fine Penny e Leonard, sottoposto da Sheldon a test simili a quelli della fidanzata, ottengono le scuse di Amy e del suo ragazzo, ma proprio in quel momento giunge una notizia terribile: la madre di Howard, in vacanza dalla sorella in Florida, è morta nel sonno. Howard e Bernadette partono subito per il funerale, mentre i loro amici e Stuart fanno un brindisi per la signora Wolowitz.

Amy parla ai ragazzi di un esperimento che ha letto, secondo il quale due persone possono innamorarsi rispondendo a varie domande personali e fissandosi negli occhi per quattro minuti consecutivi. Penny e Sheldon decidono di tentare: lei gli confida di come invidi la loro intelligenza, mentre lui di come vorrebbe riuscire a interpretare meglio le emozioni umane; le rivela inoltre che è il giorno del suo compleanno e di non averlo detto mai a nessuno perché odia le feste a sorpresa. L'esperimento non li fa innamorare ma cementa notevolmente la loro amicizia. Amy, Leonard, Raj e Emily partecipano nel frattempo ad una sorta di teatro interattivo nel quale devono risolvere degli enigmi realizzati da uno scienziato travestito da zombie, venendone a capo in soli sei minuti. Bernadette e Howard intanto si trovano all'aeroporto di ritorno dal funerale, in attesa di recuperare il bagaglio con le ceneri della madre che è stato accidentalmente smarrito. Howard si sente in colpa per non aver accompagnato la madre all'aeroporto quando glielo chiese; quando la valigia viene ritrovata, Howard promette alla madre che terrà l'urna sempre al suo fianco. La puntata si conclude con Sheldon che rientra a casa e trova i ragazzi che gli hanno preparato una festa a sorpresa.

Sheldon ed Amy decidono di prendere una tartaruga come animale domestico, ma al negozio il fisico rivela alla fidanzata di essersi proposto per una ipotetica missione di colonizzazione di Marte facendola arrabbiare per non averla interpellata; dopo aver discusso, Sheldon, per farsi perdonare, chiede ad Amy di compilare anche lei i moduli per andare su Marte. Intanto, Leonard e Penny mettono alla prova la loro passione con un gioco erotico e, dopo un disastroso primo tentativo, si ritengono infine soddisfatti. Nel frattempo Raj rimane solo in casa di Emily e comincia a curiosare in giro finché non rompe un cassetto; nonostante l'aiuto di Howard e Bernadette, viene beccato e i due litigano, salvo fare pace, anche se lei lo spaventa insinuando che nel suo armadio possa esserci qualcosa di strano.

La teoria che Sheldon e Leonard hanno elaborato qualche tempo addietro viene pubblicata su una rivista scientifica, ma il nome del secondo non appare: Sheldon tenta di spiegare che non è stata colpa sua, ma Leonard litiga lo stesso con lui perché è stufo di essere sempre messo in ombra da lui. Howard, Bernadette e Raj stanno intanto finendo di rimettere in ordine le cose della madre dell'ingegnere e, trovando il frigo completamente pieno, decidono di organizzare una cena con tutti i loro amici. Durante questa Bernadette riesce a far riappacificare Leonard e Sheldon, che scopre che anche un'altra rivista ha pubblicato la loro teoria stavolta menzionando esplicitamente Leonard.

Leonard e Sheldon si devono recare a Berkeley per tenere una conferenza sulla loro teoria sui superfluidi, ma, essendo in anticipo sul tragitto, decidono di fare una deviazione e andare allo Skywalker Ranch, la casa di George Lucas, finendo nei guai. Nel frattempo Howard e Bernadette, aiutati da Amy, Penny e Raj, decidono cosa tenere e cosa dare via dei tanti oggetti della casa del giovane ebreo dove vogliono trasferirsi dopo la morte della madre; il TARDIS del ragazzo però, che lui vuole tenere mentre la moglie dar via, provoca una discussione e la sorte dell'ingombrante oggetto verrà decisa da una sfida a ping pong. Amy risulterà la vincitrice.

Sheldon è afflitto perché non è stato invitato ad un simposio nella casa di Richard Feynman e, per consolarlo, Amy lo convince a costruire nel salotto un fortino di lenzuola, dal quale era sempre escluso dai suoi fratelli quando era piccolo. Intanto Raj, Bernadette ed Howard stanno pensando a come ristrutturare la casa dell'ingegnere, quando alla porta bussa un ragazzo, Josh, che si presenta come fratellastro di Howard, il quale scopre così che il padre si era fatto una nuova vita. Inizialmente Howard è distante e freddo con Josh, ma quando quest'ultimo mostra interesse per la sua esperienza nello spazio, inizia a legare con lui, fino a salutarlo con un abbraccio fraterno. Nel frattempo Penny partecipa ad un podcast di Wil Wheaton riguardo al film che ha fatto con lei, ma durante l'intervista Leonard scopre, con suo grande disappunto, non solo che la fidanzata guadagna molto più di lui, tanto da avere un portfolio di investimenti, ma addirittura che il regista Kevin Smith, intervenuto durante il podcast, la vuole per una parte nel suo prossimo film.

Raj viene incaricato di trovare per la NASA un possibile metodo per comunicare con forme di vita aliene e chiede aiuto ai suoi amici, escludendo tuttavia Howard e Sheldon per il loro piglio autoritario; quando lui e Leonard giungono alle stesse conclusioni degli altri due, comunque, li reintegrano nel progetto. Nel frattempo Penny chiede a Sheldon un consiglio su quale carriera (attrice o rappresentante farmaceutica) dovrebbe continuare a perseguire e quale abbandonare; decide di presentarsi al provino ricordando subito cosa odiasse del precedente lavoro e, dopo averlo fallito, decide di continuare a fare la rappresentante.

Leonard deve recarsi nel suo vecchio liceo in New Jersey a tenere il discorso per i diplomati, ma una tempesta lungo tutta la East Coast fa sì che il suo volo sia cancellato, costringendolo a rimanere a Pasadena; grazie all'intervento di Penny, però, risolve il problema tenendo il discorso via Skype. Nel frattempo Raj, dopo aver speso molti soldi per comprare un drone, riceve una telefonata dal padre, il quale, molto arrabbiato per quello che ha appena fatto, gli taglia i soldi e gli impone di vivere solo con i guadagni del suo lavoro; l'indiano, preoccupato delle conseguenze sul suo tenore di vita, chiamando prima la madre e poi il padre e giocando sulle loro rivalità conseguenti il divorzio, riesce ad ottenere anche più soldi di prima di "paghetta". Intanto Howard e Sheldon sono alle prese col drone che, non funzionando, viene smontato dall'ingegnere che riesce finalmente a far partire, anche se qualcuno col wi-fi ne prende possesso seminando il panico nell'appartamento dei fisici.

Leonard e Sheldon devono ricevere un premio e per l'occasione invitano le loro madri, le cui convinzioni personali completamente opposte finiscono per farle litigare; parlando però con l'amico del figlio, la dottoressa Hofstadter capisce che anche un'educazione che dà affetto "gratuitamente" può far crescere un figlio brillante e intelligente. Nel frattempo la contemporanea presenza di Stuart e Raj oltre al marito nella nuova casa in cui vivono ora Howard e Bernadette fa arrabbiare la ragazza perché lei deve far tutto e loro non fanno nulla e li obbliga pertanto a pulire la cucina; mentre sono intenti a pulire il giovane ebreo si rende conto che agisce con la moglie come un bambino, come cioè faceva con la madre, e decide di cambiare modo di comportarsi.

Mentre festeggiano il loro quinto anniversario, Sheldon chiede ad Amy la sua opinione sulla possibilità di cominciare a seguire la serie televisiva The Flash: la ragazza, amareggiata, si arrabbia molto e, quando il ragazzo la contatta qualche giorno dopo, lei gli chiede una pausa per valutare la loro relazione, mentre lui resta spiazzato poiché in realtà avrebbe voluto darle un anello. Penny e Leonard, intanto, proprio per via di alcune domande di Sheldon decidono di sposarsi subito: in viaggio verso Las Vegas però, il fisico confessa di aver baciato un'altra ragazza durante il periodo trascorso nel Mare del Nord, ma la ragazza, seppur ferita, lo perdona. Raj, Bernadette e Howard, intanto, falliscono nel tentativo di allontanare rispettivamente Emily e Stuart: il primo infatti non riesce a lasciare la ragazza per paura di rimanere solo, nonostante il suo lato "inquietante" lo terrorizzi; i secondi, invece, sono in difficoltà per l'attaccamento che Stuart ha dimostrato loro nel periodo di convivenza.

Leonard e Penny arrivano a Las Vegas e si sposano scegliendo il pacchetto streaming, così tutti i loro amici, a casa di Howard e Bernadette, riescono ad assistere alla cerimonia. Le cose per i neosposi però iniziano subito a complicarsi quando, in camera da letto, Penny scopre che la ragazza che Leonard baciò mentre era nella spedizione navale ora lavora con lui alla Caltech e va su tutte le furie, tanto che i due ritornano subito a Pasadena e passano la prima notte di nozze nei loro rispettivi appartamenti. Intanto Sheldon, molto turbato per la scelta di Amy nel prendersi una pausa, le fa troppe pressioni per decidere se salvare la loro storia o meno, senza lasciarle i suoi spazi; tutti i loro amici si sentono a disagio dato che il ragazzo non perde occasione per punzecchiarla davanti a loro e così alla fine, stanca del suo atteggiamento, la ragazza decide di lasciarlo definitivamente, rimarcando ancora una volta l'egoismo e l'immaturità del ragazzo. Quest'ultimo va nell'appartamento di Penny e si arrabbia con lei dopo aver saputo che era a conoscenza del fatto che la ragazza volesse lasciarlo senza aver provato a farle cambiare idea, ma lei gli dice che le aveva solo detto di essere coerente con sé stessa e che non può rimproverarla per essere stato un cattivo fidanzato. Alla fine i due scienziati si ritrovano da soli nel loro appartamento a parlar male delle donne.

Leonard è scosso per il litigio con la moglie e cerca consigli dai suoi amici, ma capisce quello che ha fatto parlando con Mandy Chow, la ragazza che ha baciato da ubriaco durante la spedizione artica, usandola come se fosse una terapista: sta inconsciamente cercando di sabotare la sua relazione perché non si ritene all'altezza di Penny. Intanto anche la ragazza parlando con le amiche, tra cui una turbata Bernadette (che sa del bacio da molto tempo e non l'ha mai confidato a Penny), comprende che anche lei sta cercando di sabotare la relazione perché teme che Leonard possa lasciarla per una ragazza più simile a lui. I due si riappacificano confidandosi queste cose e smettendo di temere di essere lasciati. Nel frattempo Sheldon cerca in tutti i modi di riprendersi Amy compiendo però gesti per farla ingelosire o arrabbiare, come mettendo on line una puntata di "Divertiamoci con le bandiere" in cui parla della loro relazione finita male.

I ragazzi decidono di partire per trascorrere un week end in Messico per l'addio al celibato di Leonard; Sheldon, all'inizio molto restio, si convince della cosa quando gli spiegano che andranno nella casa delle vacanze di Richard Feynman usando un furgoncino appartenuto allo stesso scienziato. Il viaggio si interrompe quando si fora una gomma e i ragazzi, incapaci di sostituirla, decidono di usare le loro conoscenze scientifiche, riuscendo però solo a mandare a fuoco il loro mezzo. Nel frattempo Bernadette ed Amy convincono Penny a chiamare a casa per dire ai suoi genitori del matrimonio, cosa che non aveva fatto per paura della loro reazione, che però si rivela molto tranquilla in quanto il padre usa la cosa per confessare alla figlia di aver ucciso il suo maialino. La ragazza, furiosa, obbliga Amy, a cui nel frattempo aveva fatto i buchi alle orecchie, a confessare alla madre la rottura con Sheldon; poiché Amy non ci riesce, Penny prende il suo telefono spiattellando alla madre le novità e la signora Fowler obbliga la figlia a rinchiudersi nell'armadio per espiare.

Leonard decide di trasferirsi da Penny per iniziare così a vivere insieme, suscitando in Sheldon una forte sindrome da abbandono, tanto da eliminare tutto quello che è stato portato nell'appartamento dopo il 2003, anno del trasferimento di Leonard. Dopo dei tentativi mal riusciti di cercare un nuovo coinquilino, alla fine, su invito della ragazza, Leonard torna nella vecchia stanza, decidendo di dormire solo ogni tanto a casa di Penny. Nel frattempo Stuart vorrebbe tenere un evento musicale nel negozio di fumetti per attirare più clienti e Raj ed Howard si offrono di cantare un genere folk ma con argomenti che si rifanno alle loro passioni e scrivono quindi una canzone su una lotta tra Thor e Indiana Jones.

i decidono di fare dello sport e di entrare nel circolo di scherma universitario di Kripke, che, una volta saputo che Sheldon ed Amy si sono lasciati, le chiede di uscire. Nel frattempo le ragazze vanno al negozio di fumetti per aiutare Stuart, che vorrebbe aumentare la clientela femminile. Di ritorno dalla lezione di scherma Sheldon ed Amy si incontrano per le scale e parlano del fatto che Kripke abbia chiesto alla ragazza di uscire e il fisico confessa ad Amy che ha chiesto ad altre ragazze di uscire perché ciò lo potrebbe aiutare a "passare oltre", notizia che turba molto la neuroscienziata.

Degli scienziati svedesi stanno per fare un esperimento per provare la teoria di Leonard e Sheldon, ma i due, che ovviamente non vogliono farsi superare, hanno bisogno di elio liquido, che però non possono avere a breve in quanto le loro riserve sono finite. Dopo un rifiuto di Kripke ad un prestito, decidono di seguire il consiglio di Howard e di contattare una specie di ricettatore. Nel frattempo, tutto il resto del gruppo si ritrova a casa di Howard cercando di trovare, tramite un'app che usa Stuart, un possibile partner per Amy, ma scoprono che lei già da sola è già uscita con tre diversi ragazzi, senza dire niente agli altri.

Bernadette decide di ristrutturare casa contro il parere del marito, chiedendo aiuto a suo padre Mike per i lavori. Mentre analizzano le fondamenta della casa, Mike chiede ad Howard per quale motivo non voglia avere figli, ma l'ingegnere gli dice che in realtà è la moglie ad essere restia ad avere dei bambini; questa ammette allora la verità, cioè che suo padre, quando era piccola, non faceva niente per aiutare sua madre nel crescere lei e i suoi fratelli e perciò ha paura che ciò possa ripetersi, ma suo marito le dice che è consapevole che deve lavorare di più su se stesso per essere un uomo migliore, ma che vuole avere dei figli per essere il padre affettuoso e presente che il suo invece non è mai stato; Bernadette allora gli dice che ci penserà seriamente. Nel frattempo Sheldon si fa intervistare dal figlio del defunto Leonard Nimoy, Adam, dato che idolatrava il personaggio da lui interpretato, Spock. Durante l'intervista Sheldon spiega come lo prendesse a modello per via della sua razionalità, ma soprattutto per il modo in cui non esternava mai i suoi sentimenti; successivamente il fisico fa vedere il tovagliolo autografato da Nimoy che Penny gli aveva regalato insieme all'anello di fidanzamento che non ha mai dato ad Amy. Penny è dell'opinione che lo stile di vita di Sheldon, basato sul non provare sentimenti come Spock, è insensato e che Sheldon deve imparare a esternare le sue emozioni. Questi allora va da Amy per chiederle di sposarlo, per poi vederla in compagnia di un altro uomo con il quale è uscita; affranto, torna a casa e capisce solo ora quanto sia stata assurda la sua idea di imitare un personaggio fittizio per tutto questo tempo. Leonard allora gli dice che deve imparare ad apprezzare meno i personaggi televisivi e più le persone reali.

Incuriosite da Dave, l'uomo con cui sta uscendo Amy, Bernadette convince Penny, che la raggiunge assieme a Leonard, a seguire di nascosto l'amica; la serata tuttavia si conclude con un fiasco, perché Dave, dopo aver scoperto che la ragazza stava con Sheldon, passa tutto il tempo a parlare e chiedere di quest'ultimo essendone un grande ammiratore. Nel frattempo Sheldon chiede aiuto a Raj ed Howard per trovare una nuova compagna, visto che gli avevano già trovato Amy: i tre elaborano quindi una serie di indovinelli che lasciano su un sito web apposito, in modo che la "candidata" possa dimostrare la sua intelligenza. Poco dopo la fine del tempo massimo si presenta a casa di Sheldon una splendida ragazza, Vanessa, esperta di tutto quello che piace al fisico, che tuttavia la scarta perché in ritardo.

È il giorno del ringraziamento e Bernadette, Raj ed Emily decidono di passare la giornata alla mensa dei poveri; a loro si aggiunge uno svogliatissimo Howard, che però conosce una delle persone che ammira di più, Elon Musk, anche lui impegnato in una giornata da volontario. Intanto Leonard e Penny decidono di passare questa festività da coppia sposata cucinando il tipico pranzo; durante la preparazione però il ragazzo scopre che la moglie sa pochissimo di lui, mentre il ragazzo sa tutto di lei, anche se viene fuori che lo sa perché ha letto il suo diario. Nel frattempo Sheldon, già in possesso di due biglietti per l'acquario, dove doveva passare il giorno del ringraziamento con Amy, e incapace di trovare qualcuno che lo accompagni, decide di regalare i biglietti alla ex ragazza, la quale gli propone di andarci insieme e passare la giornata come semplici amici. Dopo la giornata, piacevole per entrambi, Amy si rende conto che vuole ancora stare con Sheldon e gli chiede di tornare insieme, ma il ragazzo, memore delle sofferenze patite, le riferisce che preferisce che rimangano solo amici.

Mentre lavora con Leonard, Sheldon comincia a canticchiare un motivetto, ma non riesce a ricordarsi la canzone in questione, temendo di stare per diventare pazzo; Amy, intanto, invita Dave a cena a casa sua, nonostante il loro precedente appuntamento sia andato male, perché abbattuta dopo il rifiuto del suo ex di tornare insieme. Sheldon riesce infine a ricordarsi della canzone, Darlin' dei Beach Boys, e capisce che non riusciva a togliersela dalla testa perché gli ricorda Amy: il fisico si precipita quindi a casa sua, le dichiara il suo amore e le dà un lungo bacio. Nel frattempo Raj e Howard scoprono che un ragazzo è un fan della loro band dopo che li ha visti esibirsi al negozio di fumetti. Dopo aver seguito on line le mosse del ragazzo, Trent, i due decidono di andare a trovare il loro fan, ma scappano a gambe levate quando scoprono che si infila le dita nel naso e mangia le sue caccole.

Manca poco alla prima del nuovo film di Star Wars e i ragazzi hanno già preso i biglietti da tempo, però la data coincide col compleanno di Amy e Sheldon non sa che fare; gli appare allora in sogno Arthur Jeffries, che gli fa capire come la cosa giusta sia stare con la sua ragazza, a cui decide di regalare una maggior intimità: i due finiranno quindi per avere un rapporto sessuale per la prima volta. Nel frattempo Leonard, Howard e Raj danno il biglietto del loro amico a Wil Wheaton, che si presenta vestito da Spock per far loro capire che alla fine è solo un film e, indipendentemente dalla sua qualità, le loro vite andranno avanti lo stesso.

Penny non riesce a prendere un appuntamento lavorativo con la dottoressa Gallo, una psichiatra, e chiede a Leonard di andarci fingendosi un paziente per riuscire a vederla; il ragazzo però, parlando con la psichiatra, si trova molto a suo agio in quanto è totalmente contro le teorie della madre e gli fa capire che anche lui è importante. La dottoressa accetta infine di vedere Penny, ma solo per fare una seduta anche con lei per capire meglio il suo rapporto col marito. Intanto Raj porta Sheldon con sé al lavoro e insieme scoprono un asteroide di medie dimensioni. Nel frattempo i lavori a casa di Howard stanno per iniziare e Stuart, di sua iniziativa, decide di lasciare finalmente l'abitazione; inizialmente i due sposini sono felici, ma si ritrovano, loro malgrado, a sentire la mancanza di quello che ritenevano uno sgradito ospite.

Sheldon è stato male per via di un'influenza ed ha trattato tutti gli amici peggio del solito; gli altri ragazzi decidono quindi di organizzare un week end a Las Vegas senza di lui, che, una volta saputa la notizia, si offende molto. Amy, però, riesce a fargli capire quanto si sia comportato male con i suoi amici, che non volevano far altro che aiutarlo, e lui decide quindi di scusarsi con tutti in maniera sincera per riuscire così a partire con loro. Nello scusarsi, però, offende ancor di più Emily dicendo che in quanto dermatologa non è un vero medico; Raj, presente alla loro discussione, non prende le parti della ragazza, che se ne va arrabbiata dalla casa del giovane indiano. Alla fine però Sheldon riesce a far capire ad Emily che, per quanto possa risultare offensivo, lui non offende mai nessuno consapevolmente e, una volta ristabilita la pace nel gruppo, i ragazzi partono tutti insieme per Las Vegas.

La nonna di Sheldon, Costance Cooper, da lui chiamata "nonnina", va a fargli visita col fine di giudicare se Amy possa o meno andare bene come fidanzata per il nipote e se quindi possa essere degna del suo anello di fidanzamento; la situazione degenera quando la nonna ammette candidamente di fronte a tutti che non ritiene Amy degna di lui, soprattutto perché quando ha lasciato Sheldon lui ha sofferto enormemente. Il problema però rientra quando il ragazzo prende le parti della fidanzata ammettendo alla nonna che entrambi, da quando si conoscono, sono molto cresciuti, proprio come lei fece col nonno facendolo diventare una persona migliore. Nel frattempo Howard e Raj conoscono in fumetteria una ragazza, Claire, che quando scopre il lavoro dell'indiano gli lascia il numero perché sta scrivendo una sceneggiatura per un film di fantascienza e avrebbe bisogno di fargli alcune domande. Raj fraintende la cosa, ma, nonostante abbia una ragazza, vorrebbe vedere Claire senza dirlo ad Emily. Parlandone con Howard e Bernadette, il ragazzo capisce l'errore che sta facendo, ma, una volta scoperto che la scrittrice non è minimamente attratta da lui e che vorrebbe davvero solo un parere scientifico, acconsente a vederla, anche se nella sua mente la vede come la madre dei suoi figli.

Mancano pochi giorni a San Valentino e Raj, dopo aver conosciuto Claire, decide finalmente di lasciare Emily sperando di poter uscire con la ragazza appena conosciuta, che però rifiuta; così il ragazzo si ritrova nuovamente da solo e passerà la serata in collegamento diretto in internet con Sheldon ed Amy, che stavano trascorrendo la serata con una diretta web del loro programma "divertiamoci con le bandiere". Intanto Leonard e Penny, dopo essersene andati dal ristorante dove dovevano cenare per via di una interminabile attesa, passano la serata nel cercare qualcosa da fare che li faccia sentire ancora giovani. Nel frattempo Howard e Bernadette trascorrono la serata a casa con l'intenzione di usare il loro nuovo idromassaggio, ma i loro piani sono sconvolti dal ritrovamento di un coniglio selvatico mezzo morto in acqua. Durante le concitate fasi di salvataggio dell'animale, Bernadette ammetterà (senza però essere udita da Howard) di essere incinta.

Bernadette rivela ad Howard di essere incinta e questi, nonostante la gioia iniziale, viene assalito dai dubbi su come fare ad essere un buon padre. Il gruppo di amici, appresa la notizia, porta i futuri genitori fuori per farli rilassare e, durante la serata, Howard ha un'intuizione con cui potrebbe collaborare alla teoria di Leonard e Sheldon in modo da guadagnare abbastanza per mantenere la sua famiglia. Al termine della serata Howard e Bernadette, più sicuri di loro stessi, si dichiarano il loro amore, mentre Leonard e Penny parlano anch'essi di quando avranno dei figli.

Amy convince Sheldon a dare una festa per il suo compleanno cercando di superare i traumi subìti in passato a causa dei tremendi scherzi che in tale occasione gli amici di sua sorella gli facevano. Gli amici più cari di Sheldon, quindi, si ritrovano tutti nel suo appartamento e il fisico, nonostante un momento di difficoltà superato grazie a Penny, alla fine riesce a godersi la festa.

Leonard, Sheldon e Howard sono intenti a registrare il loro brevetto, ma vengono informati che il 75% dei profitti sarà dell'università e inoltre l'ingegnere, essendo formalmente un dipendente federale della NASA, non ha diritto a nessun guadagno. Leonard e Sheldon però decidono di dividere con lui le loro quote del progetto e di formalizzare il tutto tramite un contratto. Bernadette fa notare al marito che tutte le volte che lavora con Sheldon finisce sempre col pentirsene dato che lui è sempre irrispettoso nei suoi riguardi e quindi Penny propone di includere una clausola in virtù della quale il fisico sarà costretto a essere rispettoso nei confronti dell'amico. Sheldon accetta e inoltre, di sua iniziativa, include un'altra clausola per cui un quarto dei suoi guadagni verrà versato per un fondo per l'istruzione scolastica del figlio di Howard e Bernadette, gesto che tutto il gruppo apprezza. Nel frattempo Raj riceve da Emily un regalo che lei gli aveva comprato per San Valentino prima che si lasciassero, un sestante; inoltre la dermatologa lo chiama al cellulare e gli chiede di andarla a trovare a casa sua come amico, ma Penny gli fa capire che lo sta manipolando per tornare con lui. Mentre Raj va da Emily riceve una chiamata da Claire che gli dice che tra lei e il suo fidanzato le cose non sono andate bene e che vorrebbe uscire con Raj, ma quest'ultimo si lascia manipolare da Emily finendo a letto con lei.

Penny e Bernadette raggiungono Howard e Leonard al laboratorio dell'università e si offrono di sostituirli in un lavoretto manuale mentre i due escono per comprare del materiale; durante l'uscita vengono invitati a vedere la prima del film Suicide Squad e Howard, per fargli rabbia, invia un messaggio a Raj informandolo della cosa, non sapendo che questi ha raggiunto le due ragazze. Raj, Penny e Bernadette, quindi, si organizzano per smascherare i ragazzi, che avevano detto alle mogli di essere in ritardo perché avevano bucato una ruota, ma al loro ritorno i due dicono la verità ed escono tutti a cena. Nel frattempo Amy convince Sheldon a comprare un nuovo computer e questi le mostra il deposito in cui conserva tutte le cose che ha avuto in vita sua; la ragazza, quindi, lo aiuta a compiere il primo passo nel liberarsi dal suo attaccamento a tali oggetti.

Raj passa molto tempo con Bernadette per aiutarla perché è incinta, facendo sentire Howard a disagio; la coppia decide quindi di dire all'indiano che sta esagerando, ma se ne pentono subito e gli chiedono scusa, anche se il ragazzo continua a sentirsi fin troppo coinvolto nella gravidanza. Nel frattempo Penny propone al marito e alla terza coppia di passare il week end in una baita in montagna che una sua cliente le ha offerto, ma la situazione degenera quando, durante Never have I ever, un gioco per bere, vengono fuori dei segreti che mettono in crisi i due neo sposini; quando Leonard tenta di mettere a posto le cose scusandosi per aver nascosto alla moglie un conto segreto non fidandosi di lei dal punto di vista economico, lei gli confessa che odia il suo lavoro, ma decide di comportarsi da adulta e continuare a farlo in quanto le garantisce un ottimo stipendio.

I ragazzi si ritrovano per vedere insieme Il Trono di Spade, ma prima dell'inizio della puntata scoppiano alcune discussioni: Leonard litiga con Sheldon quando gli dice che si rifiuta di andare alla riunione trimestrale tra coinquilini, Penny col marito perché lui si lamenta quando lei non prende le sue difese e Amy col ragazzo per lo stesso motivo e Howard con Raj perché infastidito dal fatto che quest'ultimo si vanta in continuazione di uscire contemporaneamente con Emily e Claire; il gruppo allora si divide tra l'appartamento di Leonard (in cui si ritrovano questi, Amy e Howard) e quello di Penny (questa, Sheldon, Raj e Stuart). Howard, inavvertitamente, mangia del pistacchio e la reazione allergica che subisce lo fa portare d'urgenza in ospedale, dove il gruppo fa pace.

Penny vince una serata di degustazione di vini al lavoro e tutto il gruppo decide di andare, tranne Bernadette perché incinta e Sheldon perché odia il vino, così i due decidono di passare la serata insieme facendo discussioni e giochi che il fisico ama tanto. La serata del gruppo però si rivela non così piacevole per i ragazzi perché Zach, l'ex ragazzo di Penny, con le sue domande ingenue fa dubitare Leonard e Howard della loro invenzione quando fa notare che potrebbe essere usata per scopi militari e mette in crisi il rapporto tra Raj, che non vuole impegnarsi in una relazione seria, e Claire, la quale scopre che l'indiano si vede con altre ragazze.

Beverly Hofstadter va a far visita al figlio, che, non volendo incontrarla, chiede alla moglie di andarla a prendere all'aeroporto; Penny ne approfitta per legare di più con lei, ma tutti i tentativi falliscono e la suocera finisce col legare con Amy e Bernadette. Seccata da ciò, Penny si infuria con Beverly, che sorprendentemente rivela di esserci rimasta male per non essere stata invitata al loro matrimonio, così la ragazza decide di organizzare una piccola cerimonia privata per rimediare al fatto che nessuno era presente al loro matrimonio. Nel frattempo i ragazzi decidono di partecipare ad una visione di alcune scene tagliate di Avengers: Age of Ultron a cui parteciperà anche il regista Joss Whedon per rispondere ad alcune domande; non potendo partecipare per via di un appuntamento prefissato con Amy, Sheldon decide di assumere Stuart per fare alcune cose che lui non vuole compiere come andare a fare shopping con la ragazza, chiederle scusa dopo che lei si è infuriata per lo scambio, ma anche tenere il suo posto nella fila per il cinema. Tutto ciò però lo porterà a litigare con un ragazzo che salta la fila raggiungendo gli amici che gli hanno tenuto il posto.

Leonard e Penny organizzano una piccola cerimonia privata per compiacere Beverly, delusa per non essere stata invitata al loro matrimonio, e invitano anche la madre di Sheldon e il padre di Leonard, Alfred Hofstadter; la tensione nell'appartamento sale subito a causa del rapporto tra le due madri, ma aumenta ulteriormente quando arriva il padre di Leonard e incrocia lo sguardo con l'odiata ex moglie. Nel frattempo Howard e Raj stanno testando il progetto del giroscopio a persistenza infinita con esito positivo dell'esperimento e proprio in quel momento l'ingegnere riceve un'e-mail di richiesta di contatto dall'aeronautica militare degli Stati Uniti, che riguarda il progetto stesso; i due quindi iniziano a ipotizzare scenari catastrofici in cui il governo (per prendere il controllo del progetto) organizza la loro sparizione, e con questo atteggiamento paranoico si recano alla cena organizzata da Leonard e Penny in un ristorante; durante il tragitto, credendo di essere pedinati da alcuni agenti del governo in auto (che in realtà sono Leonard, Penny e Beverly), fuggono finendo per essere fermati da un poliziotto. Intanto Mary Cooper lega subito con Alfred, dato che entrambi hanno interessi in comune ed odiano Beverly, ma dopo una discussione tra i due ex sposi decidono di andare via insieme scoprendo tra l'altro di dover pernottare nello stesso hotel.

È finalmente giunto il giorno della seconda cerimonia di matrimonio di Leonard e Penny, ma i rapporti tra gli invitati sono molto tesi: il presunto rapporto tra Alfred e Mary fa andare su tutte le furie Beverly, che minaccia di andarsene dal matrimonio, mentre Susan, la madre di Penny, si vergogna per il fatto che suo figlio Randall sia appena uscito di prigione. Nel frattempo un colonnello dell'aeronautica militare si presenta a casa di Howard dicendo di voler parlare con lui.

Si avvicina il giorno dell'incontro con il colonnello dell'aeronautica militare e i ragazzi sono molto tesi, temendo che gli portino via l'invenzione e la possibilità di arricchirsi vendendola e che venga usata per scopi militari. Nonostante loro non vogliano, a causa di Sheldon e del suo orgoglio, visto che il colonnello, ingegnere del MIT come Howard, asserisce che i suoi colleghi possano fare il lavoro in 4 mesi, sono costretti ad accettare di miniaturizzare il giroscopio in soli 2 mesi. Nel frattempo Bernadette, infuriata perché tutti i suoi colleghi hanno scoperto che è incinta e questo potrebbe portarle dei rallentamenti di carriera e l'affidamento di alcuni lavori ad altri, medita vendetta con quella che pensa sia la responsabile, anche se in realtà è stata Penny.

Sheldon, Leonard e Howard si rendono conto di non poter rispettare il termine fissato con il colonnello Williams per la consegna del giroscopio ma, con loro grande sorpresa, il militare concede loro la proroga di due anni di cui hanno bisogno. Amy e Penny si recano ad una festa tenuta da Bert, un geologo amico della prima, e sebbene inizialmente si annoino in quanto sono le uniche presenti, vengono a sapere che Amy è la ragazza più popolare del campus e che Leonard viene considerato molto fortunato ad essersi sposato con Penny. Raj tenta di aiutare Bernadette con i preparativi in vista della nascita del bambino e chiede aiuto a suo padre per tranquillizzare l'amica, preoccupata dal fatto di non sentirsi minimamente interessata all'evento.

Amy deve lasciare casa sua per circa cinque settimane a causa di un problema alle tubature e così chiede a Sheldon di provare a vivere insieme nell'appartamento di Penny, che si trasferisce da Leonard; i due passeranno una nottata turbolenta ma alla fine si riappacificano. Nel frattempo Raj scopre il sesso del bambino di Howard e Bernadette ma questi, dopo varie telefonate a vuoto, decidono di non volerlo scoprire.

La convivenza tra Sheldon ed Amy prosegue a fatica, in quanto il ragazzo vuole come al solito imporre le sue abitudini, ma la ragazza non vuole cedere; dopo aver passato del tempo il primo con Penny e la seconda con Leonard, il ragazzo cede e acconsente di condividere il contenitore degli spazzolini da denti con la ragazza. Nel frattempo, a causa delle continue nausee, Howard e Bernadette rinunciano alla loro vacanza a Palm Springs e decidono di nascondersi a casa per passare del tempo da soli; la loro serata però è turbata quando prima Stuart e poi Raj, convinti che i due sposini non ci siano, entrano nella loro casa per usare la vasca idromassaggio.

Penny, invitata a un Comic-Con di basso livello per firmare autografi, mette su lo stand con Leonard, che finisce con l'intrattenere l'attenzione dei ragazzi che si fermano a chiedergli come abbia fatto a sposarla. Intanto Howard, dopo aver sentito scalciare il bambino, si mette a comprare diversi oggetti in vista della sua nascita , tra cui una costosa culla e una monovolume, salvo finire col farsi male scaricando gli acquisti. Nel frattempo Sheldon, per fare una sorpresa ad Amy che aveva mostrato interesse a riguardo, invita degli amici a pranzo, ma, visto che è la prima volta, decide di farlo come test invitando Stuart, Bert e la signora Petrescu, la rumena che abita al piano di sotto; Stuart però si offende quando capisce il perché di quella strana comitiva e decide di andarsene, ma alla fine il fisico, dopo aver chiesto scusa per averlo sempre dato per scontato, si ubriaca insieme a lui.

Sheldon scopre che Amy gli ha nascosto il fatto che il suo appartamento è pronto già da due settimane, mentre Leonard che Penny ha tolto di torno gran parte dei suoi memorabilia; i due confrontano quindi le rispettive metà e i loro amici sul da farsi: il fisico decide di rimanere a vivere con la fidanzata, mentre Leonard accetta il nuovo stile imposto dalla moglie alla loro camera da letto, pur andando a nascondere alcuni oggetti della ragazza nel suo vecchio appartamento.

Amy e Sheldon conducono insieme un esperimento basato sulla combinazione di alcune loro cellule e, notando i risultati eccellenti che ne derivano, quest'ultimo tenta di convincere la fidanzata a fare un figlio, ma inutilmente. Nel frattempo, Raj si invaghisce di Issabella, la donna delle pulizie che lavora nel suo osservatorio, e la convince a cenare insieme; quando però la donna scopre che ai suoi amici ha detto che era un'astronoma fa per andarsene, ma il ragazzo riesce a farsi perdonare e ad ottenere un vero appuntamento.

Bert, del dipartimento di geologia, viene insignito della prestigiosa borsa di studio MacArthur per i suoi studi sui microbi delle rocce causando un forte senso di invidia in Sheldon, che alla fine però capisce che deve essere felice per quello che ha. Nel frattempo Howard ritrova un giocattolo radiocomandato da lui costruito con le fattezze di Stephen Hawking, che però tutti ritengono di cattivo gusto; per questo motivo Howard decide di non farlo vedere ad Hawking, salvo poi scoprire a fine puntata che lo avrebbe invece gradito.