A Gubbio, in provincia di Perugia, un sacerdote è chiamato a ricoprire l'incarico di parroco nella Chiesa di San Giovanni. Questo sacerdote è don Matteo Minelli, che è nato in Umbria ma è stato missionario per tanti anni all'estero. Appena arrivato in città, il prete si reca dal Vescovo Guido, suo amico di vecchia data. È stato proprio Guido che lo ha scelto come successore di don Luigi, il precedente parroco morto di vecchiaia. Il Vescovo spiega a don Matteo che in una piccola città italiana bisogna imparare ad agire con discrezione, e gli raccomanda di indossare la tonaca e di non intromettersi nelle indagini effettuate dalle forze dell'ordine. Don Matteo obbedisce subito all'ordine di vestire l'abito talare, ma sa che Dio gli ha donato un intuito per mettersi al servizio del Bene.

Viene ritrovato nel fiume il cadavere di Slavkov, un profugo croato che lavorava nell'azienda dell'ingegner Galimberti. Tutto fa pensare che si tratti di un suicidio: l'uomo ha lasciato un biglietto d'addio, ma l'acqua del fiume lo ha fatto sbiadire e non si riesce a leggere quello che c'è scritto.

Don Matteo entra in chiesa e si presenta alla perpetua Natalina e al sacrestano Pippo. Poi celebra la sua prima messa nella nuova parrocchia. Il suo discorso fa riferimento agli insegnamenti di don Luigi, che lo aveva battezzato: don Matteo promette che avrà sempre la capacità di ascoltare chiunque abbia bisogno del suo aiuto. Alla celebrazione eucaristica è presente anche il maresciallo dei Carabinieri Cecchini, un uomo intelligente e di grande fede, che apprezza subito la capacità comunicativa di don Matteo. Terminata la messa, Eliana, la vedova di Slavkov, chiede a don Matteo di celebrare il funerale per suo marito e gli dice di essere disperata. Sia lei e sia Slavkov sono sempre stati cattolici convinti e suo marito non aveva nessun motivo per togliersi la vita: i due erano riusciti a fuggire dalla guerra e qui in Italia avevano trovato una nuova vita ed erano felici. Eliana teme che se davvero Slavkov si sia suicidato, la sua anima andrà all'Inferno, perché è questo che accade alle persone che si suicidano. Don Matteo le promette di scoprire la verità.

Il prete va in caserma, conosce il maresciallo Cecchini e gli fa capire che Slavkov non si è suicidato e che bisogna fare luce su questo mistero. Don Matteo vorrebbe vedere il biglietto d'addio che il morto aveva nella tasca, ma bisogna chiedere il permesso al capitano Anceschi, il comandante della caserma. Quest'ultimo non ha nessuna intenzione di prendere in considerazione l'ipotesi di don Matteo, e si rifiuta di mostrargli quel biglietto.

All'ospedale di Gubbio, il primario Anzillotti e l'anestesista Giuliani stanno effettuando un'operazione di appendicectomia su una bambina. Le possibilità di rischio si avvicinano allo zero, ma inspiegabilmente la piccola entra in coma. Mario Ricci, padre della bambina, discute furiosamente con Giuliani e lo minaccia di morte. Don Matteo assiste alla discussione perché quel giorno si trova in ospedale per la celebrazione eucaristica nella cappella. Il prete invita Ricci a calmarsi e gli chiede perché sia arrabbiato proprio con Giuliani. Ricci e sua moglie gli spiegano che hanno sentito Anzillotti rimproverare Giuliani per aver sbagliato a praticare l'anestesia.

La mattina successiva, una donna delle pulizie trova il cadavere del dottor Giuliani su una scalinata di servizio. I Carabinieri arrivano subito sul luogo del delitto: Anceschi cerca di ricostruire l'accaduto. La sera precedente c'è stata una forte pioggia, e, come confermato dal medico legale, Giuliani è morto proprio mentre pioveva: potrebbe quindi trattarsi di un incidente, ma c'è qualcosa che non quadra. Innanzitutto, sembra che la vittima si stesse dirigendo verso la sua automobile, ma non aveva in tasca le chiavi e indossava ancora il camice da medico. Vengono inoltre riscontrati segni di colluttazione: Giuliani non è caduto accidentalmente per quelle scale pericolose, ma qualcuno lo ha spinto con la forza. I sospetti ricadono subito su Mario Ricci, che ha parecchi precedenti penali, aveva minacciato di morte la vittima e non ha un alibi: dice di essere andato ad ubriacarsi ma non c'è nessuno che lo può confermare. Ricci, mentre viene arrestato, urla la sua innocenza a don Matteo che promette di aiutarlo.

Nel frattempo, Natalina ha notato che qualcuno svuota la cassetta delle offerte; si apposta in chiesa e scopre che il ladro è Nerino, un bambino di strada dalla vita molto difficile: sua madre è morta poco dopo avergli dato la vita, suo padre è in carcere per rapina a mano armata e ora vive con Elide, la sua nonna paterna, che è una signora anziana e rimbambita. Don Matteo vuole aiutarlo, e intanto indaga sull'omicidio avvenuto in ospedale.

Don Matteo sta per celebrare un matrimonio e Nerino va da lui per chiedergli aiuto: siccome la pensione di sua nonna Elide non basta più per pagare l'affitto, il bambino e l'anziana hanno ricevuto un avviso di sfratto. Il prete decide di ospitarli entrambi in canonica: Natalina inizialmente è contraria, ma poi si convince.

Quella sera una donna giovane e bellissima, di nome Lenka, viene aggredita e picchiata da alcuni malviventi, i quali si introducono furtivamente anche nel negozio di suo marito Gino Rizzato per distruggere le ceramiche e gli altri oggetti. Lenka, con la faccia sanguinante, citofona a don Matteo e gli chiede aiuto. Natalina non può chiamare un'ambulanza perché il telefono della canonica è rotto da qualche settimana e non può nemmeno chiedere aiuto ai vicini perché sono tutti al matrimonio. Don Matteo decide allora di portare Lenka in ospedale con la bicicletta, ma durante il tragitto il prete e la donna passano proprio davanti al luogo dove si sta festeggiando il matrimonio e il fotografo ne approfitta per immortalare ciò che per le malelingue è la prova di una relazione scabrosa tra un sacerdote cattolico e una donna sposata. Gino arriva in ospedale e ringrazia don Matteo per il soccorso prestato a Lenka. Il prete spiega che è necessario andare dai Carabinieri per denunciare l'aggressione, ma sia Gino e sia Lenka insistono nell'affermare che si è trattato solo di una caduta dalle scale causata dai tacchi troppo alti.

Il mattino seguente, Gino trova il negozio messo a soqquadro e le ceramiche distrutte. Il maresciallo Cecchini vuole che Rizzato venga in caserma per sporgere denuncia, ma il ceramista afferma di non conoscere il responsabile di questo atto vandalico e che certamente si è trattato di un teppista ubriaco. Cecchini invece è convinto che Gino Rizzato gli stia mentendo, ma non può costringerlo a parlare. Nel frattempo Santini, il vicedirettore della Banca Popolare di Gubbio, entra nella chiesa di San Giovanni e nota un bellissimo quadro raffigurante la Madonna, e chiede a don Matteo il permesso di portarlo a restaurare e di affidarlo a un museo. Il sacerdote, però, gli risponde che quel quadro si trova lì da tantissimi anni, ed è giusto che rimanga in chiesa. Il fotografo del matrimonio ha intanto pubblicato le foto di don Matteo che va in giro in bicicletta di sera con Lenka, e in città inizia a spargersi la voce che il prete e la donna sono amanti. Il Vescovo Guido, preoccupato, convoca il suo amico sacerdote e gli fa capire che l'unico modo per fare del bene senza cacciarsi nei guai è agire con discrezione. Don Matteo spiega che i coniugi Rizzato hanno un grave problema, ma non vogliono dire a nessuno di cosa si tratta: per questo lui sta cercando di aiutarli. Il Vescovo afferma che la gente ha ancora dei pregiudizi e si lascia condizionare dalle apparenze, e che ciò potrebbe comportare per Don Matteo delle conseguenze molto gravi.

Il prete, però, non vuole smettere di aiutare i coniugi Rizzato, anche se le falsità su lui iniziano a diffondersi. Lenka va a confessarsi da Don Matteo e gli rivela che lei e suo marito sono perseguitati dagli usurai: qualche tempo prima il loro unico figlioletto aveva bisogno di essere operato in Svizzera, ma non avevano il denaro necessario. Poiché la banca non voleva concedergli un prestito, si sono rivolti a degli strozzini, che hanno prestato loro cinquanta milioni di lire. Ora il figlio sta bene ed ha cinque anni, ma gli strozzini pretendono il pagamento di interessi elevatissimi e hanno minacciato anche di fare del male al bambino. Don Matteo vorrebbe che Gino e Lenka denunciassero gli usurai, ma i due coniugi hanno troppa paura. La gente invece si è convinta che Lenka tradisce suo marito con Don Matteo.

Anna è una giovane e bellissima albanese che vive in un campo di profughi insieme ad altri immigrati dell'Est Europa, ed è fidanzata con Francesco, un muratore italiano. Una mattina, nello stesso campo profughi, Don Matteo celebra un battesimo. I genitori hanno deciso dare al loro bambino il nome Matteo, come segno di ringraziamento al sacerdote per il prezioso aiuto che lui dà a loro e gli altri profughi. Al battesimo è invitata anche Anna, che lavora come cameriera nella villa dei ricchissimi coniugi Bernardi. Anna ha staccato dal lavoro e si sta recando alla fermata degli autobus per venire al battesimo, ma qualcuno arriva con la sua auto e la invita a salire. Nel frattempo, un'altra persona è entrata con le chiavi a casa Bernardi e ruba tutto ciò che ha un valore economico; poi rompe una finestra per far credere che il ladro non aveva le chiavi. Poco dopo, i coniugi Bernardi scoprono che c'è stato un furto in casa loro e vanno subito nella caserma dei Carabinieri per denunciare Anna. Quest'ultima è arrivata al campo con molto ritardo, e quando si siede a tavola vicino a Don Matteo e a Natalina, arrivano due malviventi con una grossa moto che le fanno cenno di venire da loro. Anna dice al sacerdote e alla perpetua che uno dei due è un suo cugino di secondo grado che ha bisogno di soldi, e va da lui. Ma in realtà quell'uomo è un malvivente violento e senza pietà, che picchia Anna perché lei non gli ha ancora consegnato cinquanta milioni di lire. Per minacciare Anna, questo delinquente le sbatte la testa contro un muro. La ragazza è sconvolta ma non rivela a nessuno ciò che le sta succedendo, e poco dopo arrivano il maresciallo Cecchini e il brigadiere Ghisoni per portarla in caserma. Lì, il capitano Anceschi le chiede cosa sa del furto avvenuto a casa Bernardi. La giovane dichiara giustamente di essere innocente, ma non spiega per quale motivo è arrivata al battesimo con più di due ore di ritardo. La mancanza di un alibi, il fatto che lei aveva le chiavi di casa e che è stata denunciata dai Bernardi, fanno di Anna la principale sospettata del furto. I Bernardi licenziano Anna in tronco, e adesso la ragazza rischia anche di perdere il permesso di soggiorno. Don Matteo allora propone a Francesco e ad Anna di sposarsi: lui è subito felice di convolare a nozze con la ragazza che ama, ma lei scoppia in lacrime e scappa via. Poco dopo, Anna spiega a don Matteo ciò che le è successo. Quando lei si trovava in Albania, il suo fidanzato di allora le ha proposto di emigrare in Italia perché lì ci sono più possibilità di trovare un lavoro. Arrivati in Umbria, il fidanzato, che è quello stesso uomo che era venuto al campo il giorno del battesimo, l'ha costretta a prostituirsi minacciando di fare del male a lei e ai suoi genitori che si trovano in Albania. Lei ha fatto la prostituta per qualche tempo, ma non potendone più di quella vita è scappata via ed ha trovato aiuto nel campo profughi. Ha conosciuto Francesco e si è innamorata di lui, ma quel malvivente l'ha rintracciata e le ha chiesto cinquanta milioni di lire, altrimenti o torna a fare la prostituta oppure lui farà uccidere i suoi genitori in Albania.

Il Vescovo invita don Matteo a cena e gli chiede di sostituire per un breve periodo don Gustavo, il cappellano del carcere, che si è ammalato. Don Matteo accetta molto volentieri, anche perché in passato era stato il cappellano di un carcere del Nuovo Messico. In prigione, il prete fa amicizia con Vanni Bertolacci, padre di Nerino, che vorrebbe ottenere la semilibertà per andare a vedere con suo figlio una partita amichevole della nazionale di calcio dell'Italia. Nerino è impaziente e non vede l'ora di poter riabbracciare suo padre. Don Matteo instaura buoni rapporti anche con alcuni altri detenuti e con il personale penitenziario, tra cui c'è anche la psicologa che si occuperà della richiesta di Bertolacci. La donna racconta a don Matteo che lì in prigione c'è un detenuto che non ha legato con nessuno e che sta sempre in disparte: si tratta di Pascetti, un uomo che sta finendo di scontare una condanna di sei mesi per ricettazione. Pascetti è stato minacciato di morte da Gaetano Serravalle, un pericoloso boss mafioso detenuto proprio nel carcere di Gubbio. Serravalle odia Pascetti perché quest'ultimo si è fidanzato con la sua ex-compagna Maria. La ragazza ha scelto liberamente di lasciare Serravalle, ma lui la considera una sua proprietà e non accetta l'idea che Pascetti le abbia chiesto di sposarlo.

Durante l'ora d'aria, mentre don Matteo sta parlando con il direttore del carcere, le guardie suonano l'allarme: è stato commesso un omicidio all'interno di una cella. Intervengono subito i carabinieri, che analizzano la scena del delitto: la vittima è proprio Gaetano Serravalle, che è stato assassinato nella sua cella con una manica di caldaia limata a tal punto da diventare un coltello. Una cosa molto strana è che, nonostante il clima sia molto freddo, la finestra è aperta.

L'unico indagato per questo delitto è Pascetti, che ha un movente e non ha un alibi valido: ha infatti detto di essere andato da solo nel locale caldaia per fare una riparazione, mentre il suo acerrimo nemico veniva ucciso. Nessuno può testimoniare in suo favore e Pascetti rischia di essere condannato all'ergastolo, ma don Matteo crede nella sua innocenza e cerca di aiutarlo.

Una notte, poco prima dell'apertura della stagione della raccolta di tartufi, qualcuno uccide con del veleno tutti i cani addestrati per cercare il tartufo. Il giorno dopo, don Matteo si sta recando in bicicletta alla chiesa di Sant'Antonio per celebrare la tradizionale benedizione degli animali; incontra Salvatore Folena che sta andando alla benedizione con il suo cane Phoenix. Folena, che è un cercatore di tartufi, offre un passaggio a don Matteo. Phoenix è l'unico cane da tartufo rimasto vivo a Gubbio. I proprietari dei cani assassinati vanno in caserma per denunciare l'accaduto al maresciallo Cecchini. Uno di loro nota subito l'assenza di Folena, e lo accusa immediatamente: se l'unico cane risparmiato da questa strage è Phoenix, significa che il colpevole è Folena. I Carabinieri interrompono la benedizione degli animali per portare Folena in caserma: lì, il sospettato viene interrogato dal capitano Anceschi. Folena si dichiara innocente ma fornisce un alibi fasullo: dice infatti che mentre quei cani venivano assassinati lui si trovava a Città di Castello per fare visita a sua madre, ma la signora non conferma la sua versione dei fatti. Anceschi gli fa capire che il fatto di cui è accusato costituisce un reato penale, anche se le vittime non sono esseri umani.

In canonica, intanto, Natalina è esasperata dalla convivenza con Nonna Elide, perché la vecchia ha l'abitudine di chiudersi a chiave in bagno senza poi riuscire ad aprire la porta. Proprio nel bel mezzo di un litigio, arriva un messo comunale che assegna a Elide e a Nerino una casa popolare, poiché che ne avevano fatto richiesta.

Folena chiede aiuto a don Matteo e gli spiega perché ha fornito un alibi falso: la notte della strage lui si trovava nel bosco a cercare tartufi, ma la stagione non era ancora aperta.

Don Matteo riceve una lettera in cui una donna gli rivela di essersi innamorata di lui. Natalina la legge e si indigna. Poco dopo il prete ascolta la confessione di Annalisa, una sua parrocchiana che è in crisi con il marito: lei si è perdutamente innamorata di un altro uomo, e per onestà lo ha rivelato al marito, il quale se ne è andato di casa. La donna, però, ha intenzione di lasciare definitivamente l'amante e di chiedere perdono al marito. Don Matteo va al vivaio in cui l'uomo lavora e cerca di convincerlo a riconciliarsi con la sua consorte, ma lui è irremovibile. Ha persino ingaggiato un investigatore privato, che tra poco saprà dirgli il nome e il cognome dell'amante di sua moglie. Il giorno dopo, Annalisa viene trovata assassinata; l'assassino ha lasciato sul cadavere una rosa antica. Il capitano Anceschi ritiene che si tratti di un delitto passionale il cui autore è proprio il marito tradito che, accecato dalla gelosia, ha ucciso sua moglie per poi metterle tra le mani una rosa che lui coltiva nel suo vivaio. Il sospettato viene arrestato, e don Matteo lo va a trovare in carcere: lui si dichiara innocente. Aveva finalmente trovato il coraggio per perdonare sua moglie, e quindi non le avrebbe mai fatto del male. Il prete gli chiede dove può trovare l'investigatore privato che stava pedinando Annalisa. Dopo averlo saputo, Don Matteo va da questo detective per capire se è in possesso di qualche informazione utile per scagionare l'innocente. L'uomo gli mostra delle foto che ritraggono Annalisa in macchina insieme ad suo collega, un insegnante di latino dal carattere un po' bizzarro. Il maresciallo Cecchini è convinto che questo professore sia proprio l'amante della vittima.

Una ragazza madre di nome Cristina sta litigando furiosamente a casa sua con un suo coetaneo: lei gli ha detto che il neonato che si trova nella culla è il loro figlioletto, ma lui non le crede e pretende di fare il test del DNA. Lei allora lo caccia via, e i vicini di casa lo vedono entrare nella sua auto con un grosso borsone. Il mattino successivo, questo ragazzo, che si chiama Francesco, va a chiedere un consiglio a don Matteo, dicendogli che non sa se quel bambino sia davvero suo figlio, ma che è indubbio che nove mesi prima della sua nascita lui e Cristina erano fidanzati. Nel frattempo, i due anziani vicini di Cristina trovano la giovane in fin di vita, e chiamano subito l'ambulanza e i Carabinieri. Qualcuno è entrato in casa della ragazza e l'ha picchiata così violentemente da mandarla in coma, e ha rapito il bambino. Francesco viene subito accusato di questi due orribili reati, ma si dichiara innocente. Don Matteo gli crede e indaga per conto suo. Dapprima chiede alla sua amica infermiera di controllare in archivio il certificato di nascita del bambino rapito; lei accetta di aiutarlo, e scopre che il piccolo non è nato nell'unico ospedale di Gubbio. I Carabinieri intanto hanno arrestato Francesco e stanno cercando il neonato; Don Matteo consiglia al maresciallo Cecchini di scoprire se Cristina ha partorito in casa. Cecchini interroga le cinque ostetriche e l'unico ostetrico uomo di Gubbio, ma nessuno dei sei ha mai fatto partorire quella ragazza. Don Matteo chiede allora al suo amico Vescovo di procurargli la lista dei neonati battezzati nell'ultimo periodo nella sua diocesi. Il Vescovo lo accontenta e nota una cosa strana: di recente una coppia di coniugi non più giovanissimi hanno fatto battezzare il loro bambino, ma il Vescovo sa per certo che quella donna non può avere figli.

Una domenica mattina, don Matteo celebra come sempre la Santa Messa; tra i fedeli c'è anche l'avvocato Cardarelli insieme alla sua anziana madre. Terminata la celebrazione eucaristica, Don Matteo chiede a Cardarelli a che punto si trova la causa civile tra Nonna Elide e un'importante compagnia assicurativa umbra. L'avvocato infatti è il rappresentante legale di Elide, il cui marito è morto qualche anno prima in un incidente stradale, e l'assicurazione non ha ancora pagato il giusto risarcimento alla vedova. Poiché questa causa dura da troppo tempo, Cardarelli dice a don Matteo di venire nel suo studio quella mattina stessa, anche se è domenica. L'avvocato prima deve riportare sua madre nella clinica in cui vive. Il prete si presenta all'appuntamento, e trova la porta dello studio legale stranamente aperta: entra e sente uno sparo. Si precipita per capire cosa è successo, e vede Cardarelli morto. A questo punto, l'assassino colpisce da dietro don Matteo con una violentissima botta in testa, che fa svenire il sacerdote. Il killer mette la pistola nelle mani di don Matteo, gli fa sparare un colpo al muro e scappa. I Carabinieri che arrivano sulla scena del delitto devono constatare che gli indizi sono contro don Matteo: il prete aveva la pistola in mano e dall'esame del guanto di paraffina risulta che è stato proprio lui a sparare. Don Matteo viene portato in caserma, dove spiega al maresciallo Cecchini e al capitano Anceschi tutto ciò che è successo. Ovviamente sia Cecchini e sia Anceschi non hanno nessun dubbio sull'assoluta innocenza di don Matteo, ma devono rispettare gli ordini del giudice: il prete viene quindi arrestato e portato in carcere con l'accusa di omicidio. Il Vescovo va subito a trovare il suo amico e gli promette di aiutarlo ad uscire di prigione; lo informa anche del fatto che il migliore avvocato della città, la dottoressa Gargani, si è offerto spontaneamente di patrocinare la difesa di don Matteo. Quest'ultimo in carcere incontra Vanni Bertolacci, padre di Nerino, ed ha come compagno di cella un malvivente soprannominato cimicetto, che è stato condannato all'ergastolo per aver ucciso una guardia giurata durante una rapina a mano armata. Cimicetto continua a dichiararsi innocente, ma nessuno degli altri detenuti gli crede; l'uomo racconta a don Matteo di essere stato condannato ingiustamente proprio per colpa dell'avvocato Gargani.

Don Matteo assiste ad un processo tra il contadino Cingolani, patrocinato da una giovane avvocatessa ambientalista, e l'ingegnere Carlo De Francesco. Cingolani ha accusato De Francesco di inquinargli sistematicamente la terra e le acque della sua proprietà con gli scarichi tossici della sua fabbrica, ma le prova prodotta dalla rappresentante legale di Cingolani non può essere ritenuta valida per un vizio di forma: ne consegue che De Francesco viene prosciolto dall'accusa. Il contadino vorrebbe farsi giustizia da solo, ma don Matteo gli fa capire che il male non si può contrastare con altro male.

L'ingegner De Francesco è sposato e ha un figlio della stessa età di Nerino; nonostante questo, da qualche tempo ha avviato una relazione extra-coniugale con una sua giovane e avvenente dipendente. Qualcuno gli invia a casa una busta con dentro delle foto che ritraggono lui che si bacia con la sua amante: si tratta di un ricatto. Infatti, poco dopo la persona che ha spedito quella busta fa una telefonata anonima a De Francesco, e, con una voce contraffatta, gli dice che se non smette di inquinare l'ambiente con i rifiuti tossici della sua fabbrica, quelle foto compromettenti saranno inviate a sua moglie: l'unico modo per salvare il suo matrimonio e la sua reputazione è quindi quello di chiudere gli scarichi della fabbrica. L'ingegnere è preoccupato delle possibili conseguenze di questo ricatto, e chiede aiuto al suo avvocato personale. Quest'ultimo si mette in contatto con qualche pezzo grosso dell'Arma dei Carabinieri, per fare in modo che il capitano Anceschi svolga un'indagine con la massima discrezione e riservatezza: così il ricattatore sarà arrestato, e la moglie del ricattato non verrà a sapere nulla. Anceschi riceve queste disposizioni ma sa che è impossibile smascherare l'autore del ricatto senza applicare la normale procedura, e quindi incarica il maresciallo Cecchini di dirigere l'indagine.

Marco, il figlio di De Francesco viene aggredito da tre bulli mentre si sta recando a lezione di violino: Nerino, che passava di lì per caso, interviene in difesa del bambino ed ha una colluttazione con quei tre delinquenti, che gli fanno anche uscire il sangue ma poi sono costretti a scappare. Marco dapprima è dispiaciuto perché il suo violino si è rotto, ma poi si rende conto della bravura e del coraggio di Nerino, e tra i due bambini nasce una sincera amicizia.

Con l'aiuto di don Matteo, il maresciallo Cecchini cerca di scoprire questo caso di ricatto, con la speranza di ottenere la tanto sospirata promozione. I sospetti ricadono inizialmente su Cingolani, che è quello trarrà più benefici dalla chiusura degli scarichi. È indiziata anche l'avvocatessa che aveva rappresentato il contadino al processo: lei infatti è una convinta ecologista, e per il bene dell'ambiente potrebbe aver deciso di fare chiudere gli scarichi con un ricatto. Don Matteo però sostiene l'innocenza di entrambi: Cingolani non avrebbe mai speso dei soldi per scattare le foto, svilupparle e falsificare la voce, mentre il suo avvocato non sapeva nemmeno che De Francesco avesse una relazione extra-coniugale, e in ogni caso non farebbe mai qualche cosa che sia in contrasto con la Legge.

Una troupe cinematografica romana si trova a Gubbio per effettuare le riprese di un film d'azione con un altissimo tasso di violenza. Una efferata scena con il protagonista Manuel Donato deve essere girata proprio nella chiesa San Giovanni, ma don Matteo proibisce ciò agli attori e ai cineasti. Infatti, quando gli avevano chiesto il permesso, loro avevano fornito al parroco una sceneggiatura diversa da quella del film che stanno girando. L'attore Manuel Donato, che interpreta un sacerdote cattolico, si adira del fatto di non poter girare in chiesa e tratta male suo fratello Giovanni, che fa parte del cast. Giovanni propone di girare nel piazzale antistante la chiesa, perché lì, essendo suolo pubblico, nessuno avrà nulla da ridire. Pippo ha una videocamera e la vuole utilizzare per immortalare Lucia, la moglie di Manuel Donato, anche lei attrice, che fa parte del cast del film. Il maresciallo Cecchini va al bar di Vincenzo, un uomo di origine toscana. Vincenzo è contento perché sua moglie Maura è stata ingaggiata dai produttori del film come aiuto-costumista, ma non sa che Manuel Donato e Maura hanno una relazione extra-coniugale. Per un'altra scena di inaudita violenza, anche Vincenzo viene ingaggiato come comparsa: dovrà sparare con una carabina caricata a salve nella direzione di Manuel Donato, proprio come faranno gli altri figuranti. Prima del ciak, Nerino si impossessa di una delle armi caricate a salve e si nasconde nel campanile. Il regista fa partire l'azione, e tutti i figuranti cominciano a sparare. Anche Nerino, per gioco, preme il grilletto, e Manuel Donato cade a terra sanguinante: qualcuna delle carabine non era caricata a salve, e l'attore muore dopo essere stato colpito da un colpo al cuore. I Carabinieri iniziano subito le indagini e interrogano tutti i figuranti; tra questi, l'unico ad avere un buon movente è Vincenzo. Il capitano Anceschi, durante l'interrogatorio, gli chiede se è stato lui ad uccidere l'attore perché aveva una relazione sessuale con sua moglie Maura. Il sospettato, però, non sapeva che sua moglie lo tradisse, e adesso è sconvolto dalla notizia e decide di confessare di aver commesso questo delitto, pur essendo assolutamente innocente. Oltre alla confessione, si aggiunge il fatto che dall'esame balistico risulta che la traiettoria del colpo di carabina che ha ucciso Manuel Donato è compatibile con la posizione in cui si trovava Vincenzo al momento dell'omicidio. Sia don Matteo e sia il capitano Anceschi ritengono che Vincenzo abbia confessato solo per salvare il cosiddetto onore.

Siamo a dicembre, e don Matteo si trova in uno dei due autobus per il viaggio di ritorno da una gita parrocchiale. Il prete informa i passeggeri che il Vescovo gli ha chiesto di organizzare un coro per la Santa Messa di Natale, e chi vuole partecipare dovrà venire in chiesa per le audizioni e le prove. I fedeli gli chiedono di fare già lì in pullman una prima prova. Nel frattempo, l'autobus che si trova davanti a loro frena bruscamente e fa un incidente. L'autista che lo guidava è un ex-alcolista, che viene portato all'ospedale insieme agli altri feriti. Per fortuna non c'è stata nessuna vittima, ma dalle analisi del sangue risulta che l'autista aveva bevuto talmente tanto alcool da renderlo completamente ubriaco. L'uomo viene quindi fermato dai Carabinieri, ma dice a don Matteo di non aver bevuto nemmeno un goccio. Don Matteo gli crede e inizia ad indagare, e per cercare di dimostrare l'innocenza del sospettato dedica poco tempo al coro di Natale. Per questo motivo, il Vescovo lo esorta a sbrigarsi perché il 25 dicembre si avvicina. Il Vicario Giovanni Della Valle è convinto che don Matteo non riuscirà a preparare un coro in così poco tempo, ma il prete promette di mantenere la parola.

Francesco Verra, un ricercatore universitario di ventinove anni, viene assassinato all'interno dell'università di Gubbio. Il medico legale spiega ai Carabinieri che Verra è morto per sfondamento del cranio, e che probabilmente l'arma del delitto è una catena. Il maresciallo Cecchini fa sequestrare tutte le catene dei motorini parcheggiati vicino alla facoltà. Una anziana vedova chiede a don Matteo di informarsi su come effettuare una donazione per la ricerca universitaria, e il prete va in facoltà e parla con il professor Mandini, che vuole subito sapere l'importo preciso della donazione. Don Matteo vorrebbe tornare a casa, ma una ruota della sua bici si è bucata, e Riccardo Di Salvo, un altro ricercatore universitario, si offre di accompagnarlo con il motorino. Prima di andare, Riccardo saluta Roberta, la sua fidanzata, una studentessa di medicina a cui mancano pochi esami alla laurea. Riccardo Di Salvo e don Matteo percorrono in motorino il tratto tra la facoltà e la canonica, anche se è proibito andare in due in motorino senza casco. Prima di arrivare, una pattuglia dei Carabinieri li ferma e Di Salvo viene arrestato. Ovviamente il motivo dell'arresto non è quella piccola infrazione: il maresciallo Cecchini rivela a don Matteo che sulla catena del motorino di Riccardo sono state trovate tracce di sangue dello stesso gruppo di Verra. Oltre a questa prova indiziaria, c'è anche il movente: la vittima si era impadronita di una ricerca di Di Salvo spacciandola per sua, e tra breve avrebbe ottenuto la promozione a professore associato. Riccardo si dichiara completamente estraneo all'omicidio, e don Matteo gli promette di aiutarlo a dimostrare la sua innocenza. Roberta sa che alla facoltà di medicina il professor Mandini e il suo assistente Fanti gestiscono un traffico illecito di compravendite di esami, e che Verra ne era al corrente.

Libero Ferrini, un ex-partigiano di settantadue anni, muore vicino a una cabina telefonica. Grazie all'aiuto economico della contessa Elena Lombardi Satriani e di suo figlio Ottavio, don Matteo ha potuto riaprire il cinema parrocchiale; Ottavio, però, dimostra di avere una mentalità ottusa criticando la scelta di un film che racconta una storia d'amore tra due anziani. Elena ha saputo della morte di Libero Ferrini, e decide di accollarsi tutte le spese per le onoranze funebri, ma chiede a don Matteo la massima riservatezza sul suo interessamento. Anche il Vescovo Guido partecipa al funerale di Ferrini, perché quest'ultimo gli aveva salvato la vita durante la seconda guerra mondiale: quando un soldato nazista stava per assassinare il soldato italiano Guido, Ferrini si avventò contro il nazista e gli diede un morso fortissimo. Per via di questa sua abilità nel mordere i nemici, Libero Ferrini veniva soprannominato "il lupo".

Dall'autopsia risulta che Ferrini non è morto per cause naturali, ma che ha lottato contro qualcuno prima di sbattere mortalmente la testa. Ferrini era ospite della casa di riposo "Villa Margherita", ma aveva un carattere arzillo e ribelle. Il capitano Anceschi chiede a don Matteo se è stata proprio la contessa Elena Lombardi Satriani, vedova da qualche anno, a pagare il funerale, e il prete non può fare altro che confermare.

Elena e Libero infatti, avevano una relazione sentimentale da quando lui, qualche settimana prima, era tornato in Italia dalla Nuova Zelanda, dove era stato emigrante per mezzo secolo. I due si erano conosciuti durante la guerra, ma lei non ha mai tradito suo marito: ora che Elena è vedova, Ferrini voleva sposarla, ma Ottavio era assolutamente contrario al loro rapporto perché, secondo lui, una contessa non può innamorarsi di un vecchio che vive in un ospizio. I Carabinieri credono che il colpevole sia proprio Ottavio. Alla casa di riposo "Villa Margherita", don Matteo nota che il direttore non tratta bene gli anziani e che la stanza di Libero Ferrini è stata riverniciata in tutta fretta. Ottavio si dichiara innocente e chiede aiuto a don Matteo.

La contessa Ravelli ha organizzato un'asta in cui mette in vendita i suoi beni per liberarsi dei debiti. L'oggetto più prezioso è un diamante chiamato "il fuoco della passione" perché si diceva che avesse il potere di fare nascere l'amore tra i coniugi che si sposano in un matrimonio combinato. Durante l'asta, però, il fuoco della passione viene ritirato con la scusa che la contessa non vuole sbarazzarsene. In realtà, la Ravelli vende clandestinamente il diamante all'ingegnere Morabito, il quale la paga in contanti ma le raccomanda di non rivelare a nessuno di questa compravendita.

Morabito è sposato da molti anni con Clara, una casalinga intelligente e sensibile. Clara vuole aiutare don Matteo a organizzare un'asta di beneficenza, in cui verranno venduti oggetti donati dai parrocchiani, e il ricavato andrà alle famiglie più povere dell'Umbria. La donna decide di portare all'asta anche una gondola in miniatura, non sapendo che proprio dentro quell'oggetto suo marito ha nascosto il fuoco della passione. Si svolge l'asta di beneficenza: Nerino e Pippo, con la macchina da scrivere, fanno l'elenco degli oggetti venduti. Tra le altre cose ci sono tre gondole in miniatura: una viene venduta a un collezionista, una a Natalina e l'altra a Rosina, un'anziana amica di Nonna Elide.

Morabito ha una giovane amante e vuole rivendere il fuoco della passione per andare a vivere all'estero insieme a lei, ma quando Clara gli dice di aver dato via la gondola per l'asta di beneficenza, lui va su tutte le furie e chiede di sapere chi l'ha comprata. La moglie gli spiega che le gondole all'asta erano tre, e che probabilmente la sua è stata acquistata da Rosina. L'ingegnere vorrebbe ricomprare quella gondola da Rosina, ma la vecchia non vuole sentire ragioni. Il giorno successivo, qualcuno si introduce in casa di Rosina, la uccide con una fortissima botta in testa e cerca il diamante nella gondola.

Maiori, un brigadiere dei Carabinieri, si è infiltrato in un traffico di droga, e per guadagnarsi la fiducia dei malviventi ha preso un pacchetto di cocaina dal deposito e ora si reca all'appuntamento per consegnarla. Don Matteo, trovandosi a passare proprio nella zona dove dovrebbe avvenire lo scambio, vede che i due delinquenti stanno pestando a sangue Maiori: il prete interviene per fermare l'aggressione, ma riceve un pugno e riesce a mettere in fuga i due spacciatori. Maiori viene subito portato all'ospedale, e al reparto di rianimazione i medici riescono a salvarlo. Il maresciallo Cecchini ringrazia don Matteo per aver salvato la vita a Maiori, e gli spiega che soltanto quattro uomini erano al corrente del fatto che si era infiltrato: lo stesso Cecchini, il capitano Anceschi, Ghisoni e Lauro. Uno dei quattro è un corrotto e rivelato ai trafficanti la vera identità di Maiori. Anceschi si trova in missione fuori Umbria, e Cecchini non ha alcun dubbio sulla sua innocenza: il maresciallo non vuole credere nemmeno che Ghisoni o Lauro possano aver fatto una cosa del genere, e chiede a don Matteo di aiutarlo in questa delicata indagine. I due iniziano a pedinare Antonio Lauro, il quale si reca nella villa dei Lattanzi, una famiglia che qualche anno prima è stata coinvolta in un caso di droga. In realtà Lauro non è affatto un corrotto, ma è soltanto innamorato di Francesca, la moglie di Lattanzi. Don Matteo e Cecchini pedinano anche Ghisoni, e scoprono che il ragazzo è proprietario di una costosissima automobile sportiva: nemmeno Ghisoni è corrotto, perché l'auto è stata acquistata con i soldi di una regolare vincita al superenalotto. La droga del deposito viene fatta esaminare, e si scopre che qualcuno l'ha sostituita con del bicarbonato: i due malviventi volevano quindi uccidere Maiori non perché avevano scoperto la sua identità, ma perché avevano creduto che volesse imbrogliarli. Ne consegue che la talpa potrebbe essere chiunque tra i carabinieri della caserma di Gubbio, perché tutti loro possono accedere al deposito.

Nerino mangia di nascosto una fetta della torta di mele che Natalina ha preparato per il compleanno di don Matteo. Poco dopo, il ragazzino si sente male e viene portato subito all'ospedale, dove arrivano altri eugubini che, come Nerino, hanno avuto un'intossicazione alimentare. Il capitano Anceschi e il maresciallo Cecchini scoprono che tutti i casi di intossicazione sono stati causati dalle mele avvelenate dei Di Giacomo, due coniugi che vendono al mercato i loro prodotti di agricoltura biologica. Entrambi si dichiarano innocenti e affermano di non sapere chi può essere stato a irrorare una quantità di antiparassitario di gran lunga superiore a quella consentita dalla Legge. La figlioletta dei due va a stare da don Matteo in attesa che i Carabinieri risolvano il caso.

Marisa è la proprietaria di un negozio di tatuaggi che si trova nel centro storico di Gubbio, vicino a un bar e a un negozio di ceramiche. Una mattina un ex-detenuto va a trovare Marisa: i due sono stati fidanzati e hanno avuto problemi con la droga. La giovane non crede che lui si sia del tutto disintossicato e lo manda via. Il ceramista che si trova lì vicino osserva la scena.

Quella sera, don Matteo assiste alla partita di calcio di una squadra dilettantistica eugubina, e aiuta un calciatore a fare bella figura. Dopo la partita, il calciatore se ne va insieme ad alcuni suoi compagni, e con loro fa uso di eroina; nella notte, lui e altri giovani drogati della zona muoiono perché l'eroina è tagliata male. I Carabinieri devono scoprire al più presto chi ha spacciato quella droga. Marisa viveva a Roma quando era tossicodipendente, e con il negozio di tatuaggi ha ricominciato una nuova vita. In caserma arriva una telefonata anonima in cui si dice che Marisa è una spacciatrice. I Carabinieri perquisiscono il negozio e trovano una grossa quantità di eroina. La ragazza viene arrestata, ma don Matteo crede nella sua innocenza e indaga.

Il signor Nico Caronna viene trovato in un giardino di una villa a fianco di un cadavere e la vittima è il marito della proprietaria della casa. Delle indagini si occupa soltanto il Maresciallo Cecchini, in quanto il Capitano Anceschi conosce Giulia e sarebbe, dunque, troppo coinvolto. Però Anceschi risulterà essere implicato nell'omicidio, quindi don Matteo aiuterà Cecchini a smascherare il vero colpevole.

A Gubbio arriva il mago Kaspar, un ciarlatano che è stato denunciato più volte per truffa e mai condannato. Una donna di mezza età si suicida nel suo appartamento lasciando aperto il gas, e due fratelli litigano perché uno di loro ha investito tutti i risparmi della famiglia per seguire le costose indicazioni di Kaspar, e l'altro lo ha picchiato perché l'investimento si è rivelato fallimentare. Il capitano Anceschi vorrebbe arrestare Kaspar ma non ha nessuna prova. Monica, una giovane parrocchiana di don Matteo, va a fare un controllo medico e scopre di essere malata di leucemia; la ragazza si isola da tutto e rifiuta il sostegno degli amici e di suo marito. Monica va dal mago Kaspar, il quale le dona uno dei suoi amuleti, impone le mani su di lei e recita delle frasi sconnesse. La donna va di nuovo a fare gli esami clinici, e la leucemia è completamente sparita. In città allora molti iniziano a credere che il mago Kaspar abbia davvero dei poteri magici; Monica inizia a trascorrere molto tempo con Kaspar e gli regala dei soldi. Tra i clienti del mago c'è anche Natalina, desiderosa di trovare un fidanzato. I Carabinieri sequestrano gli amuleti di Kaspar; don Matteo ricorda di averne visto uno nella casa della donna che si è suicidata.

Astice blu è la rivista gastronomica più famosa e importante d'Italia, che assegna ai migliori chef i "cinque astici", vale a dire il punteggio massimo. A Gubbio viene organizzato un pranzo di beneficenza cucinato dai cuochi contrassegnati con cinque astici.

I fratelli Bagnetti hanno un ristorante in un edificio di proprietà del fondatore ed editore di Astice blu. L'uomo non vuole rinnovare il contratto di affitto e comunica ai due che dovranno lasciare libero il locale. I Bagnetti urlano la loro rabbia al proprietario, mentre lui è al telefono con il suo avvocato. Poco dopo, qualcuno lo uccide.

Don Matteo e Natalina vedono che i fratelli Bagnetti stanno picchiando selvaggiamente Gerolamo, un barbone simpatico e un po' svampito. Il prete e la perpetua riescono a fermare l'aggressione e portano il senzatetto all'ospedale.

I fratelli Bagnetti vengono accusati dell'omicidio, ma Gerolamo dice di aver visto una donna commettere il delitto. Interrogato dai Carabinieri, il senzatetto afferma che la colpevole è Mordelli, una chef che ha cinque astici.

Il maresciallo Cecchini ha appena compiuto quarantasei anni ed è un po' dispiaciuto perché la promozione non è ancora arrivata; a casa sua, intanto, c'è una squadra di operai che sta ristrutturando una parte dell'appartamento. Uno degli operai fa di cognome Facciolla, è di origini pugliesi e sta organizzando un piano per incastrare Cecchini: potendo entrare in casa sua come operaio senza insospettire nessuno, nasconde una busta piena di soldi e fa alcune telefonate con il suo cellulare.

Il capitano Anceschi ha saputo che tra poco arriverà un colonnello in visita ufficiale in caserma, e dopodiché sarà la volta di un generale; Anceschi raccomanda ai suoi di non fare brutte figure. Cecchini ha ricominciato a fumare, ma, siccome non vuole dirlo alla moglie Caterina, la sera esce di nascosto per comprare le sigarette. Proprio all'uscita della tabaccheria il maresciallo cade nella trappola ordita da Facciolla: una ragazza macedone urla dentro la sua auto, Cecchini entra in quella macchina pur non sapendo chi sia la proprietaria. Quest'ultima dice di essere una prostituta e di essere disperata a causa dei soprusi subiti dai protettori; dice anche di volersi suicidare. Mentre Nino cerca di convincerla ad andare in caserma per sporgere denuncia, Facciolla fa una telefonata anonima al 112 e detta la targa di un'automobile che contiene della droga. L'automobile è la stessa in cui si trovano Nino e la macedone: i Carabinieri li fermano entrambi e li conducono in caserma.

Cecchini racconta la verità, mentre la ragazza afferma che Cecchini controlla un traffico di droga e un giro di prostituzione minorile. Ovviamente don Matteo e il capitano Anceschi non dubitano dell'onestà di Nino, ma le prove fabbricate da Facciolla sembrano dimostrare che ciò che dice la ragazza è vero.

Durante una gita gratuita a Gubbio organizzata da Costantino Pallotta, sua zia, Annarita Cepponi viene drammaticamente uccisa gettata in un burrone. Gli inquirenti pensano che ad ucciderla sia stato il nipote, essendo stato visto poco prima litigare con quest'ultima. Cecchini infatti lo aveva anche visto mentre, dopo la morte della zia, tornava sul pullman e ritirava tre assegni da 20 milioni di lire dalla borsa della signora Cepponi. Le indagini più tardi subiscono delle svolte. Il capitano Anceschi e il maresciallo Cecchini sono fermamente convinti che un ipotetico colpevole potrebbe essere anche Bartolo Ferri, che frequentava da anni la donna ma lei non aveva mai ricambiato i suoi sentimenti, perché voleva essere una donna libera senza "impegni coniugali". Don Matteo diventa amico di uno dei pensionati della gita: Giovanni Trinchero , un uomo che a prima vista sembra scontento di vivere, ma che sembra nascondere anche un gran segreto. Don Matteo l'aveva aiutato a prendere la sua medicina dopo un attacco di asma. Trinchero sembra contento di fare amicizia con Don Matteo; scoprono anche di avere stesso gusti letterari. Amano Leopardi. Nerino, giocando coi suoi amici, trova un anello in cui è scritto "Annarita, sol di te m'appago". Don Matteo ricorda che quella citazione è presa dal Canto X di Giacomo Leopardi (vv. 101-103):

"Spira nel pensier mio la bella imago,

Da cui, se non celeste, altro diletto

Giammai non ebbi, e sol di lei m'appago."

Troveranno infatti Trinchero che stava per buttarsi nello stesso burrone in cui egli aveva spinto la sua amata Annarita. E questo spiegherà che da tanti mesi lui la corteggiava senza essere ricambiato. L'episodio termina con una simpatica scenetta in cui Cecchini dà a Nerino come "ricompensa" un anello da regalare alla sua Lalla, che però non ha lo stesso valore di quello che aveva trovato. Nerino risponderà che lui non ha una fidanzata e sarà Natalina a prenderlo!

Durante un allenamento di boxe, Luca, un giovane promettente, cade a terra e muore, apparentemente a causa di un colpo infertogli dal suo allenatore, Luciano Vitri.

Un famoso uomo d'affari della zona viene rapito e i carabinieri sembrano essere sulla strada giusta ed arrestano un impiegato del rapito. Mentre il figlio prende in mano le redini dell'azienda del padre, don Matteo scopre che sono molti gli impiegati che hanno cattive intenzioni.

Un immigrato di nome Tarek vorrebbe organizzare un matrimonio al figlio secondo le tradizioni del loro paese. Ma questi non sembra molto d'accordo e quindi per evitare lo sposalizio, Mohammed commette un furto. Però per un episodio di violenza viene indagato il fratello Abdul e don Matteo e i carabinieri iniziano a indagare.

Sergio viene investito da un'automobile e allora la sua fidanzata Angela, ne piange la morte, ma decide di ricominciare una nuova vita ed entrerà nella banda musicale del paese. Ma qualcuno che non vuole che resti in città le spedisce delle lettere minatorie. Le indagini dei carabinieri conducono ad un giovane che sembra essere anche coinvolto nell'incidente, ma come sempre sarà l'acutezza investigativa di don Matteo a risolvere il caso.

Durante una processione religiosa, il signor Bruno Lippi viene morso da un serpente. Per salvare la vita dell'uomo, serve un particolare antidoto molto difficile da trovare perché il serpente appartiene ad una rara specie asiatica. Quando i carabinieri indagano sull'uomo che avrebbe potuto introdurre tale specie in Italia, e tutto questo porta ad un uomo di origine orientale, che era accanto a Lippi durante la processione.

Nerino mentre passaggia nei boschi con don Matteo cade in una buca e scopre un'antica tomba etrusca, con dei tesori dell'epoca. Quando giungono i carabinieri il tesoro sembra essere sparito. I sospetti ricadono su un tombarolo che in passato era già stato protagonista di furti del genere.

In città scoppia un incendio e il colpevole sembra essere Fabio, un ragazzino che ammette subito la sua colpa. Ma suo padre, totalmente convinto della sua innocenza, chiede aiuto immediatamente a don Matteo.

La squadra di pallavolo di Gubbio vince il campionato ma durante i festeggiamenti, Varoli, presidente ed allenatore del team, viene trovato morto. L'indiziata principale sembra essere Vivana, un'ex giocatrice della squadra, in quanto a causa di un incidente causato da Varoli, è ora costretta a muoversi sulla sedia a rotelle. Don Matteo conoscendo molto bene la ragazza, proverà la sua innocenza.

Una giovane donna viene uccisa nella sua casa e Natalina sembra poter essere d'aiuto alle indagini dell'omicidio. Ha infatti testimoniato di aver visto Giovanni Antonelli fuggire dalla casa dell'omicidio; l'uomo ammette di avere una relazione con la donna, ma si rifiuta di proclamarsi colpevole per il delitto. Successivamente in seguito a degli sviluppi, le indagini si sposteranno sull'azienda del fidanzato ufficiale della vittima.

Nel cementificio diretto da Ontani viene trovato il cadavere di un giovane operaio. I Carabinieri iniziano subito le indagini: la vittima era fidanzato con la figlia di un suo collega, ma l'aveva lasciata quando già avevano deciso di sposarsi. Il padre della ragazza non ha mai accettato il suo comportamento e lo ha più volte minacciato: per questo viene iscritto nel registro degli indagati. Dall'autopsia emerge che il giovane è morto per avvelenamento da cianuro, e che poi è stato trasportato nella fabbrica; qualche giorno prima di morire, la vittima aveva avuto una colluttazione con il cognato di Ontani, da poco tornato dalla Gran Bretagna per prendere possesso dell'azienda. Ontani, infatti, iniziò a lavorare come operaio, poi si innamorò di Maria Grazia, la figlia del proprietario, la sposò e venne nominato direttore. Il fratello di Maria Grazia ha vissuto all'estero per tanti anni, ma ora vuole cacciare via il cognato e dirigere il cementificio. Maria Grazia adesso è un alcolista depressa che fa uso di psicofarmaci, ed era l'amante della vittima.

Un imprenditore agricolo, proprietario di un maneggio, si trova in difficoltà economiche, e decide di vendere i cavalli e tutta la proprietà. Qualcuno appicca un incendio per dar fuoco alla macchina del proprietario del maneggio, ma, per sbaglio, o volutamente, l'incendio si allarga, finendo per bruciare le stalle. Tre cavalli in fin di vita vengono uccisi. I Carabinieri sospettano del proprietario del maneggio, e di un cameriere. Nel frattempo il maresciallo Cecchini trova due minuscoli gattini, mentre Nerino diventa amico di un bambino del maneggio, che gli regala un uovo d'anatra. Don Matteo cerca di fare luce sul caso.

Lodovico Pancrazi è uno scrittore di libri gialli sposato con Cinzia, una donna molto più giovane di lui. Un uomo viene ritrovato morto nell'agriturismo di sua proprietà; il delitto sembra inspiegabile, ma per puro caso Nerino trova una video-cassetta che mostra degli incontri erotici tra i clienti dell'agriturismo della vittima. Per non turbare la sensibilità di Assuntina e Patrizia, don Matteo decide di consegnare la VHS al capitano Anceschi, il quale stavolta è ben contento che il prete-investigatore voglia collaborare con lui.

I Carabinieri sono convinti che l'autore dell'omicidio sia una delle persone ricattate dalla vittima, che minacciava di rivelare a tutta la città le loro relazioni extra-coniugali. Cinzia Pancrazi si vede nella video-cassetta con il suo amante, ed è stata vista nei pressi del luogo del delitto nell'ora in cui è avvenuto l'omicidio; per questi motivi, Cinzia è la principale sospettata. Suo marito Lodovico, tuttavia, confessa di essere lui l'assassino. Don Matteo non gli crede e cerca di scoprire la verità.

Alessio Zama, un uomo di mezza età, viene assassinato mentre si trova nella vasca da bagno del suo appartamento: è impossibile che si sia suicidato perché qualcuno gli ha buttato addosso un asciugacapelli. L'indiziata numero uno è Petra Novelli, una giovane di origini messicane tornata a Gubbio dal Messico poco prima dell'omicidio. Il capitano Anceschi incontra don Matteo, il maresciallo Cecchini e Patrizia nel centro storico, e fa vedere loro la sua nuova automobile. Nel frattempo, in una gioielleria che si trova proprio a ridosso della piazzetta dove Cecchini si domanda a cosa serva una macchina così grande per un uomo single, Petra Novelli chiede al gioielliere Ettore Giuliani per quale motivo non ha confermato il suo alibi. Giuliani le risponde di non averla vista nel suo negozio all'ora del delitto, ma Petra sa benissimo che il commerciante sta mentendo, e, per paura di andare ingiustamente in prigione, minaccia l'uomo con una pistola, intimandogli di dire la verità ai Carabinieri. Ettore Giuliani finge di volerla accontentare e attiva l'allarme anti-rapina: Petra esce dal negozio con l'intenzione di fuggire. Anceschi è già rientrato in caserma, ma Cecchini si trova ancora in piazza ed estrae la sua pistola per arrestare la Novelli. Proprio in quel momento passa lì Patrizia, che era andata a comperare un paio di scarpe; Petra non si fa scrupoli a prendere in ostaggio la ragazzina e a puntarle la pistola alla tempia. Il maresciallo Cecchini è sconvolto e urla alla Novelli di lasciare libera sua figlia; don Matteo, invece, nascondendo l'agitazione, spiega a Petra che Patrizia è la figlia di Cecchini, e le propone di prendere lui come ostaggio al posto della ragazzina. La Novelli accetta: lascia andare Patrizia, e fugge via con la sua auto insieme a don Matteo.

Adesso i Carabinieri devono trovare il prete prima che la sua sequestratrice possa fargli del male. Un quotidiano locale titola in questo modo la prima pagina: «Prete rapito da un'assassina?»

Osvaldo Bellini,marito infedele, viene trovato ammazzato. Il motivo sembra essere la gelosia, tanto che la moglie della vittima viene sospettata del delitto. Mentre sta cercando di risolvere il caso, Don Matteo incontra la madre dell'accusata, che è una sua amica d'infanzia che tenterà di prendersi la colpa del crimine.

A Gubbio si sta per svolgere una delle tappe della tournée di una nota compagnia teatrale, che porta in scena lo spettacolo basato sul romanzo Anna Karenina. La protagonista dovrebbe essere Irina Platt, attrice molto famosa e non più giovanissima, che ha un talento innato per la recitazione ma è affetta da problemi psichici. Il marito di Irina Platt è il regista dello spettacolo, ed è un arrampicatore sociale: ha sposato Irina solo per avere una facile carriera e ora sta cercando in tutti i modi di farla ammalare, allo scopo di farla ritirare per sempre dalle scene. L'uomo ha anche una relazione extra-coniugale con una delle giovani attrici della compagnia; quest'ultima desidera ottenere il ruolo di protagonista.

Pippo viene scelto per fare il figurante, e don Matteo lo accompagna alle prove. Mentre Irina Platt si trova sul palco, avviene un terribile incidente: un pesante attrezzo di scena cade addosso a un giovane lavorante del teatro, che muore sul colpo. Il capitano Anceschi crede che non si tratti di incidente ma di omicidio premeditato.

Caterina, la moglie del maresciallo Cecchini, partecipando a un concorso a premi ha vinto una vacanza gratis in un'esclusiva beauty farm, i cui clienti sono persone ricche o famose. Cecchini vorrebbe che la sua consorte rinunciasse al premio perché non si ritiene in grado di badare alle figlie e di gestire la casa da solo, ma Caterina sente il bisogno di avere del tempo da dedicare al puro relax e quindi si reca nella beauty farm.

Lì, l'ospite d'eccezione è Corinna Campbell, attrice statunitense in declino: un fan la segue in continuazione perché si è innamorato di lei. Corinna litiga furiosamente con sua figlia Barbara, e decide di non aiutarla più economicamente. Il giorno successivo viene ritrovato il cadavere di Corinna Campbell all'interno di un lago: il capitano Anceschi dirige le indagini, e don Matteo si intromette per fare luce sul caso.

Aurelio Giannocca è un anziano vedovo appassionato di letteratura. Durante una manifestazione, un uomo tenta di ucciderlo, ma don Matteo riesce a salvargli la vita, e le telecamere di un'emittente televisiva locale riprendono il tentato omicidio. I Carabinieri esaminano il filmato per risalire all'identità dell'aggressore, il cui volto coperto viene pubblicato sui quotidiani locali. Il colpevole, che ha gravi problemi economici, tenta per la seconda volta di uccidere Aurelio Giannocca, ma riesce solo a ferirlo.

Don Matteo indaga sulla vita privata di Giannocca: l'anziano, dopo la morte di sua moglie, ha interrotto quasi del tutto i rapporti con le altre persone, dedicandosi soprattutto alla lettura. In questo periodo, Aurelio aveva preso in prestito dalla biblioteca comunale un libro di Jules Verne dal titolo Le tribolazioni di un cinese in Cina. L'unica persona con cui Aurelio comunica è la nipote Alice. La ragazza è sconvolta per quello che è successo e nota che il primo tentato omicidio è avvenuto nello stesso giorno dell'anniversario della morte della moglie di Giannocca. Alice è fidanzata con un ex-detenuto di cognome Laurenzi, che dopo aver scontato la condanna per rapina vuole essere un bravo cittadino. La madre di Alice, tuttavia, lo ritiene ancora un delinquente e cerca di allontanarlo da sua figlia. A causa di un falso indizio, Laurenzi viene accusato del duplice tentato omicidio.

Alberto Mei, un fotografo di fama internazionale, si reca a Gubbio insieme alle sue modelle per presentare alcune sue opere. Mei va in canonica per salutare don Matteo, e dice di aver sentito parlare del suo talento investigativo. Viviana, una delle modelle di Alberto, è tormentata da qualcosa e vuole parlarne con don Matteo, ma poi ci ripensa.

Durante la notte, qualcuno uccide Viviana, e Maria Jelic, un'adolescente di etnia rom, potrebbe aver visto qualcosa di utilissimo alle indagini. Il capitano Anceschi cerca di convincerla con la massima gentilezza a dire tutto ciò che sa sull'omicidio, ma Maria non vuole collaborare con le forze dell'ordine. La ragazza viene allora affidata provvisoriamente a don Matteo, il quale tenta anche lui di farle capire che la sua testimonianza è indispensabile per fare giustizia. Maria fa amicizia con Nerino, e gli trasmette la sua passione per il libro Zanna Bianca di Jack London. Quando però Nerino utilizza il termine "zingara" riferendosi a Maria Jelic, quest'ultima gli tira uno schiaffo e scappa via dalla canonica.

Un uomo che è stato chiamato a testimoniare in un processo decide di andare a vivere nel convento diretto da Padre Giuliano, per riflettere sulla testimonianza e in generale su come è stata la sua vita fino a quel momento. Casualmente, anche don Matteo si trova in quel convento: il sacerdote nota che Padre Giuliano è troppo rigido e austero nei confronti di Frate Fabio, un giovane novizio che qualche tempo prima era scappato dal convento perché si era innamorato di una ragazza.

Nessuno, a parte i religiosi e le forze dell'ordine, dovrebbe sapere che il super-testimone si è ritirato in convento: l'uomo ha infatti ricevuto delle minacce di morte. Qualcuno lo uccide durante la notte spingendolo giù da una vecchia scalinata.

Il capitano Anceschi riceve una lettera dal Comando Generale dell'Arma dei Carabinieri, in cui gli viene comunicato che tra non molto tempo verrà trasferito a Trento. Anceschi comunica quindi al maresciallo Cecchini che quella sul mistero del convento sarà la loro ultima inchiesta insieme, e gli chiede di tenere fuori don Matteo dal loro lavoro. Cecchini è molto dispiaciuto, perché considera Anceschi non solo un superiore corretto e capace, ma anche e soprattutto un buon amico; tuttavia, un po' per orgoglio e un po' per rispettare le gerarchie, il maresciallo dice ad Anceschi che il trasferimento a Trento non è problema, perché a Gubbio arriverà un altro capitano.

Dario è un ragazzino di tredici anni che vive in una baracca nella periferia di Gubbio insieme al padre, un disoccupato alcolista nato a Napoli. Giocando a pallone da solo, Dario ha fatto amicizia con un giovane malvivente che svolgeva l'attività di cassiere per un pericoloso clan camorristico; lui ha abbandonato la sua banda portandosi i via i soldi ottenuti con un sequestro di persona. Il capo di questo clan si trova ora in Umbria insieme a due scagnozzi, ed ha intenzione di trovare il traditore, ucciderlo e riprendersi i soldi da lui rubati.

I due criminali trovano il loro ex-compagno, gli sparano addosso senza farsi rivelare il luogo dove ha nascosto i soldi, e poi fuggono via. Non si sono accorti che Dario ha sentito la sparatoria, e dopo averli visti allontanarsi è andato a soccorrere il suo amico; quest'ultimo gli dice in punto di morte il luogo dove si trovano i soldi del riscatto.

Le indagini sull'omicidio vengono affidate al magistrato Giulia Massai, che ordina al capitano Anceschi di perquisire la baracca dove vivono Dario e suo padre: i Carabinieri trovano una maglietta del ragazzino sporca di sangue. È evidente che il tredicenne sa qualcosa ma non vuole parlare, e vuole separarlo dal padre perché quest'ultimo non ha un lavoro. Don Matteo interviene e spiega che il padre di Dario lavorerà per lui in canonica come assistente di Natalina. Dario e il genitore vengono quindi a vivere con Don Matteo, che ha chiesto e ottenuto il permesso dal Vescovo.

La notizia che il ragazzino è stato testimone dell'omicidio viene pubblicata dai giornali e dai telegiornali: il mandante del delitto lo viene a sapere e ordina ai suoi scagnozzi di trovare il piccolo e di costringerlo a rivelare dove si trovano i soldi, dopodiché lo dovranno uccidere perché è un testimone scomodo.

Natalina cerca da molti anni un fidanzato, anche se ormai la sua famiglia in senso affettivo è composta da don Matteo, nonna Elide, Pippo e Nerino. Loro però hanno notato che Natalina ha un comportamento diverso dal solito: è sempre di buon umore, è fin troppo cortese e gentile. Il motivo di questo cambiamento è che Natalina si è innamorata. Purtroppo, però, l'uomo che dice di amarla è in realtà uno spietato truffatore, che sfrutta i sentimenti delle donne sole e bisognose di amore per derubarle di tutto il loro denaro. Don Matteo ha conosciuto delle donne che sono state precedentemente raggirate dal mascalzone, e ha capito che Natalina è la sua prossima vittima. Il prete cerca di far capire alla perpetua che il suo fidanzato è un malvivente intenzionato solo a impossessarsi dei suoi risparmi, ma Natalina reagisce in malo modo e litiga furiosamente con don Matteo, perché è accecata dai sentimenti che prova per il delinquente.

Michele Fantoni è un ex-ladro che in passato aveva il sarcastico soprannome Babbo Natale perché entrava illegalmente nelle case attraverso il camino e poi rubava tutto ciò che aveva un valore economico. Adesso, dopo aver pagato il suo debito con la giustizia, Fantoni è un uomo libero e si sta per sposare in seconde nozze con una donna che lo ama e di cui è innamorato. Don Matteo dà il via alla celebrazione del matrimonio, ma in chiesa irrompono il maresciallo Cecchini, il capitano Anceschi e il brigadiere Ghisoni che arrestano Fantoni con l'accusa di furto e omicidio.

Infatti, la notte precedente, una donna, che viveva in un appartamento a Gubbio insieme al marito, è stata assassinata a seguito di un tentativo di furto finito male. Fantoni, che fino a quel momento non aveva mai ucciso nessuno, dichiara di essere completamente innocente, ma le prove sembrano essere a suo sfavore.

Don Matteo si impegna per scoprire la verità, ma nel frattempo cerca anche di ricucire il rapporto tra la fidanzata di Fantoni e la figlia avuta dal primo matrimonio.

A Gubbio si svolge il torneo degli scacchi viventi, e il Vescovo regala a Don Matteo un libro in cui vengono narrate le precedenti edizioni: ci sono scritti gli elenchi dei partecipanti, l'andamento delle singole partite mossa per mossa e gli esiti finali di ogni torneo.

La gioia e l'entusiasmo della popolazione per questo evento viene rovinata dall'azione di un misterioso aggressore che spara a degli uomini anziani con lo scopo di ferirli alle gambe, e poi rivendica questi gesti usando il soprannome "Re degli scacchi". Un carabiniere di cognome Geremia viene gravemente ferito durante una notte nel tentativo di sventare un attacco del re degli scacchi.

Il terrore si diffonde in città, e un colonnello arriva in caserma e rimprovera il capitano Anceschi e il maresciallo Cecchini perché non sono ancora riusciti ad identificare questa persona.

Don Matteo, consultando il libro regalatogli dal Vescovo, scopre che gli anziani feriti dal re degli scacchi avevano partecipato a un'edizione del torneo degli scacchi viventi molti anni prima, quando un giocatore molto in gamba era soprannominato proprio "Re degli scacchi".

Patrizia, figlia del maresciallo Cecchini, è diventata molto amica di Michela, una sua coetanea, figlia del professor Romalli, un esperto di edilizia che lavora come perito per il Comune di Gubbio.

Una mattina, il professor Romarli riceve una lettera anonima, e, dopo averne letto il contenuto, tenta di suicidarsi gettandosi dalla finestra del suo appartamento. Fortunatamente, il maresciallo Cecchini e il brigadiere Ghisoni erano andati da lui per interrogarlo riguardo a una tangente; i due carabinieri soccorrono tempestivamente il professore, che entra in coma.

La lettera anonima faceva riferimento al fatto che Romarli veniva tradito da sua moglie. Il capitano Anceschi indaga sia sulla tangente, sia sul tentato suicidio. Nel frattempo, molti eugubini ricevono delle lettere anonime in cui si fa riferimento a relazioni extra-coniugali. Don Matteo, durante un'omelia, convince i suoi parrocchiani a denunciare questi atti vigliacchi senza vergognarsi.

La madre del capitano Anceschi viene da Roma a fare visita a suo figlio e gli chiede se si è fidanzato.

A Gubbio si svolge la gara di deltaplano sponsorizzata da Lo Monaco, un imprenditore che sta per entrare in politica. Si sfidano Francesco Gandolfi e Federico Tornabuoni; quest'ultimo non prova semplice rivalità sportiva nei confronti del suo avversario, ma odio e invidia, perché secondo lui Edoardo gli ha portato via la fidanzata. In realtà Anna, che prima stava con Federico, ha liberamente scelto di lasciarlo per mettersi con Francesco. Tra gli spettatori della gara ci sono anche i Carabinieri e gli abitanti della canonica: Pippo si è messo in testa di diventare carabiniere, ma il maresciallo Cecchini cerca di fargli capire che non è un mestiere adatto a lui.

Francesco Gandolfi inizia a volare con il suo deltaplano, ma precipita pochi minuti dopo il decollo e muore: qualcuno ha sabotato l'apparecchio con lo scopo di assassinare Edoardo. Le indagini si concentrano subito sulla vita privata della vittima: Anceschi sospetta di Federico, che avrebbe potuto uccidere Francesco perché non accettava la fine della relazione con Anna.

Don Matteo entra in possesso di alcune foto scattate dalla vittima, che ritraggono un fiume rosso: probabilmente il movente del delitto non è passionale.

A Gubbio si stanno per svolgere le elezioni comunali e il partito favorito è una lista civica ambientalista che propone come candidato sindaco un giovane giornalista, figlio di un cittadino eugubino di religione ebraica. Il ragazzo, che non ha mai avuto un buon rapporto con il padre, riceve da tempo delle lettere minatorie che lo esortano a rinunciare alla candidatura.

Nel frattempo, il capitano Anceschi naviga su internet con il nickname "Barone rosso", e conosce in chat una donna che si fa chiamare "Cenerentola": tra i due nasce un legame molto intenso, anche se virtuale.

Natalina e Pippo stanno tornando in canonica dopo avere fatto la spesa, e si accorgono che sul ciglio della strada c'è una macchina. Il sagrestano si avvicina e vede il cadavere del giornalista che avrebbe potuto vincere le elezioni. I Carabinieri iniziano le indagini partendo dalle continue minacce che il giovane subiva: in una delle varie lettere minatorie si faceva anche riferimento al fatto che Gubbio non doveva avere un Sindaco ebreo. Don Matteo, che conosce il padre della vittima, parlando con lui afferma che non ha nessun senso discriminare gli Ebrei, sia per il fatto che l'ebraismo è stato un indispensabile presupposto per la nascita del cristianesimo e sia perché tutti gli esseri umani sono eguali davanti a Dio, a prescindere dalla razza e dalla fede. Il maresciallo Cecchini sa che la vittima aveva l'obiettivo di far diventare parco nazionale una zona agricola di Gubbio, e, se ci fosse riuscito, avrebbe causato un considerevole danno economico ai proprietari terrieri di quella zona. I sospettati, quindi, sono molti. La lista civica ecologista decide di presentare un nuovo candidato alla carica di Sindaco: si tratta della dottoressa Laura Respighi, una convinta ambientalista e animalista che vive da alcuni anni all'estero per lavoro. Laura accetta l'incarico e viene in treno nella città umbra. I Carabinieri hanno il compito di proteggere Laura, visto che il suo compagno di partito è stato ucciso, ma lei è convinta che la scorta non le serva a nulla. Il migliore amico della vittima, uno dei componenti di quel partito, va a salutare Laura, la quale riceve anch'essa una lettera minatoria. Tra la Respighi e Anceschi c'è subito una forte antipatia, o almeno così sembra: Laura è figlia di un colonnello dei Carabinieri, e ritiene che gli uomini che portano una divisa siano tutti insopportabili; Flavio, però, ogni tanto guarda Laura con un'espressione che non è affatto antipatica. Le indagini proseguono, e viene arrestato un pericoloso delinquente italiano, che sembra essere coinvolto in grave fatto avvenuto qualche tempo prima: un container era esploso causando la morte di dodici immigrati clandestini.

È tarda sera, e un professore si trova nella biblioteca di una basilica di Città del Vaticano. Il custode gli fa notare che è orario di chiusura, ma lui vuole rimanere ancora qualche minuto. Il custode si allontana, e qualcuno spinge violentemente il professore giù dal piano della biblioteca, uccidendolo.

Il cardinale del luogo ricorda che, quando si trovava in missione in Amazzonia, il suo amico don Matteo aveva un innato talento investigativo. Per questo motivo fa venire a Roma il parroco di Gubbio e gli chiede, in nome della loro antica amicizia, di risolvere questo scottante caso. Il prete accetta ma chiede che ad aiutarlo ci siano il capitano Anceschi e il maresciallo Cecchini, che sono i carabinieri con i quali ha risolto molti casi a Gubbio. La presenza di due militari nell'ambiente ecclesiastico non permetterebbe di indagare con discrezione, quindi i due dovranno fingere di essere seminaristi: Anceschi si chiamerà Alvise e Cecchini si chiamerà Serafino.

Intanto, un'assistente sociale porta a Gubbio una bambina di sette anni di nome Camilla, nata in Bolivia da una missionaria laica italiana. La piccola viene affidata temporaneamente al sindaco Laura Respighi, e dichiara di essere la figlia di don Matteo: in realtà la madre di Camilla era in missione umanitaria insieme a don Matteo, che fu padrino di battesimo della bambina. Prima di morire a causa di un grave incidente, la madre ha chiesto, tramite il testamento, che sua figlia fosse affidata a don Matteo; ma ora il sacerdote è in Vaticano.

Nella biblioteca dove è avvenuto il delitto, i nostri scoprono l'esistenza di un passaggio segreto che forse è stato utilizzato proprio dall'assassino per cogliere di sorpresa la sua vittima. Accanto al cadavere sono stati ritrovati dei granelli di un rosario e un registratore rotto. I tecnici della Polizia Scientifica riescono a recuperare l'ultima registrazione: il professore stava leggendo il contenuto di un censimento effettuato ai tempi di Gesù Cristo, poi l'urlo dell'uomo mentre precipitava giù. I nostri scoprono che una giovane restauratrice che conosceva la vittima ha rubato un'importante edizione di un Vangelo; la ragazza viene arrestata perché si ritiene che sia stata sorpresa dal professore mentre rubava e lo abbia voluto eliminare perché era un testimone scomodo.

Vanni Bertolacci, il padre di Nerino, ha quasi scontato la sua pena e sta per uscire di prigione. Era stato arrestato quattro anni prima per una rapina a mano armata. Ora, il capitano Anceschi e un suo superiore vorrebbero che Vanni si infiltrasse nella banda con cui aveva compiuto quella rapina, allo scopo di raccogliere le prove per poter arrestare i componenti. Infatti la banda è diventata una vera e propria organizzazione criminale, dedita non solo a rapine ma anche a stupri e omicidi. Inizialmente, Vanni non ha nessuna intenzione di collaborare con i Carabinieri perché sa che essere un infiltrato significa rischiare la vita. Anceschi, però, gli fa capire che aiutando le forze dell'ordine ad assicurare alla giustizia quei delinquenti assassini gli permetterebbe di riscattarsi definitivamente agli occhi dell'opinione pubblica ma soprattutto di suo figlio Nerino. Vanni, che grazie all'assistente sociale ha già trovato un piccolo appartamento in affitto e un lavoro come guardiano del museo comunale, accetta di infiltrarsi.

L'operazione deve però rimanere segreta, e il capitano Anceschi riceve l'ordine di non parlarne con nessuno dei membri della caserma di Gubbio, nemmeno con il maresciallo Cecchini, che rivelerebbe subito la cosa a don Matteo. Cecchini, però, essendo preoccupato per Nerino, vorrebbe controllare Vanni, e quindi Anceschi è costretto a rinfacciare al suo maresciallo il fatto che pur avendo quasi mezzo secolo non ha ancora ottenuto quella famosa promozione. Cecchini si sente offeso da quelle parole e crede che Anceschi non si fidi più di lui.

Vanni si è infiltrato, e riceve dal capobanda l'incarico di compiere una rapina all'armeria insieme con altri delinquenti. Nella rapina, questi ultimi riescono a rubare molte armi, ma Bertolacci viene lievemente ferito al braccio da un colpo di pistola sparato dal titolare del negozio. Nerino nota sia la ferita al braccio e sia il fatto che suo padre è sempre nervoso e preoccupato e frequenta cattive compagnie: il ragazzo crede che Vanni abbia ricominciato a delinquere.

Il capitano Anceschi e Natalina vanno casualmente a fare la spesa nello stesso supermercato, dove irrompe uno sconosciuto coperto da un passamontagna e armato di pistola, il quale minaccia la cassiera chiedendole tutti i soldi. Il rapinatore, innervosito dalle grida di Natalina, spara ad Anceschi e lo ferisce in maniera gravissima; poi scappa via.

Flavio viene subito portato in ospedale, e il medico dice che per salvargli la vita occorre una trasfusione di sangue. Tuttavia né Don Matteo, né il maresciallo Cecchini, né Natalina, né Laura Respighi né Pippo hanno il sangue dello stesso gruppo del capitano Anceschi. La situazione è disperata, ma una ragazza che non ha mai avuto a che fare con Flavio, ha il sangue del suo stesso gruppo e si rende disponibile a donarlo. In seguito alla trasfusione, Anceschi è completamente fuori pericolo, ma non può tornare a casa da solo, e don Matteo gli propone di trascorrere la convalescenza in canonica. Flavio accetta, e il giorno successivo va a casa della ragazza che gli ha salvato la vita con l'intenzione di ringraziarla, ma la trova morta. Apparentemente si tratta di un suicidio, ma Anceschi non riesce a crederci.

Il Comune di Gubbio organizza una gara di ballo, che vedrà sfidarsi separatamente i dilettanti e i professionisti. Tra i dilettanti, il maresciallo Cecchini, che già in passato ha vinto competizioni amatoriali, parteciperà con sua moglie Caterina, e Natalina insieme a Pippo, nonostante quest'ultimo sia totalmente incapace. Tra i professionisti, il favorito è Loris Guazza, un ballerino di fama regionale, che gareggerà insieme alla fidanzata Evelina De Magistris. Quest'ultima è l'unica figlia di Ettore De Magistris, noto farmacista eugubino, che è assolutamente contrario alla relazione tra sua figlia e il ballerino: una sera, Evelina esce di casa perché Loris la sta aspettando, ma Ettore la afferra con violenza e la costringe a rientrare. Lei si ribella e pretende di essere autonoma, rinfacciando al padre la vicenda di un certo Gabriele. Il padre la colpisce con uno schiaffone in faccia. Evelina, piangendo, urla ad Ettore tutto il suo odio e corre da Loris, che dice di amarla come non ha mai amato nessuna.

Si svolgono le prove: Evelina e Loris ballano per parecchio tempo, fino a quando lui vuole fare una sosta per bere. Dopo aver sorseggiato una bibita, il ballerino si sente male e cade a terra. Alle prove è presente anche Sartori, un medico legale, che subito stabilisce che il giovane è morto.

Laura Respighi va in caserma e chiede al capitano Anceschi di farle da cavaliere alla gara di ballo. Lui rimane piacevolmente sorpreso da questa richiesta e accetta senza dirle che non ha mai ballato in vita sua. Anceschi chiede quindi a Cecchini di insegnargli a ballare il tango per poter fare bella figura con la sindachessa.

Sartori esegue l'autopsia su Guazza, e stabilisce che la vittima è deceduta perché nella bottiglia di plastica contenente la bibita è stato iniettato un farmaco a cui Loris era allergico. Poiché questo farmaco è utilizzato abitualmente da Ettore De Magistris per curarsi da un disturbo nervoso, il farmacista viene subito accusato dell'omicidio e arrestato. L'uomo ha un movente e non cerca di discolparsi: la sua colpevolezza sembra certa, ma Silvana, moglie di Ettore e madre di Evelina, è assolutamente convinta dell'innocenza di suo marito e chiede aiuto a don Matteo.

Una domenica pomeriggio, in canonica si festeggia il compleanno di Natalina. È presente anche il maresciallo Cecchini insieme alla moglie Caterina e alle figlie Patrizia e Assuntina. A un certo punto Cecchini riceve la telefonata di un suo amico medico, il Dott. Corini, che gli chiede aiuto perché in ospedale stanno succedendo delle cose strane. Il carabiniere, non volendo rinunciare a trascorrere la domenica con la sua famiglia e i suoi amici, gli dà appuntamento alla mattina seguente.

Durante la notte, Natalina ha un attacco di tachicardia e viene ricoverata d'urgenza in ospedale. Il mattino seguente, all'alba, il medico amico di Cecchini precipita dal quarto piano. Don Matteo raccoglie le sue ultime parole prima di morire: sembrano frasi senza senso, ma la fidanzata del morto riconosce che Boccioni è il cognome di un infermiere dell'ospedale. Sulle mani del morto vengono trovate tracce di cocaina: il capitano Anceschi crede quindi che la vittima avesse scoperto un traffico di droga all'interno della struttura ospedaliera, e che qualcuno, probabilmente Boccioni, abbia deciso di impedirgli di denunciare. Per risolvere il caso, il maresciallo Cecchini deve infiltrarsi in ospedale fingendo di essere un infermiere.

Nel frattempo, siccome Natalina è ancora in ospedale e don Matteo è impegnato ad aiutare Nino a risolvere il caso, Pippo e Camilla devono cavarsela da soli in canonica.

Un uomo, Laudani, si sta recando preoccupato nella sede di una società finanziaria la cui titolare è Giulia Rebetti: quest'uomo svolge la professore di infermiere e vuole a tutti i costi parlare con il dottor Morandi. Lo ricevono due collaboratori della società, che gli dicono che in questo momento il dottor Morandi non può riceverlo. Ma lui li aveva anche avvertiti per telefono del fatto che sarebbe venuto per una questione urgente, e dice di volere andare a fare una denuncia ai Carabinieri. Uno dei due scagnozzi, allora, lo minaccia e poi lo colpisce con un pugno. L'infermiere cade, sbatte la testa e muore. In quel momento entra la segretaria di Giulia Rebetti, che vede il cadavere e viene minacciata di morte dall'altro scagnozzo.

A Patrizia Cecchini, la prima delle due figlie del maresciallo, accade un fatto terribile: mentre si trova fuori con le sue amiche, le cade della calce in un occhio. Cecchini e sua moglie Caterina portano subito Patrizia all'ospedale, dove un professore spiega loro la situazione. La ragazza rischia di perdere completamente l'uso di un occhio, e l'unica possibile soluzione è quella di farla operare in una clinica privata specializzata che si trova negli Stati Uniti d'America, ma l'intervento è assai costoso. Il medico consiglia al maresciallo di rivolgersi alla società finanziaria di Giulia Rebetti, dove otterrà sicuramente un prestito con interessi inferiori rispetto a quelli che pretenderebbe una banca. Cecchini decide di ascoltare il suggerimento di quel dottore senza prima sentire il parere dei suoi amici più fidati, e cioè di don Matteo e del capitano Anceschi. La Rebetti, intanto, è stata correttamente informata dai suoi scagnozzi dell'omicidio del loro debitore, e ordina alla sua segretaria di non rivelare a nessuno la verità. Cecchini si presenta alla finanziaria da solo e in borghese: la Rebetti capisce subito che non è venuto lì come carabiniere ma come potenziale cliente, lo accoglie con gentilezza e gli fa firmare un contratto.

Intanto, Camilla ha dei problemi a scuola: la maestra ha deciso di fare una recita a cui potranno partecipare anche i genitori degli alunni, e i suoi compagni la insultano e la emarginano perché è orfana. La bambina, quindi, va a trovare il capitano Anceschi, che è un uomo solo come lei. Camilla e Flavio diventano amici, e la piccola a scuola dice a tutti che Anceschi è suo padre: è una bugia, ma molti ci credono e iniziano a spargersi delle voci false.

Il maresciallo Cecchini è sollevato, ma poi, rileggendo con più calma il contratto, si accorge di un comma scritto molto più piccolo rispetto agli altri. È il comma ventitré, che stabilisce che il destinatario del prestito stipula anche un'assicurazione sulla vita dal costo di 50.000 euro all'anno. Per Cecchini e la sua famiglia sembra essere la rovina definitiva.

Una mattina, don Matteo apprende da un manifesto che l'unico centro di accoglienza per i senzatetto presente in città è stato chiuso per via delle pressioni di un piccolo partito politico estremista. Quando sta per rientrare, il sacerdote sente Natalina urlare: un barbone è morto nella chiesa. Arrivano subito il maresciallo Cecchini, il capitano Anceschi, il medico legale e la polizia scientifica. La vittima è morta per avvelenamento da stricnina, alcaloide altamente tossico che causa una morte molto dolorosa. I sospetti si concentrano subito sul leader di quel gruppo estremista che ha fatto chiudere il centro: l'uomo dichiara di disprezzare i senzatetto perché sono degli inutili parassiti, ma che non rischierebbe mai di finire in prigione per uno di loro. Le indagini vanno avanti, e si scopre che la vittima aveva bevuto il vino rubato dalla sacrestia, lo stesso vino che avrebbe dovuto bere don Matteo durante la celebrazione eucaristica. Cecchini e Anceschi corrono subito in parrocchia per avvisare il prete, che rimane sorpreso e sconcertato: qualcuno si è intrufolato in sacrestia e ha messo la stricnina nel vino da messa, con l'obiettivo di uccidere don Matteo; solo per una pura casualità, il senzatetto Giuseppe è entrato in chiesa e, poiché aveva molta sete, ha bevuto dal calice avvelenato. Vengono interrogati anche Natalina e Pippo; la perpetua non ha nulla da nascondere ed è solo preoccupata del fatto che in giro ci sia qualcuno che vuole assassinare don Matteo, ma il sagrestano, anche lui preoccupato, mente al maresciallo Cecchini dicendo di aver chiuso a chiave l'armadietto che conteneva il calice avvelenato. In realtà, quella sera in televisione c'era la partita del Perugia, e Pippo, che non voleva perdere il calcio d'inizio, non aveva riordinato la sacrestia e aveva lasciato l'armadietto aperto.

Una sera, don Matteo sta pregando in chiesa e qualcuno entra e spegne la luce. Il prete capisce che si tratta dell'assassino e afferra una candela, ma poi cerca di dialogare. Questa persona scappa via con la sua macchina. Il principale sospettato adesso è un uomo appena uscito di prigione, che era stato arrestato da Cecchini con l'assistenza spirituale di don Matteo. Il sacerdote lo va a trovare e capisce che è innocente, poi prende la bicicletta per tornare a casa ma qualcuno gli spara. Don Matteo viene ricoverato d'urgenza in ospedale.

Siamo all'inizio di febbraio: Natalina è andata alla parrocchia Santa Rosaria di Pompei e adesso sta tornando a Gubbio in treno. Arrivata alla stazione, la perpetua non vede don Matteo e si ferma al bar, dove poggia la sua valigia. Proprio lì, vicino a lei, c'è Sabrina Giacci, una giovane modella che sta facendo una telefonata. Anche la ragazza ha poggiato a terra la sua valigia, che è identica a quella di Natalina. La ragazza dice al telefono di essere stanca e che quello è stato il suo ultimo viaggio. Nel frattempo arriva don Matteo, e Natalina prende per sbaglio la valigia di Sabrina. Quest'ultima, terminata la telefonata, non si accorge dello scambio e torna nel suo appartamento di Gubbio.

Il capitano Anceschi vorrebbe invitare Laura a cena per il giorno di San Valentino, ma non riesce a trovare le parole giuste. Quando la incontra in piazza, Anceschi si fa coraggio e inizia il suo discorso, ma arriva Ross Wilson, un imprenditore australiano a bordo del suo macchinone insieme alle guardie del corpo. Laura Respighi spiega al capitano che quell'uomo si trova a Gubbio perché ha intenzione di aprire un centro estetico. Wilson, senza fare tanti giri di parole, propone al sindaco di andare insieme a cena la sera del 14 febbraio, e Laura accetta. A questo punto Flavio se ne va senza nemmeno salutare.

I Carabinieri trovano il cadavere di Sabrina Giacci all'interno del suo appartamento: ci sono dei segni di colluttazione, e il medico legale conferma che si tratta di un brutale omicidio. La ragazza aveva una boutique di alta moda a Miami, e per questo motivo viaggiava spesso tra l'Italia e l'America. A Gubbio non aveva una buona reputazione. Il principale sospettato è Vito Annosi, ex-fidanzato della vittima, che qualche tempo prima era stato denunciato dalla giovane per molestie: lui non voleva accettare la fine della loro relazione. Sul luogo del delitto appare subito strano il contenuto della valigia di Sabrina: gli abiti sono tutti fuori moda, inadatti ad una donna di giovane età e di una taglia più piccola rispetto a quella della vittima. È evidente che la ragazza aveva scambiato erroneamente la sua valigia con quella di un'altra persona.

A Gubbio si svolge una fiera enogastronomica a cui partecipa anche una scolaresca del liceo guidata dal professor Ridolfi. Nella classe c'è una nuova allieva, che si chiama Emilia e viene dall'Inghilterra. La ragazza dice a Don Matteo di nutrire una profonda ammirazione per l'insegnante Ridolfi, ma di non trovarsi per niente bene con la nuova classe del liceo.

Qualche minuto dopo, Emilia si trova al piano superiore dell'edificio dove si svolge la fiera: qualcuno la stupra.

Il Sindaco Laura Respighi vuole che Gubbio ospiti i campionati di pattinaggio del 2006: in questo periodo, quindi, il palazzetto dello sport è riservato a due coppie che si devono allenare. Siccome Camilla vuole pattinare, don Matteo riesce ad ottenere il permesso per assistere agli allenamenti e pattinare dopo i campioni. Chiara Sereni inizia ad allenarsi ma cade e ferendosi finisce all'ospedale. Il capitano Anceschi coordina le indagini: qualcuno ha sabotato l'impianto di riscaldamento, facendo in modo che il ghiaccio diventasse troppo fragile. Il direttore del palasport mostra agli inquirenti una lettera minatoria ricevuta da Gianni Spera, ex-custode licenziato qualche tempo prima. Gianni Spera adesso lavora come scultore, e ammette di aver minacciato il suo ex-datore di lavoro, ma nega qualsiasi responsabilità dell'incidente avvenuto a Chiara Sereni.

Don Matteo conduce il programma Dite la vostra su Radio On The Road, un'emittente radiofonica privata di Gubbio. Al suo fianco c'è Paco, un giovane DJ che professa l'importanza della ribellione e dell'anticonformismo. Paco ha scoperto e lanciato i Crysis, un gruppo musicale molto apprezzato dagli adolescenti soprattutto per la canzone Voglio adesso. Anche Camilla e Patrizia sono fan dei Crysis e vogliono andare al concerto che si terrà in una discoteca. Il maresciallo Cecchini non vuole permettere a sua figlia di andarci, ma don Matteo gli fa notare che Patrizia ha sedici anni, ed è quindi giusto che vada a sentire la sua band preferita.

Quella sera, il prete si trova in canonica e ascolta Radio On The Road: Paco sta conducendo il suo programma, ma si sente un colpo di pistola. È un delitto in diretta. Gli ascoltatori di Radio On The Road chiamano subito i Carabinieri, e, mentre loro arrivano, il direttore dell'emittente scappa via con la sua auto e butta una pistola dal finestrino. Il colpo che ha ucciso Paco è di una pistola calibro 38.

Dopo cinque anni di lavoro ininterrotto, il capitano Anceschi ha deciso di prendersi una settimana di ferie. Va quindi dal barbiere e lì incontra don Matteo, che nota una cosa strana: il nuovo assistente del barbiere ripone in un fazzoletto i capelli di Anceschi. Quest'ultimo, appena uscito dal negozio, vorrebbe subito andare con la sua automobile all'agriturismo in cui ha prenotato una stanza, ma c'è una Alfa Romeo blu 156 parcheggiata dietro la sua Mazda Tribut, che ostruisce il passaggio. Flavio suona il clacson sperando che il proprietario venga a spostare l'auto, ma non si fa vivo nessuno e quella macchina non è chiusa. Anceschi decide quindi di spostarla lui stesso.

Poco dopo, Simeoni, un collaboratore di giustizia, esce dal carcere perché ha ottenuto la semilibertà: due malavitosi lo uccidono investendolo con la stessa Alfa Romeo blu che impediva ad Anceschi di partire. Il capitano, arrivato all'agriturismo, sente che qualcuno sta ascoltando della musica dance ad alto volume: un po' scocciato, va a protestare, e a rispondergli è proprio il sindaco di Gubbio Laura Respighi, che ha affittato una stanza in quello stesso agriturismo. Sembra quasi un segno del destino. Anceschi è timido e impacciato, Laura lo invita a cena e i due si scambiano il loro primo bacio. È evidente che Laura ricambia il sentimento di amore che Flavio prova per lei.

I Carabinieri intanto avviano le indagini sulla morte di Simeoni, ed escludono subito che possa trattarsi di un incidente, perché l'auto che lo ha investito è stata ritrovata a poca distanza dal luogo del delitto. Il reparto delle investigazioni scientifiche ha il compito di analizzare le impronte e i capelli trovati nell'Alfa Romeo blu. Il maresciallo Cecchini trova addosso a Simeoni il numero di cellulare del capitano Anceschi. Per spiegare che legame c'è tra un ufficiale dei Carabinieri e un delinquente che aveva da poco iniziato a collaborare con la giustizia, bisogna ricordare ciò che avvenne nel 1993. Emanuele Anceschi, il papà di Flavio, era un commerciante onesto, ma una banda di criminali gli aveva imposto di pagare il pizzo: lui si era rifiutato, e aveva un appuntamento con Simeoni, un membro di quella banda. Simeoni lo aveva ucciso senza esitazione sparandogli da distanza ravvicinata. Il colonnello De Andreis, appena saputo del delitto Simeoni e delle strana coincidenza della vacanza di Anceschi, arriva subito a Gubbio e chiede al maresciallo Cecchini di svolgere un'indagine impeccabile ma soprattutto riservata, perché gli assassini di Simeoni hanno evidentemente architettato un piano per mandare in prigione il capitano Anceschi, che di recente aveva avuto un colloquio in carcere con Simeoni.

Camilla frequenta le elementari nell'istituto d'istruzione di Gubbio che è sia scuola elementare sia scuola media. Una settimana prima del suo compleanno, Camilla decide di invitare, oltre ai suoi compagni di classe, anche due ragazzine delle medie: Assuntina Cecchini, figlia di Caterina e del maresciallo, e Lucia, figlia di Elena e Gianni Matteucci, un uomo che ha da poco aperto una sartoria insieme alla moglie Elena. Assuntina è l'unica amica della nuova arrivata Lucia. Natalina si rivolge proprio a Gianni Matteucci per riparare un vestito, ma si accorge che l'uomo è totalmente incapace a svolgere l'attività di sarto. Poco dopo, Elena e Gianni si incontrano nella chiesa San Giovanni con il maresciallo Cecchini e il capitano Anceschi. Dal breve dialogo si capisce che i due coniugi si trovano a Gubbio con delle false identità, che la sartoria serve solo come copertura perché Gianni Matteucci è il super-testimone di un processo contro una pericolosa e spietata organizzazione criminale che si svolgerà tra pochi giorni a Perugia.

La narrazione si sposta ora nella scuola: è lunedì mattina, un'insegnante esce dalla classe per richiamare Lucia e Assuntina che sono andate in bagno, ma non le trova. La professoressa chiede alle bidelle se hanno visto le due bambine, e loro rispondono di no; decide quindi di informare subito la preside, la quale chiama immediatamente i Carabinieri. I genitori di entrambe le piccole sono sconvolti dalla notizia che qualcuno ha rapito le loro figlie; Lucia Metteucci si era sentita male e aveva chiesto di andare in bagno, e Assuntina Cecchini aveva chiesto di accompagnarla. Delle due si sono perse le tracce. L'entrata principale dell'edificio scolastico è stata regolarmente sorvegliata, ed è quindi impossibile che i rapitori siano passati da lì. L'appuntato Linetti scopre che il cancello secondario, che di solito è chiuso, è stato forzato. Non ci sono dubbi, quindi, sul fatto che sia stata quell'organizzazione criminale a rapire le due bambine per costringere Matteucci a non parlare al processo. Il capitano Anceschi interroga le persone presenti sul luogo del rapimento: la preside era nel suo ufficio a parlare con i genitori di un alunno, nessuno dei bidelli sorvegliava il cancello secondario perché era chiuso, ogni insegnante era nella propria classe a fare lezione, e il giardiniere si trovava nel capanno per telefonare al ferramenta. Nessuna testimonianza è quindi utile per capire dove possano essere finite le bambine. Qualche ora dopo, Gianni Matteucci, che non è un pentito ma il fratello di una vittima di questa organizzazione, riceve una telefonata da una cabina telefonica: un malavitoso gli dice che se lui non terrà la bocca chiusa al processo, entrambe le bambine verranno uccise.

Don Matteo, il maresciallo Cecchini, il capitano Anceschi, Natalina, l'appuntato Linetti, Camilla, Pippo e molte altre persone residenti a Gubbio assistono alla celebrazione del trentesimo anniversario della morte del conte Baggini de Garboli, cittadino onorario del comune in provincia di Perugia. Il Sindaco Laura Respighi spiega che il conte era un imprenditore capace e onesto. Prende la parola anche Edoardo, il figlio del conte. Sembra a tutti strano il fatto che Ottavia, sorella di Edoardo, non sia ancora arrivata.

Qualcuno armato di pistola è entrato nella villa della famiglia Baggini de Garboli: Ottavia in quel momento si stava preparando.

La narrazione riprende venti minuti dopo: Glauco, ex-giardiniere dei Baggini de Garboli, chiama i Carabinieri dicendo che la contessa Ottavia è morta. Arrivati sul luogo del delitto, Anceschi nota subito che il ragazzo ha la maglia sporca di sangue. Il medico legale stabilisce che la vittima è morta con un solo colpo di pistola, ma l'arma del delitto non viene ritrovata. Poiché Glauco e Ottavia erano stati fidanzati e lui non accettava il fatto che lei lo aveva lasciato, il giovane viene arrestato con l'accusa di omicidio. Don Matteo va a trovarlo in carcere e capisce che il colpevole non può essere lui.

Edoardo assiste alla lettura del testamento, e viene fuori che ad Ottavia era rimasto pochissimo denaro. Un'altra sospettata è la commercialista della vittima, che aveva libero accesso ai conti bancari. Una foto scattata dalla Polizia Stradale incastra il vero colpevole: è un killer professionista.

Nella canonica di don Matteo si tiene una cena in onore di Giulia Baldeschi, una nota cantante lirica. Partecipano anche Anceschi e Cecchini con la sua famiglia. Patrizia scatta delle foto con il suo nuovo telefonino, e Anceschi, da sempre appassionato di musica lirica, chiede un autografo alla Baldeschi. Terminata la cena, Giulia si mette in viaggio con la sua auto per tornare a Roma, ma ha un incidente molto grave e finisce in coma. Dagli esami risulta che la Baldeschi ha ingerito una dose sproporzionata di sonnifero: qualcuno lo ha messo nella spremuta di arancia che la cantante aveva bevuto in canonica. I sospetti ricadono sulla sua assistente che si era da poco auto-licenziata dopo l'ennesimo litigio con la cantante. L'assistente sta per lasciare Gubbio, ma viene arrestata dai carabinieri. Dichiara di essere assolutamente innocente: Giulia è stata per lei come una seconda madre, e se litigavano spesso non era perché non si volessero bene, ma perché Giulia aveva un carattere snob e un po' arrogante.

Su una rivista scandalistica vengono pubblicate le foto del marito di Giulia che chiacchiera con una ragazza bionda: per gli appassionati di gossip non c'è alcun dubbio: l'uomo ha un'amante, e la frequenta anche ora che sua moglie è in coma. Indagando, i Carabinieri scoprono che il marito del soprano prelevava illegalmente dei soldi dal conto bancario di sua moglie, falsificandone la firma.

Una sera, due fuorilegge dell'Est Europa si recano a casa dei coniugi Gemma e Mario Marabini. Mario s'infuria e li minaccia con una pistola, ma uno dei due cerca di sottrargliela e per sbaglio spara un colpo che ferisce gravemente Mario. I due banditi scappano con la loro Mercedes, e vengono notati da un passante. Gemma chiama subito il 118, e Mario le chiede di non rivelare la verità alle forze dell'ordine, dicendo che è stata una rapina finita male. Cecchini e Anceschi capiscono subito che la signora Marabini non sta dicendo la verità. Mario è entrato in coma.

Don Matteo riceve la visita dei coniugi Lucia e Sergio Arnaldi, i quali dicono che Bruno, il loro figlioletto di otto anni, è scomparso: non è la prima volta che il piccolo scappa di casa, ma adesso è assente da troppe ore. Sergio Arnaldi non vuole chiamare i Carabinieri e chiede a don Matteo di aiutarlo a cercare suo figlio. Il prete non nega il suo aiuto, ma nota che i coniugi Arnaldi nascondono qualche cosa.

In questo periodo gli agenti della Polizia municipale di Gubbio stanno facendo molte multe ai carabinieri in servizio. Anceschi vuole risolvere questa situazione e protesta con Laura, la quale gli chiede di scrivere una lettera ufficiale al Comune. Così, al maresciallo Cecchini viene un'idea bizzarra: scrivere delle lettere d'amore a Laura facendole credere che Flavio sia il mittente; decide quindi di copiare quelle che aveva scritto diversi anni prima a Caterina.

Camilla va in piscina e incontra un bambino bisognoso d'aiuto: lo porta in canonica e lo nasconde in camera sua, portandogli del cibo preso dal frigorifero. Don Matteo non è riuscito a trovare Bruno, e convince Lucia Arnaldi a fare una regolare denuncia di scomparsa ai carabinieri. Natalina intanto si accorge che qualcuno ruba da qualche giorno il cibo, e accusa Pippo, il quale dice giustamente di non saperne nulla. Camilla nota che un uomo si apposta di sera davanti alla canonica, ed è decisa a non fare sapere a nessuno della presenza di quel bambino, ma Don Matteo lo viene a sapere e crede che quel bambino sia Bruno. I Carabinieri accompagnano subito i coniugi Arnaldi in canonica, ma quel bambino non è loro figlio.

Don Matteo, il capitano Flavio Anceschi e il sindaco Laura Respighi fanno parte della giuria di una gara tra pasticceri che si svolge in un hotel di Gubbio. Il presidente della giuria è l'industriale Bonanno, organizzatore della gara. La madrina della manifestazione dovrebbe essere Valentina Sasso, ex-fidanzata di Bonanno, ma, all'ultimo momento, l'uomo decide di sostituirla con la sua nuova fiamma, una giovane ragazza spagnola di nome Pilar. Un uomo inizia a gridare che la gara è truccata e che la giuria è stata corrotta per fare vincere Ignazio Cremona, uno dei pasticcieri più bravi d'Italia. Il maresciallo Cecchini fa subito allontanare questa persona dalla sala dove si svolge la gara. Ignazio Cremona, intanto, sta ultimando la torta che dovrà essere assaggiata dai giurati: il suo assistente è molto rispettoso e premuroso, ma lui lo tratta con freddezza. Cremona decide di non assaggiare il dolce come è solito fare; la sua torta è la prima in gara, e tocca al presidente della giuria provarla per primo. Bonanno prende la torta, la mangia ma si sente subito male e cade a terra. Cremona assaggia quel dolce e poi ha un malore anche lui. I Carabinieri sospendono subito la gara e chiamano il 118: per Bonanno non c'è niente da fare, è morto; Cremona invece entra in coma. Il reparto delle investigazioni scientifiche esamina la torta che ha causato la morte di un uomo e il coma di un altro: il dolce è stato avvelenato con un farmaco a base di stricnina. Si scopre che Valentina Sasso aveva spedito una lettera minatoria a Bonanno.

Natalina ha ricevuto in regalo un'auto d'epoca, ma non guida da quindici anni e quindi chiede aiuto a Laura.

Il titolare di una delle dieci aziende vinicole più importanti d'Italia viene assassinato nella sua cantina. Viene subito accusato del delitto un suo amico d'infanzia: il movente sarebbe che la vittima aveva ingiustamente licenziato la madre del sospettato, che lavorava per la sua famiglia come domestica. Sul luogo del delitto, il capitano Anceschi trova un fermaglio che appartiene al sindaco Laura Respighi, la donna di cui è perdutamente innamorato. Anceschi è sconvolto dal sospetto che Laura possa essere complice di un omicidio, ma conduce le indagini con la sua solita rigidità e inflessibilità, senza farsi condizionare dai sentimenti. Laura, che è amica sia della vittima sia del sospettato, dichiara la sua innocenza, ma il sospettato si è dato alla fuga. Anche don Matteo cerca di fare luce sul caso.

Linda è una dottoressa che, insieme al suo fidanzato, dirige "Casa Domani", un'associazione che si occupa dei bambini dislessici. A causa dei debiti, l'associazione rischia di chiudere: il creditore,l'ingegnere Zanca è un costruttore senza scrupoli, che ha rilevato la struttura per avviare un nuovo progetto imprenditoriale. Una mattina, l'uomo si reca da Linda per comunicarle che dovrà sgomberare l'edificio, ma la giovane non ha intenzione di interrompere questo servizio sociale. Quella sera, il costruttore viene ucciso a martellate. L'arma del delitto appartiene al fidanzato di Linda, che si dichiara innocente: si era recato nel cantiere della vittima per chiedergli di non sfrattarli, ma non lo ha ucciso. Le prove indiziarie sono tuttavia contro di lui e c'è anche il movente: così il ragazzo viene arrestato.

Nel frattempo, l'appartamento del capitano Anceschi si è allagato ed è diventato inagibile. Mentre l'idraulico esegue i lavori di riparazione, Flavio vorrebbe stare in albergo, ma nessuna stanza è libera perché a Gubbio si svolge il raduno nazionale degli allevatori di struzzi. Il maresciallo Cecchini propone quindi al suo superiore di venire a stare a casa sua fino a quando i lavori non saranno terminati. Il capitano dapprima teme di disturbare, ma Nino insiste e allora lui accetta.

Don Matteo è convinto che il fidanzato di Linda dice la verità, e cerca di scoprire chi sia il vero assassino. Nel bosco viene ritrovato il cadavere di uomo di cui non si conosce ancora l'identità. È evidente che il morto è stato trascinato lì, e quindi si pensa ad un secondo omicidio, ma il medico legale stabilisce che l'uomo è morto per cause naturali.

Pippo, desideroso di trovare la sua anima gemella, si rivolge all'agenzia matrimoniale "Cuori solitari" di proprietà di un certo Galanti. Nel frattempo, i Carabinieri di Gubbio cercando di scoprire l'identità di una ladra professionista soprannominata "primula rossa", che adesca gli uomini soli facendosi invitare a cena a casa loro per poi derubarli. Rossana lavora come cameriera per un uomo da poco separato, e una mattina, quando va da lui per prendere servizio, lo trova morto. La donna chiama subito i carabinieri, che, intervenuti sulla scena del delitto, suppongono si tratti di un tentativo di furto finito male. Su uno specchio dell'appartamento della vittima, infatti, c'è una X fatta con un rossetto, che è sempre stata la firma della primula rossa. Il tavolo era apparecchiato a lume di candela per due persone, e c'erano solo cibi per celiaci: è però certo che la vittima non era intollerante al glutine, quindi per esclusione l'intolleranza è della donna con cui la vittima aveva appuntamento.

Gubbio è colpita da un'epidemia di brucellosi: un cardiopatico padre di tre bambini muore, e altre quattro persone vengono ricoverate in ospedale; tra queste c'è anche il sindaco Laura Respighi. Il capitano Anceschi le dichiara il suo amore mentre lei delira. Il maresciallo Cecchini viene ospitato dal capitano perché la moglie Caterina ha invitato moltissimi parenti dalla Sicilia.

Quinto Belli si reca in caserma per denunciare un furto di bestiame: ritiene che il responsabile del furto sia Saverio Donini, suo arcinemico. Donini è vedovo, e odia Belli perché lo ritiene responsabile della morte di sua moglie; don Matteo va nel negozio di Donini e conosce la figlioletta, una simpatica bambina che ha qualche anno in meno rispetto a Camilla. I Carabinieri devono scoprire l'origine dell'epidemia.

Una donna va a confessarsi da don Matteo, gli dice di essere terrorizzata e gli chiede di custodire una cosa per lei. Il prete vorrebbe capire quale è il suo problema, ma lei scappa via immediatamente. Vicino al confessionale c'è un bellissimo neonato: ecco ciò che don Matteo deve custodire per quella persona.

Nel frattempo in caserma, il professore universitario Amedeo Mirti denuncia la scomparsa di sua moglie Elena: i due erano andati a portare a spasso il cane vicino al lago, poi lui si è allontanato per inseguire l'animale e lei è sparita. Il capitano Anceschi dà subito il via alle ricerche.

In canonica, don Matteo racconta a Natalina, Camilla e Pippo dell'incontro con una donna misteriosa che gli ha chiesto di tenere il piccolo senza dire niente a nessuno: ora dovranno impegnarsi per accudirlo, ma la cosa dovrà rimanere tra loro quattro.

Nel lago viene ritrovato il cadavere di una donna bionda di circa trent'anni: Amedeo Mirti riconosce che il corpo è di sua moglie Elena. I due coniugi erano sposati da dieci anni e non avevano rapporti con i parenti; a causa di alcuni investimenti sbagliati, lui aveva contratto dei debiti molto alti.

Suor Amelia è una religiosa amica di don Matteo, nativa dell'Umbria e missionaria da venti anni in Africa. Ora è tornata a Gubbio per risolvere una questione burocratica legata a un centro di accoglienza per anziani: l'anziano proprietario del terreno è morto, e il figlio pretende di chiudere il centro. Ma suor Amelia è in possesso di un documento in cui il precedente proprietario cede a tempo indeterminato il terreno alle suore. La religiosa va in caserma a sporgere denuncia, ma non ha il documento a portata di mano, e quindi non può dimostrare la verità. Quella sera, Roberta, la figlia del fratello di suor Amelia, trova il documento, e quando sua zia torna a casa, glielo dice sulla soglia della porta. La suora è contenta e vuole subito andare dai Carabinieri, ma qualcuno, con la complicità del buio, le spara tre colpi di pistola. Suor Amelia viene portata in ospedale, dove i medici le salvano la vita.

Un violinista molto famoso è arrivato a Gubbio per un concerto, e Laura sembra mostrargli interesse e apprezzamento. Il capitano Anceschi è geloso ma non riesce a dichiararsi.

La prima sospettata per il tentato omicidio è la signora Cicogna, moglie di un ricco imprenditore di origini siciliane: un testimone l'ha vista vicino a casa di Roberta. Un altro indiziato è un uomo che qualche anno prima era fidanzato con una sua coetanea, che però decise di prendere i voti grazie anche all'incoraggiamento di suor Amelia. Dopo la risoluzione del caso, la stagione si conclude con il fidanzamento di Flavio e Laura, e con don Matteo che strizza l'occhio ai telespettatori.

Una scrittrice arrivata in città per presentare il suo ultimo lavoro viene uccisa nella sua abitazione che ospita giovani letterati. Uno di questi è sospettato dell'omicidio perché si pensa che la donna gli abbia rubato l'idea. Intanto Don Matteo accoglie nella sua canonica il piccolo Tommaso.

Il capitano Anceschi si ingelosisce dopo che una cartomante predice per Laura un nuovo amore all'orizzonte. Quando però la stessa cartomante viene trovata morta in circostanze misteriose, Don Matteo indaga per scoprire che cosa sia successo.

Una donna viene trovata in fin di vita nei camerini del teatro durante un concerto di musica classica. Tutti gli occhi sono puntati su un musicista che in passato aveva avuto una relazione sentimentale con la donna. Intanto Cecchini si esercita per partecipare a un quiz musicale in tv.

Il furto di un quadro impressionista di grande valore fa sospettare una truffa ai danni dell'assicurazione escogitata dal proprietario dell'opera, che versa in gravi condizioni finanziarie. Nel frattempo, Laura e Anceschi sembrano attraversare un periodo di crisi.

Il professor Quistelli,enigmista molto noto in città,viene trovato morto sulla sua carrozzella. L'uomo era malato da tempo e si sospetta che la sua infermiera abbia praticato l'eutanasia. La donna inoltre era stata in passato legata sentimentalmente al capitano Anceschi, che si trova in una difficile situazione.

I Carabinieri sono impegnati nelle indagini sul ritrovamento nel lago di una macchina con targa inglese al cui interno c'è uno scheletro. Don Matteo invece è preso dalle sue personali indagini sulla scomparsa di un giardiniere, mentre Natalina va alla caccia dei ladri della sua auto.

Il proprietario di una gioielleria uccide un pregiudicato durante un tentativo di rapina al suo negozio. I Carabinieri sono costretti ad arrestare l'uomo, ma i colleghi commercianti protestano contro questa decisione. Sul caso farà luce Don Matteo.

Cecchini è in ferie e vuol decidere dove andare in vacanza. Una mattina investe, per errore, un bambino che viene quindi ricoverato in ospedale. Il Maresciallo per rimediare si trova a fare il "medico del sorriso" in corsia. Proprio all'ospedale una dottoressa viene spinta giù da un ballatoio: Don Matteo indaga sul caso.

Durante una battuta di caccia, un avvocato viene trovato senza vita nel bosco. I principali sospetti si concentrano sulla segretaria, che si pensa possa aver avuto una relazione segreta con l'uomo. Intanto Laura decide di sospendere l'attività di caccia, ma i cacciatori sono pronti a protestare.

Una domenica come tante, il capitano Anceschi si trova in una sala scommesse, camuffato per non farsi riconoscere. A un certo punto arriva Natalina, che lo riconosce, lui nega, ma qualcun altro di nascosto ha capito che vuole nascondersi; quindi all'uscita li rapisce. Poco dopo viene ritrovata la Mazda 6 blu di Anceschi bruciata, il che fa pensare che qualcuno ce l'abbia con lui. Don Matteo, Cecchini, Laura e gli altri sono preoccupatissimi, ma alla fine riusciranno a far luce sul caso e a liberare gli amici.

Un vecchio amico di Don Matteo, un ragazzo di strada, è da poco arrivato a Gubbio per andare a lavorare in una fabbrica che è gestita da ex-detenuti. Pochi giorni dopo, tuttavia, il direttore della fabbrica viene trovato ucciso. Don Matteo cerca di far chiarezza sulla situazione.

L'Amministratore Delegato di un'azienda produttrice di ceramiche viene ucciso. Si pensa che il colpevole sia il socio in affari, visto che poco prima i due sono stati protagonisti di un violento litigio. Intanto, Anceschi e Laura devono affrontare le rispettive suocere.

Durante i preparativi del ballo delle debuttanti di Gubbio, una sarta viene uccisa. I Carabinieri pensano sia stata la madre di una delle ragazze partecipanti, che era stata sorpresa mentre rubava. Nel frattempo in caserma tutti cercano di imparare a ballare grazie al maestro Cecchini.

Cecchini decide di mettersi a dieta per riuscire a entrare nell'alta uniforme del matrimonio, in occasione del 25º anniversario di matrimonio. Tuttavia, proprio in questa circostanza, il Maresciallo è vittima di un terrorista che contamina con l'arsenico le bottiglie di acqua naturale Basia dei supermercati. Qualche giorno dopo il commendator Basia, proprietario dell'omonima acqua, viene ritrovato morto avvelenato da una bottiglia contaminata con dell'arsenico. Si scoprirà, però, che l'avvelenatore del commendator Basia, non è lo stesso che avvelena le bottiglie dei supermercati.

Don Matteo ritrova una neonata abbandonata e in fin di vita. Dopo essere riuscito a salvarle la vita, il parroco cerca di scoprire chi abbia abbandonato la propria figlia e sospetta si tratti di una donna rumena che non aveva le possibilità di mantenerla.

Cristina Tabacci, proprietaria di un'impresa edile viene trovata in fin di vita in uno dei suoi cantieri. Trovare il colpevole non è facile, visto che la donna aveva truffato molte persone in città. Nel frattempo Natalina decide di regalarsi un soggiorno in una beauty farm.

Anceschi viene trovato in fin di vita sulla riva di un fiume accanto al cadavere di un imprenditore che lavorava in un oleificio della zona. In seguito al trauma subito, il Capitano ha anche cambiato personalità. Don Matteo è impegnato nel difficile compito di risolvere il caso e aiutare l'amico a ritrovare se stesso.

Due giovani futuri sposi sono costretti a rivedere i loro piani, quando la zia della sposa viene trovata morta nella sua lavanderia, proprio la mattina in cui sono state fissate le nozze. Inoltre, la parrocchia è in fermento per via di tre frati ospiti e per Natalina che ha perso i suoi risparmi. Uno dei tre frati nasconde un pericoloso segreto.

Una giovane ballerina dal futuro promettente viene investita da un'automobile mentre si trova alla guida del suo motorino. I sospetti si concentrano su una sua amica che era invidiosa del suo successo. Intanto, Laura è costretta a tornare a ballare e prende lezioni da Natalina.

Il proprietario di un maneggio viene ucciso all'interno di una stalla. L'omicidio sembra essere collegato anche al furto di un cavallo e, per questo motivo, viene sospettato un fantino che più volte aveva rivendicato la proprietà dell'animale.

L'insegnante del liceo artistico di Gubbio viene ucciso in una galleria d'arte. Si cerca di trovare il colpevole e il principale sospettato è il padre di un'alunna della vittima che aveva accusato il professore di plagiare proprio la figlia.

È in corso la campagna elettorale. Una giornalista viene trovata senza vita e le accuse ricadono su Giovanni Fiorentini, collaboratore di Laura, il sindaco in carica. Anceschi deve indagare sul caso ma rischia di danneggiare la sua compagna, proprio quando si era deciso a chiederle la mano.

Un metronotte viene ferito durante una rapina all'ufficio postale e versa in gravi condizioni. Le indagini dei Carabinieri cercano di scoprire chi abbia aiutato i criminali ad eludere i sistemi di sicurezza. Nel frattempo, Laura e Anceschi sono alle prese coi preparativi delle nozze. Alla fine il sindaco e il capitano si sposano.

Don Matteo si trova sul treno che lo sta portando lontano da Gubbio quando scopre che un barbone è stato pugnalato nel bagno. Dopo questo fattaccio Don Matteo scende e risolve il caso prima di partire. Il primo sospettato è un ultras, che aveva minacciato il barbone per via di una bella macchina fotografica che portava al collo. Intanto, Natalina rincontra un amico di gioventù. La serie si conclude con: la risoluzione del caso, la partenza di Laura e Flavio in viaggio di nozze a Venezia e la partenza di Don Matteo per una missione in Amazzonia, che durerà tre anni.

Don Matteo e Suor Maria sono vittime di un equivoco: i freni della bicicletta di Don Matteo sono rotti e così, non volendo, investe Suor Maria la quale, pensando che il prete sia uno scippatore, scappa dai carabinieri. Intanto un agricoltore, Pierluigi Bonaiuti, viene trovato morto nel campo del suo vicino, il Maresca, nonché ex fidanzato della moglie Alda Coletta, proprietaria dell'agriturismo "Colle fiorito". Dietro questo delitto si nasconde un tradimento.

Sebastiano Bannelli viene trovato in casa in fin di vita colpito da un tagliacarte. Viene subito incolpata Béatriz, la ragazza salvata da Don Matteo in Brasile. In realtà non è stata lei, anche perché era incinta e il bambino è di Sebastiano. È stato qualcuno geloso della storia tra Sebastiano e Béatriz. Intanto il Capitano cerca casa, ma il Maresciallo fa di tutto per trovargli un appartamento lontano dal centro di Gubbio.

Sul greto del fiume viene trovato morto Yussef, un ragazzo arabo che lavorava nella cioccolateria di Vanessa. Lui e Vanessa erano innamorati e lei è accusata di omicidio, ma c'è qualcuno geloso di questa relazione. Nel frattempo il maresciallo e il capitano acquistano un biglietto della lotteria e il maresciallo pensa che il capitano abbia vinto e viceversa. In realtà la lotteria non l'ha vinta nessuno dei due, ma una persona insospettabile, che vuole portare via la persona amata.

Durante una festa viene rapito il nipote di un noto imprenditore, Lamberto Arcuati. I sospetti ricadono sul cugino del padre del piccolo, che aveva grossi debiti e aveva chiesto dei soldi sia al cugino che allo zio.

Fuori da una discoteca, il buttafuori viene investito da un motociclista e i sospetti cadono sull'ex della fidanzata della vittima. Soltanto Don Matteo crede alla ragazza mentre per i carabinieri è colpevole.

Un cantastorie del centro commerciale viene ritrovato morto all'interno dell'edificio. I sospetti cadono sulla guardia notturna del centro commerciale.

Un ciclista viene travolto e ucciso da un'auto pirata della strada, proprio dove sta passando Don Matteo in bicicletta ed è proprio lui che troverà la vittima. Intanto, a Gubbio, si sta svolgendo "Il giro dell'Umbria", a cui partecipa anche il capitano Tommasi.

Una cercatrice di tartufi viene quasi uccisa strangolata mentre sta chiamando il 112. Il marito di lei è il primo indiziato, perché avevano deciso di divorziare e spesso litigavano. Intanto Natalina trova un nuovo amico a quattro zampe, che poi si scopre essere il cane cerca tartufi della vittima.

Durante una sfilata di moda, dentro i camerini cade un proiettore che uccide una cameriera e ferisce l'organizzatrice. I Carabinieri scopriranno che non è stato un incidente. Intanto Don Matteo girando in bicicletta per Gubbio scopre che...

Un medico di un centro specializzato viene trovato morto all'interno della sua abitazione. I Carabinieri sospettano che l'assassino sia un ex paziente il quale crede che il medico gli abbia ucciso la figlia.

Durante una seduta spiritica, la Marchesa beve un bicchiere d'acqua avvelenata che la uccide. Si pensa all'inizio che sia stata la badante della Marchesa, perché il testamento della stessa diceva che tutti i suoi beni sarebbero andati alla badante.

Pamela, una giovane amazzone, muore cadendo da un cavallo nel corso di una gara. Intanto il capitano Tommasi si allena con Cecchini per vincere la gara di canoa anche se l'arrivo di Amanda potrebbe sconvolgere i piani del capitano.

Per le strade di Gubbio sembra aggirarsi un pericoloso lupo. Un professore che voleva evitare che l'animale fosse soppresso viene rinvenuto morto nel bosco.

Un uomo viene ritrovato morto su una giostra, denominata Giostra dei Desideri e, poco lontano, il proprietario viene ritrovato privo di sensi. I sospetti ricadono proprio sul proprietario della giostra, poiché sua moglie aveva deciso di sposarsi con la vittima ma, ancora una volta, Don Matteo riuscirà a far venire a galla tutta la verità, scoprendo che, in realtà, il movente dell'omicidio non è il tradimento amoroso. Pippo, intanto, decide di comprare una nuova casa popolare, a un prezzo molto basso, mentre il maresciallo Cecchini decide di partecipare al programma televisivo "La prova del cuoco".

La figlia di un importante industriale viene rapita e contemporaneamente un piccolo ragazzino del convento di suor Maria viene trovato gravemente ferito all'interno di un pozzo. I carabinieri sono convinti che i rapitori abbiano sorpreso il ragazzino e, per paura di essere scoperti, abbiano gettato il bambino nel pozzo. Don Matteo, però, riuscirà a scoprire la verità, scoprendo che il ragazzino non è stato gettato nel pozzo ma che vi era caduto da solo. Ora tocca solo scoprire il nome dei rapitori.

Attratta dalla voglia di non trascorrere da sola San Valentino, Natalina si reca insieme alle sue due amiche ad un luogo di incontro. Proprio qui conosce un famoso giornalista Alfio Miceli, gentile e ricco che, però, la stessa notte viene trovato senza vita nella redazione del giornale di Gubbio. I sospetti si indirizzano prima verso il fratello di un'amica di Natalina, che, la sera prima, dinanzi agli occhi della simpatica perpetua, aveva aggredito la vittima, minacciandola e poi sul direttore della redazione del Giornale di Gubbio. Don Matteo, però, riuscirà a scoprire il vero colpevole, facendo venire a galla tutta la verità. Natalina, intanto, per una strana fatalità, sembra essere convinta che il capitano Tommasi si sia innamorato di lei.

Una giovane prostituta di colore viene misteriosamente uccisa, apparentemente per un "patto" non rispettato. Vicino alla scena del crimine è presente, all'arrivo dei carabinieri, anche la "maman" la migliore amica della giovane uccisa che pratica il culto Vudù, viene prontamente fermata in quanto maggiore sospettata. Per Cecchini, però, molto sospette si rivelano anche le incomprensibili parole pronunciate dalla stessa "maman" al momento del suo arresto e che sembrano essere la causa del malocchio che perseguiterebbe incessantemente il Capitano.

Un astronomo, molto stimato e conosciuto da tutti, viene trovato senza vita nella Gola del Bottaccione. Il principale indiziato sembra inizialmente essere, agli occhi di tutti tranne che a quelli di Don Matteo, il cognato che poche sere prima aveva fatto la sua comparsa dopo anni di assenza per rivedere la figlia, allevata, dopo la morte della madre, dalla stessa vittima. Impeditegli le sue volontà dall'astrologo, egli aveva minacciato quest'ultimo davanti a numerosi testimoni tra i quali si trovava anche Don Matteo, il maresciallo, Pippo e Natalina. E sempre quella notte degli stani fenomeni luminosi suggestionano Natalina e Pippo che cominciano a credere alla presenza degli UFO. Nel frattempo Patrizia chiede aiuto al capitano per studiare per il test d'ammissione all'università all'insaputa del padre, il quale crede che il capitano si sia innamorato di sua figlia.

In canonica si presenta Raniero, fratello di Natalina, con la figlia piccola Bianca. Quando una giovane donna viene aggredita e ferita con un colpo di pistola, l'uomo finisce tra i principali sospettati perché aveva dato un passaggio alla vittima.

Il capitano Tommasi ed Amanda si prendono una pausa di riflessione; intanto nel prato viene trovata morta una giovane donna: i sospetti, inizialmente, ricadono sul suo ex fidanzato. La donna lavorava in un importante negozio di abbigliamento e Don Matteo ed i carabinieri scoprono che aveva una relazione col futuro marito della proprietaria. La ragazza era stata licenziata il giorno stesso del delitto a causa di un tentato furto. Don Matteo riuscirà a far venire a galla la verità, scoprendo che, in realtà, colui che ha commesso il furto è anche l'assassino.

Un giovane sommelier viene ritrovato morto. Sembra un banale incidente provocato dalla caduta dalle scale, ma i carabinieri sospettano del proprietario della cantina dove la vittima lavorava. La moglie infatti potrebbe aver avuto una relazione col sommelier. Intanto Cecchini, Giulio e Patrizia si trovano ad imbiancare. Per un equivoco il maresciallo si affaccia alla finestra e crede che sua figlia e il capitano si siano baciati. Così Cecchini decide di aiutare personalmente il capitano,ma, mentre li tiene la scala, si distrae quindi Giulio cade e si rompe la gamba. Per farsi perdonare fa dormire il capitano da lui.

Un liutaio esperto viene trovato morto nel suo negozio e sua figlia, una chitarrista famosa mai riconosciuta dal padre, viene trovata col coltello tra le mani. Don Matteo, come sempre, riuscirà a far luce su quanto è avvenuto, scoprendo che, in realtà, il vero colpevole è un'altra persona. A Gubbio, nel frattempo, è giunta un nuovo Medico Legale, vecchia amica del capitano Tommasi: fra i due vi è una bella complicità e Cecchini pensa che sia la donna giusta per il suo capitano.

Durante una festa universitaria, a cui partecipa anche Patrizia Cecchini, una giovane ragazza cade dalla terrazza e viene trovata gravemente ferita alla testa. I medici affermano che nel corpo della giovane vi era una dose elevata di droga e i carabinieri indagano. Inizialmente i sospetti ricadono su un amico stretto di Patrizia, Luca. Intanto il maresciallo Cecchini è in crisi con sua figlia Patrizia.

Giorgio, promettente scenografo, viene trovato morto, apparentemente suicida. Il padre del ragazzo incolpa Don Matteo della disgrazia, colpevole di aver allontanato il giovane dalla sua famiglia. In caserma i carabinieri si preparano per ricevere delle onorificenze. Tutto sembra presagire una bella giornata di festa, ma la signora Tommasi rimane vittima di un incidente d’auto, scontrandosi proprio con Amanda. Sebbene la donna sia appena contusa, approfitta della situazione per attirare su di lei le attenzioni del figlio, rendendogli la vita impossibile.

Don Matteo ed il vescovo si ritrovano all'Aero Club di Gubbio per un lancio con il paracadute in ricordo dei “vecchi tempi”. Dopo il salto dall'elicottero, però, qualcosa va storto e Monsignor Benelli sparisce nel vuoto e ancora vivo. Il capitano Tommasi incontra alla stazione Patrizia Cecchini, la figlia del maresciallo, appena rientrata da un anno di studi a Barcellona, pronta ad inseguire nuovi sogni e progetti. Intanto la canonica si prepara ad accogliere un nuovo piccolo ospite.

Don Matteo è il nuovo insegnante di religione del Liceo Scientifico di Gubbio. Nel suo primo giorno si troverà ad affrontare i “turbolenti” ragazzi della V B ed in particolare Daniele, principale indiziato per la recente aggressione alla prof. d'italiano. Intanto si avvicina l'attesissimo incontro di boxe tra la caserma di Gubbio e quella di Perugia. Il campione eugubino è fuori gioco a causa di un infortunio, ma il maresciallo Cecchini ha già in mente un degno sostituto.

Il proprietario di una grande azienda di allevamento di bestiame viene ritrovato senza vita in fondo ad un dirupo. I segni sul cadavere sono la prova dell'aggressione di un orso. Solo l'intuizione di Don Matteo porterà i carabinieri sulla pista giusta. Intanto il maresciallo presta la sua preziosissima utilitaria al Capitano per andare a prendere Amanda all'aeroporto, ma sulla via del ritorno si verifica un piccolo incidente che si pensa abbia a che fare, almeno all'inizio, con l'omicidio.

In canonica si presenta una ragazza che ha perso la memoria, ma che ha il maglione macchiato di sangue. Non sapendo come chiamarla Agostino decide che si chiamerà Celeste come il colore del suo ciondolo. I carabinieri scopriranno che si tratta di una ragazza straniera fidanzata con un rampollo che però è anche uno spacciatore di cocaina. Celeste è incinta e per proteggerla, il padre del suo bambino non si scagiona dalle accuse fattegli nel momento in cui viene ritrovato in una scarpata il corpo del fidanzato di Celeste, la quale viene a conoscenza del fatto di essere una prostituta. L'episodio si conclude con la completa assoluzione di Celeste in quanto si scopre che è stata legittima difesa. Nel frattempo in caserma arriva un poliziotto americano amico del Capitano Tommasi, che farà perdere le staffe a tutti, tant'è che Giulio esprimerà apertamente la stima e l'affetto che nutre nei confronti di Cecchini.

Un ragazzo disabile è preso di mira dai bulli della scuola. Il "capo" del gruppo viene ritrovato il giorno dopo privo di sensi. Tutto fa pensare ad una vendetta, ma l'intuizione di Don Matteo porterà a galla la verità. Intanto Cecchini e Tommasi sono alle prese con l'arrivo improvviso di Gaia, la ex fidanzata del capitano, da tenere nascosta ad Amanda, naturalmente.

Al liceo di Gubbio si svolgono le Olimpiadi di matematica. Il Prof. Martinoni, promotore dell'evento, viene trovato morto nella sua stanza d'albergo. I sospetti ricadono su Enrico, uno dei ragazzi della casa famiglia di Suor Maria, che dovrà chiedere l'aiuto di Don Matteo per provarne l'innocenza. Intanto la Signora Cecchini decide di partecipare all'imminente torneo di scopone senza il marito. Ha trovato un nuovo compagno con il quale è sicura di vincere. Ma il maresciallo non si arrende.

È tempo di visite per suor Maria: un suo ex fidanzato si presenta a Gubbio e le chiede di ospitarlo per qualche tempo in convento. Proprio in quei giorni Angelica, una delle novizie, viene trovata in fin di vita a causa di un brutto colpo alla testa ed uno dei quadri conservati nel deposito sparisce misteriosamente. Intanto il maresciallo ed il capitano si iscrivono ad un corso di spagnolo per scoprire, il primo giorno di lezione, che la loro insegnante sarà proprio Patrizia Cecchini.

Il bar tabaccheria della famiglia Carrani viene rapinato. Il maresciallo Cecchini avvia subito le indagini, ma è distratto dall'arrivo in città di Cosimo Bordin, un trentenne friulano di Paularo, che sostiene di essere suo figlio... Il quadro, tra rapine, strozzini e debiti di gioco, non è semplice ma don Matteo affianca i carabinieri determinato a far emergere la verità. Mentre deve vedersela anche con Agostino convinto che tutti gli abitanti della canonica siano dei supereroi!

L'arrivo di un vecchio amico di Tommasi, Luca, risveglia lo spirito goliardico del capitano e solleva le gelosie del maresciallo, che si sente messo da parte. A Don Matteo toccherà consolare Cecchini e far luce sulle indagini per l'aggressione di un ufficiale dell'esercito. Intanto Patrizia decide di andare a vivere da sola. L'appartamento che ha trovato, però, ha bisogno di qualche ritocchino. Sarà il capitano Tommasi ad aiutarla, con la promessa di tenere il maresciallo all'oscuro di tutto.

Ad un'asta, viene comprato un prezioso quadro di 30 000 euro legato a una macabra leggenda. Il vincitore dell'asta, viene trovato morto. Si pensa subito che sia stata una maledizione, dovuta a quel quadro che se si toccava si moriva il 30 di quel mese. Don Matteo vuole vederci chiaro e scopre che il gestore della Locanda del Cervo aveva molti debiti con degli strozzini. Nel frattempo Giulio e Patrizia rimangono bloccati alla Locanda del Cervo a causa di un temporale e di un guasto all'automobile. Complice una cenetta a lume di candela e qualche bicchiere di troppo, Giulio regala una rosa a Patrizia, i due sono costretti a passare la notte nella stessa camera senza sapere che proprio della stanza attigua si trovano Cecchini con Don Matteo che tenta di aiutare il Maresciallo a superare una stupida superstizione che a che fare con il quadro, che la vittima aveva comprato.

Una donna è scomparsa e tutto fa pensare a un incidente d'auto. A don Matteo però non è sfuggito un dettaglio, infatti quando Natalina porta Billo a fare una passeggiata nelle vicinanze del luogo dell'incidente trova un anello, don Matteo guarda l'anello per vedere la data e il nome degli sposi, quindi si scoprirà chi è la donna scomparsa. Intanto Amanda fa ordine tra le cose del capitano con l'aiuto del maresciallo. I due buttano accidentalmente un "vecchio" guantone di boxe a cui Tommasi tiene particolarmente.

Gubbio ospita un noto show sul West nel quale è coinvolto anche un ex fidanzato di Amanda. Durante lo Show, "Toro Seduto", che era il protagonista dello show, cade dal Cavallo e sbatte la testa su una pietra che lo uccide. Si noterà che i lacci di sicurezza della sella sono stati tagliati apposta e verrà indagata la ragazza che si occupava di sellare i Cavalli.

Prima dello scontro decisivo tra la squadra del Rugby Gubbio e gli avversari scozzesi, il capitano eugubino viene aggredito in circostanze misteriose. Quando i sospetti ricandono su Sauro, l'allenatore del Gubbio, Don Matteo viene chiamato a sostituirlo. Intanto Patrizia riceve un mazzo di rose da un ammiratore segreto ed il maresciallo crede di averne intuito la provenienza.

Una donna, dopo aver affidato sua figlia a Suor Maria per qualche ora, viene trovata morta all'angolo di una strada. Riuscirà don Matteo a trovare il vero colpevole e dare una nuova famiglia alla piccola? Intanto Natalina fa credere ad un'amica di essere sposata con il capitano Tommasi, naturalmente all'insaputa dell'interessato.

Il castello dei marchesi Sanza è teatro di un omicidio che, secondo i Carabinieri, potrà rivelarsi il seguito di un tentativo di furto finito male. Don Matteo però non ne è troppo convinto. Intanto in caserma fervono i preparativi per il ballo dell'Arma a cui dovrà partecipare anche il capitano Tommasi. C'è un problema però: Amanda, che dovrebbe essere l'accompagnatrice al ballo, si trova a Tokyo per lavoro; il suo posto lo prende Patrizia.

A Gubbio, durante la celebre Corsa dei Ceri, avviene un omicidio. I carabinieri si mettono subito sulle tracce dell'assassino ma le indagini sono ostacolate dalla presenza in caserma del colonnello Di Giovanni, che si dimostra fin dal principio maschilista e molto pignolo, scatenando l'ira di Amanda e Caterina.

Al fiume, viene trovato dentro un'auto il cadavere di un ragazzo che era uscito dal carcere poche ore prima. Intanto, per il Maresciallo Cecchini è finalmente giunta la promozione dopo aver salvato una ragazza dalle fiamme, ma in realtà non è andata veramente così.

Dentro un appartamento, viene trovato il corpo di un medico originario di Gubbio che era tornato dopo tanti anni. Perché era tornato a Gubbio? Susi, la preside del Liceo Scientifico di Gubbio, è sospettata dell'omicidio, perché è stata trovata dentro l'appartamento del medico addormentata sul divano. Intanto, Amanda impone al Capitano Tommasi di richiedere di trasferirsi a Roma, altrimenti lei lo lascerà.

A Gubbio si tiene il concorso di "Miss Umbria" e Natalina fa parte della giuria. Ma anche don Matteo viene coinvolto nel mondo delle miss in seguito alla misteriosa morte di una delle concorrenti. Dopo aver lasciato Amanda, Tommasi si scopre sempre più innamorato di Patrizia. Cecchini, invece, è convinto che il capitano sia innamorato della nuova ausiliaria della caserma.

Determinato a riportarla con sé a Barcellona, arriva a Gubbio, Julio, l'ex fidanzato di Patrizia, la figlia di Cecchini. Il maresciallo farà di tutto per evitare che questo accada, con la complicità, non proprio disinteressata, del capitano Tommasi. Intanto a Gubbio c'è il concorso internazionale di tango, ma il vincitore annunciato viene trovato morto nella palestra dell'oratorio dove si trovava per le prove dello spettacolo. Il capitano Tommasi e il maresciallo Cecchini tentano in tutti i modi di ostacolare le intenzioni di Julio. Intanto il giorno della gara di tango mentre Julio se ne va Patrizia e il capitano Tommasi si baciano e da li nasce un nuovo amore nella fiction.

Torna a Gubbio la madre del piccolo Agostino. La donna, accusata del tentato omicidio di un trafficante d'armi, è ospite della canonica, ma chiede a don Matteo di non rivelare la sua identità al bambino, suscitando la disapprovazione di Natalina. Intanto l'amore tra Patrizia e Tommasi cresce e i due cominciano a frequentarsi, tentando però di tenere il maresciallo all'oscuro di tutto.

Il paese sulle colline umbre fa da sfondo alle riprese del centesimo episodio di una soap di successo. Qualcosa però ne interromperà presto le registrazioni: viene infatti ucciso uno dei protagonisti dello show in circostanze misteriose. Nel frattempo il capitano Tommasi e Patrizia devono decidere come rivelare il loro amore: quale modo migliore di una cena?

Natalina è testimone involontaria dell'omicidio di un pizzaiolo, amico di Don Matteo. I Carabinieri decidono di metterla sotto copertura. Intanto Amanda torna a Gubbio decisa a riconquistare il cuore del Capitano. Dopo lo shock della notizia del fidanzamento di sua figlia Patrizia con il Capitano Tommasi, Cecchini decide di cogliere la palla al balzo diventando complice dell'ex fidanzata di Tommasi.

Cecchini sembra essere riuscito nell'intento di separare Giulio e Patrizia: lei non lo vuole più vedere ed è decisa a partire per Barcellona dove a sua detta Julio è pronto ad accoglierla a braccia aperte. Cecchini non riesce a farsi perdonare dalla figlia e allo stesso tempo non vuole che lei parta, ma nemmeno che stia con il suo superiore. Anche Don Matteo ha i suoi problemi, infatti rischia la scomunica in quanto un ragazzo sostiene che il prete abbia violato il segreto della confessione per favorire le indagini sull'esplosione di un'auto e sulla presunta violenza subita da una ragazza. Don Matteo però non perde le speranze e riesce a dimostrare la sua innocenza e il fatto che è stato vittima di un complotto. Anche questa è risolta, ma la cosa a cui Don Matteo tiene ora è far riappacificare Cecchini, Patrizia e il capitano; così, dopo una chiacchierata con il prete, Cecchini decide di parlare al Capitano e capisce che lui e sua figlia sono davvero innamorati, ma forse è troppo tardi perché Patrizia ha appena preso un pullman che la porterà a Roma da dove prenderà un volo per Barcellona. Inizia così una corsa contro il tempo guidata da Giulio e Cecchini nella speranza di fermare l'autobus e difatti, grazie alla divisa, riescono ad incontrare il bus in una stradina di campagna e a fermarlo. Giulio dichiara il suo amore a Patrizia pronunciando quelle parole che tanto lei avrebbe voluto sentirsi dire: "Ti amo". Un lungo bacio e lo svenimento di Cecchini coronano il sogno d'amore. Cecchini però non demorde e dal giorno dopo accetta la storia d'amore della figlia, ma alle sue condizioni e cioè che Severino li controlli e che con minuzia di particolari informi il maresciallo di ogni loro spostamento. L'episodio termina con la messa celebrata da Don Matteo appena rientrato in "servizio" e il suo sguardo protettore su tutti i partecipanti.

Don Matteo oltre ad indagare sul tentato omicidio di un antiquario, si occupa di Laura, una sedicenne incinta e molto ribelle, figlia di un suo vecchio amico che viene accusato del tentato omicidio. In caserma arrivano il nuovo pubblico ministero Andrea Conti e la madre del capitano Tommasi, che non sa ancora il nome della fidanzata di suo figlio e crederà che quest'ultimo sia fidanzato con la nuova PM.

Durante un rave party una ragazza muore per aver assunto droga tagliata male. Intanto Cecchini non vuole che sua figlia Patrizia e il capitano Tommasi passino un fine settimana romantico da soli.

Dopo che una donna muore per parto, la sua ginecologa viene uccisa. Nel frattempo Tommasi si prepara a un incontro di boxe e deve scegliere il suo coach tra il maresciallo Cecchini e la pubblico ministero Andrea Conti.

Viene accoltellato un falconiere che aveva adottato un ragazzo autistico. Intanto Cecchini per un errore pensa che gli siano rimasti solo sei mesi di vita da vivere e quindi fa tutto ciò che non ha mai fatto finora: compra e inizia a suonare una chitarra elettrica, si compra una moto che ha sempre desiderato ed infine due biglietti per Parigi per lui e sua moglie Caterina, anche se sua moglie quando trova i biglietti pensa che vada con l'amante. Alla fine il maresciallo scopre che doveva fare sei mesi di dieta e poi con sua moglie dopo aver chiarito l'equivoco partono per Parigi.

Don Matteo e i carabinieri indagano sul tentato omicidio di una donna riemersa da un passato lontano. Mentre a casa di Patrizia si sono stabiliti i suoi atletici e giovani amici spagnoli ed il capitano Tommasi dovrà preoccuparsi di non fare brutta figura.

Durante un ricevimento nella villa di una famiglia ricca viene ritrovato un cadavere senza identità. Nel corso delle indagini emerge il passato misterioso di un'amorevole tata. Invece il maresciallo Cecchini crede per sbaglio che sua figlia Patrizia sia incinta.

Una ragazza viene strangolata mentre stava compiendo un pellegrinaggio e successivamente viene scaricata nel fiume; i carabinieri, insieme a Don Matteo, indagano. Nel frattempo Severino viene istruito, senza troppo successo, dal maresciallo Cecchini su come conquistare la donna della sua vita.

Durante una festa di carnevale viene aggredita una giovane che assomiglia alla figlia del padrone di casa. Natalina trova un nuovo, nobile corteggiatore ed il capitano Tommasi è alle prese con la repulsione per il Carnevale.

Un ragazzo che appartiene alla comunità di tossicodipendenti viene ritrovato morto. Il capitano Tommasi compra l'anello a Patrizia; quando sta per dichiararsi, Patrizia gli comunica che è stata accettata per un master a Barcellona. Giulio capisce che non è il momento di farle questa sorpresa e decide di rimandare a un altro giorno: il caso viene risolto e Patrizia parte per Barcellona.

Un vecchio signore di Gubbio viene ucciso da una dose di insulina. Intanto il capitano Tommasi dovrà vedersela con il padre della PM Conti, un colonnello dell'Esercito, che è arrivato in città e lo crede il fidanzato di sua figlia. Invece Patrizia parte per Barcellona.

Un Robin Hood nostrano viene accusato del tentato omicidio di un disonesto pensionato. Cecchini è alle prese con l'esigente suocero che pretende cure e attenzioni.

L'autrice di un romanzo sui pettegolezzi di Gubbio viene ritrovata in fin di vita. Natalina si appassiona al libro scandalistico che provoca malumori in paese. Cecchini interpreta il sogno del capitano e gioca dei numeri al lotto, l'ultimo viene cambiato da Giulio, che si sbaglia e perde 120 mila euro, Cecchini quando lo scopre è arrabbiatissimo. Nel finale viene citato l'evangelico Inno dell'Amore (o della Carità).

Suor Maria è in coma dopo essere stata aggredita e viene sospettato il fidanzato di una novizia, turbato dalla scelta della ragazza di farsi suora. Nel frattempo Natalina dopo una discussione con Don Matteo decide di rifugiarsi nella pace del convento, che riserverà delle sorprese e, mentre il capitano Tommasi cerca casa per la sua fidanzata Patrizia e per lui, il maresciallo si intromette e gli fa perdere un'occasione.

L'odiata matrigna di Valeria, la migliore amica di Assuntina Cecchini, viene ritrovata morta. La figlia del maresciallo idolatra la sua amica, che si è messa davvero nei guai.

I carabinieri e don Matteo indagano sulla modella di punta di una sfilata per abiti da sposa che qualcuno ha cercato di soffocare nel suo letto. Il capitano Tommasi va alla fiera della sposa, dove subirà i battibecchi di madre e suocero sui dettagli del suo matrimonio con Patrizia.

Una prostituta viene uccisa e viene collegata ad un'orfana, campionessa di scherma che ha trovato nella sua allenatrice e nel marito una seconda famiglia. Laura inizia ad avere dei dubbi sull'idea di abbandonare sua figlia.

Una cameriera viene ritrovata morta nella spa (centro termale) di un hotel e viene accusato un uomo, e la sua futura sposa, che è una ragazza madre, dalla disperazione chiede aiuto a don Matteo per collaborare alle indagini, ma anche di starle vicino. Nel frattempo a Gubbio arriva una zia suora sorda del capitano Tommasi insieme a una consorella mezza cieca perché scappate dal convento dove risiedevano le quali daranno filo da torcere al povero capitano ad esempio allestiranno un altare dedicato al santo patrono di Gubbio il vescovo Ubaldo Baldassini e con i ceri incendieranno la tenda di una finestra del soggiorno della casa del capitano Tommasi.

Il figlio di due genitori separati in lizza per affidamento sparisce, i carabinieri e don Matteo indagano. Il maresciallo Cecchini dopo un colpo alla testa perde la memoria, e diventa un carabiniere preciso e irreprensibile.

Un commercialista famoso per la sua generosità verso i meno fortunati viene ucciso. Don Matteo e i carabinieri indagano e la prima indiziata è la cognata che ha avuto atteggiamenti intimi con la vittima. La sparizione di un carico di droga fa finire nei guai Tommasi. Intanto in caserma Severino e Ghisoni sono impegnati ad organizzare l'addio al celibato del capitano ma saranno ostacolati sia dal maresciallo Cecchini sia dal capitano che è ancora nei guai.

Don Matteo e i carabinieri indagano su una sedicenne scomparsa e il rischio è che la ragazza sia vittima di un maniaco. Nel frattempo il maresciallo Cecchini è intenzionato a riportare serenità tra Patrizia e il capitano Tommasi, però la situazione peggiora.

Una ragazza sorda, che non riesce a far accettare il suo handicap alla madre, si trova coinvolta nell'omicidio dell'amministratore del cementificio in cui lavora. Don Matteo prende a cuore il caso e collabora alle indagini per scagionare la ragazza. Poi gli indizi portano a sospettare un amico della ragazza che si occupa dell'inserimento dei disabili. Intanto Fernando chiede a Patrizia di aiutarlo nella conclusione di un contratto a lui affidato a Perugia ma questo fa scatenare la gelosia al capitano Tommasi.

Viene aggredita una giovane e si sospetta del padre del suo fidanzato, quindi don Matteo indaga perché crede nella sua innocenza. Intanto Laura è gelosa dell'ex fidanzata di Dario mentre il fidanzamento tra Patrizia e il capitano Tommasi è in crisi e il previsto matrimonio rischia di saltare. Cecchini vede la Conti e il capitano Tommasi che si baciano e resta deluso.

Rocco Brizzi, un operaio che, dopo una vita di lavoro, viveva insieme alla moglie Viola in una roulotte poiché ingiustamente licenziato, successivamente viene ritrovato morto. Nel frattempo il capitano Tommasi è a pezzi all'idea che Patrizia abbia intenzione di tornare a Roma, così decide di occuparsi delle indagini a tempo pieno mettendo la propria vita a rischio.

A Gubbio arriva il padre della bambina di Laura per comunicarle che i suoi genitori reclamano a tutti i costi l'affidamento della nipote. Poco dopo il nonno di Ester si reca da don Matteo per dirgli di convincere Laura a rinunciare alla bambina. Laura non vuole separarsi da sua figlia, così il prete decide di aiutarla, rimanendo ingiustamente vittima di un tranello: viene denunciato per molestie da Emanuela, una donna appositamente pagata dal nonno di Ester. Quest'ultima prima si presenta in canonica da don Matteo e poi fugge dai Carabinieri sostenendo che il prete l'ha molestata; successivamente il marito di Emanuela la ritrova in fin di vita, con il prete vicino con le mani macchiate di sangue. Don Matteo finirà in carcere con l'accusa del tentato omicidio della ragazza che lo ha denunciato. Successivamente si verrà a sapere che il nonno di Ester ricatta don Matteo, in quanto farà ritirare la denuncia se Laura rinuncerà alla piccola. Don Matteo si darà da fare al massimo per riuscire a dimostrare la sua innocenza prima che la situazione precipiti. Nel frattempo il capitano Tommasi e Patrizia tentano di riorganizzare in fretta e furia il matrimonio, tuttavia senza don Matteo non è la stessa cosa. Cecchini si dimentica di confermare il ristorante trovando rimedio solo con la tavola calda "Da Ciccio" che si affaccia sulla strada ed è specializzata in panini con la porchetta. Alla fine viene arrestato il vero colpevole, il padre di Ester, che, disgustato dal proprio padre, voleva convincere Emanuela a ritirare la denuncia. Don Matteo, Cecchini e Tommasi corrono al matrimonio (che era iniziato già da 30 minuti), trovando ad attenderli una Patrizia meravigliosa. Tra la commozione generale, soprattutto quella di Giulio, si celebra il matrimonio tanto atteso. Cecchini è preoccupato, costretto a portare tutti gli invitati "Da Ciccio". Nel finale, si scopre però che tutta Gubbio e Don Matteo avevano preparato agli sposi un rinfresco fuori dalla chiesa.

Un uomo viene trovato in fin di vita vicino al convento di suor Maria. Nel frattempo una vecchia conoscenza della religiosa è uscita dal carcere e si reca in convento. Stanco, si getta sul letto e così facendo lascia cadere un portafoglio. Maria insospettita lo apre e con stupore nota che la carta d'identità non corrisponde al nome del ragazzo. Preoccupata, chiama allora don Matteo che nonostante i 100 km che li separano, prende la bicicletta e parte per Spoleto, città dove lavorano anche il capitano Tommasi e Cecchini, trasferiti anch'essi da Gubbio per via dell'accorpamento delle caserme promosso dalla spending review. Il capitano Tommasi vive nella casa dei suoceri insieme a sua figlia Martina, avuta insieme a Patrizia, morta tempo prima in un incidente. Quindi i carabinieri e don Matteo iniziano ad indagare; Don Matteo scopre il movente dell'omicidio, cioè il presunto rapimento del figlioletto della vittima da parte di un orefice e di sua moglie: dopo una serie di colloqui "forzati" da parte dell'uomo che poi era stato ucciso (che si scoprirà appartenere alle forze dell'ordine), con la moglie dell'orefice, il marito di quest'ultima aveva deciso di affrontarlo, ne era nato uno scontro e l'agente era stato ferito in testa da una pietra. Intanto don Matteo tramite un orologio riesce a risalire all'aggressore, quindi si precipita dall'orefice, seguito dai carabinieri. Alla fine, don Matteo riceve una lettera urgente del vescovo, che gli annuncia che sarà trasferito nella parrocchia di Spoleto, non solo per l'esigenza delle funzioni religiose, ma anche perché un tale, che ogni giorno inviava una lettera al vescovo, lo supplicava di trasferire don Matteo a Spoleto. Ovviamente il mittente era l'amico e maresciallo dei carabinieri Cecchini.

A Spoleto viene trovato morto un telepredicatore americano bigamo. Don Matteo e i carabinieri cominciano ad indagare. Intanto il maresciallo Cecchini cerca di far fidanzare il brigadiere Ghisoni con la PM Bianca Venezia, che è stata lasciata dal fidanzato con cui si doveva sposare. Laura viene lasciata da Dario perché ha conosciuto una nuova ragazza all'università di Perugia. Nel frattempo, nella parrocchia di don Matteo, è arrivato un giovane e ribelle inquilino, Tomàs, di origini argentine. Il giovane, grazie a don Matteo, è stato affidato alla parrocchia come alternativa al carcere. Laura cerca di stabilire un primo contatto con lui, ma invano: l'unica persona che riesce a legare con lui è la piccola Ester, la figlia di Laura.

Una cara amica di Don Matteo in un momento di crisi lo invita a casa per confessargli un segreto. La donna racconta di tradire il marito con un bel giovanotto, gestore di un poligono di tiro. Laura sembra indifferente dal fatto che Dario l'ha lasciata da sola con la bambina e Natalina prende le sue difese. A casa Cecchini Martina deve imparare una poesia per la scuola e arriva anche la madre di Tommasi. Invece della poesia però la bambina ha imparato una parolaccia in siciliano, che le procurerà guai a scuola e con la maestra. In caserma invece arriva la nuova PM Bianca Venezia. Successivamente, in un posto appartato, solitamente frequentato da giovani coppie, la donna viene trovata sulla propria auto in fin di vita, ferita da un colpo di pistola. I carabinieri indagano, ovviamente imitati da Don Matteo. Il marito della donna viene interrogato e Don Matteo si presenta a testimoniare riguardo alla relazione extra-coniugale della donna. Intanto le forze dell'ordine arrestano l'amante della vittima, dato che il proiettile estratto dal corpo di quest'ultima risulterà essere un calibro 22, usato nei poligoni di tiro. Inoltre verrà ritrovata una pistola semiautomatica che, la balistica toglie ogni dubbio, è l'arma del delitto. Questa risulterà registrata all'amante della vittima. Per il capitano Tommasi e il maresciallo Cecchini il caso è risolto ma non per Don Matteo, che a causa di alcuni indizi, sposterà i suoi sospetti sul professore marito della vittima. Invece Lia ha un problema: deve iscriversi alla specializzazione in Chirurgia, ma non è laureata. In canonica Laura esce spesso perché ha una relazione. Appurati i suoi sospetti, Don Matteo si precipita immediatamente a casa del professore che con strafottenza confesserà di aver sparato alla moglie perché deluso del comportamento di lei. Bianca non ha una buona impressione di Cecchini e per questo il capitano gli affida un lavoro,che però scambierà con dei disegni della bambina. La madre di Giulio vorrebbe che il figlio e la nipote si trasferiscano a Roma. Don Matteo si reca subito in caserma e spiega la situazione al capitano, al maresciallo e alla dr.ssa Venezia, che però sostiene che la preziosa testimonianza non è sufficiente per accusare il marito. Successivamente il professore riceve una telefonata dall'ospedale e gli viene riferito che la moglie si è svegliata dal coma. Il marito, sorpreso e preoccupato, si precipita all'ospedale e furtivamente si reca nella stanza della moglie, con l'intenzione di ucciderla. La donna è irriconoscibile. Arrivato al suo capezzale, il professore prende un cuscino e cerca di soffocarla ma in quel momento irrompono il capitano, il maresciallo e ovviamente anche don Matteo, sicché il professore verrà arrestato. La donna nel letto era la sorella della vittima, che da quel momento si prenderà cura di lei.

Don Matteo trova un lavoro per Tomas da un suo amico meccanico. Cecchini riceve una chiamata riguardo ad un premio che potrebbe vincere: un viaggio per due a Venezia. Gli verranno fatte delle domande personali su una persona a lui molto vicina, e Cecchini sceglie sua moglie, e viceversa. Al momento di dare il numero però lo scambia con quello di Tommasi. In canonica alcuni bambini dell'incontro di catechismo prendono di mira un'altra compagna che ha perso recentemente il padre, sembra ucciso dalla nuova compagna che viene trovata con l'arma del delitto.

Diana, giovane ragazza e promessa del nuoto, destinata a partecipare alle olimpiadi, viene lasciata da Oscar, il suo ragazzo, anch'egli nuotatore. In un giorno non molto lontano dalle olimpiadi, Diana fa preoccupare tutti in piscina non presentandosi agli allenamenti. Quel giorno in piscina, casualmente si trova anche don Matteo perché aveva accompagnato una bambina. Tutti allarmati si preoccupano per Diana, che solitamente è puntualissima. La madre collabora ad allenarla assieme ad una ragazza, campionessa che anni indietro fu espulsa dalle Olimpiadi perché trovata positiva al doping. In piscina, la madre ed il padre di Diana, Oscar, Don Matteo e l'allenatrice, si stanno chiedendo dove può essere Diana. Si scopre che la madre di Diana ha chiesto a Oscar di lasciare Diana, considerandolo un ostacolo alle Olimpiadi della figlia, e che gli ha offerto un posto in un importante gara in cambio di ciò. La donna ha giocato sul fatto che Oscar ultimamente non è tanto in forma ed i suoi tempi sono scarsi, sicché Oscar accetta senza esitare e lascia Diana. Il padre di Diana si arrabbia moltissimo con la moglie. Oscar è sinceramente pentito di averla lasciata, confiderà successivamente a Don Matteo, che gli crede. Subito dopo, Diana viene trovata in stato di coma sotto un ponte. I carabinieri indagano e accusano Oscar, ma Don Matteo grazie a degli indizi, risale alla vera colpevole, l'allenatrice di Diana. La ragazza aveva scoperto di aspettare un bambino e voleva tenerlo, ma, ingenuamente, si era confidata con la sua allenatrice, che voleva che abortisse, perché Diana non poteva assolutamente non gareggiare, sostenendo che una cosa importante come le Olimpiadi capitano solo una volta nella vita. Ma Diana non intendeva più allenarsi, voleva tenere il bambino. Le due cominciarono una lite, e in un attimo di ira, l'allenatrice spinge Diana, che cade dal ponte. Oscar ha accolto felicemente la notizia della gravidanza di Diana, che si risveglia dal coma. Nel frattempo anche i carabinieri, tramite le analisi della scientifica, risalgono all'autrice dell'aggressione, quindi la vanno ad arrestare. La trovano piangente insieme a Don Matteo, perché sinceramente pentita del gesto ma anche delle eccessive pretese avute in passato nei confronti di Diana.

Una coppia con una bambina di sei anni decide di vivere in una casa in campagna senza nessun genere di tecnologia, mangiando esclusivamente ciò che producono. La maestra della bambina, attenta alla vita dei propri alunni, nota la situazione e in qualche modo si intromette, fino a quando non viene trovata uccisa. Per i carabinieri è tutto chiaro: dalle indagini emergono varie scontri tra la "famiglia anti tecnologia" e la vittima, sicché arrestano la madre della bambina. Don Matteo da qualche settimana insegna nella scuola della maestra uccisa, ed è sospettoso circa le conclusioni dei carabinieri, perciò a modo suo indaga. Intanto Laura è stata licenziata dal bar, mentre Tomàs, per racimolare qualche soldo e cercare la sorella, si mette a combattere clandestinamente in lotte senza esclusione di colpi, organizzate in punti nascosti in campagna. Casualmente Laura con un amico si reca a vedere un combattimento, e vede Tomàs, sorpresa e dispiaciuta, non riesce a non dirlo a Don Matteo, che una sera si reca sul posto e lo convince ad andarsene, mettendo a tacere con una mossa, ma senza fargli male, l'organizzatore dei combattimenti che si era avvicinato minacciosamente. Successivamente Don Matteo, tramite una macchina fotografica digitale, custodita dalla bambina, riesce a vedere dalle fotografie rimaste in memoria che la vittima aveva una relazione con il preside della scuola. Senza pensarci due volte, salta sulla bicicletta e si reca dal preside, cui senza mezzi termini gli mette in faccia la realtà, fin quando il preside crolla e confessa: voleva l'amante ma, per mantenere un'immagine da persona rispettabile, voleva continuare a essere sposato con la moglie e vivere felicemente anche con i suoi figli. La maestra era stanca di questa situazione e aveva deciso di lasciarlo, quindi nella lite, il preside la spinge, lei cade, batte la testa e muore. Nel frattempo anche i carabinieri sono risaliti alla colpevolezza del preside e si recano da lui per arrestarlo, ma, come al solito, lo trovano in compagnia di don Matteo che anche questa volta li ha preceduti. L'uomo precedentemente incolpato, esce dal carcere e compra un computer alla figlia. Evidentemente, ha compreso che il mondo va accettato per quello che è, quindi non è giusto sacrificare la propria figlia per un proprio punto di vista.

Un ingegnere per problemi di salute risiede in una casa di cura. Un giorno alla settimana era solito uscire con la figlia, ma un giorno non fa rientro. Don Matteo, amico dell'ingegnere, si preoccupa molto e insieme allo staff della casa di cura riferisce la scomparsa ai carabinieri. Dopo non molto l'ingegnere verrà ritrovato seduto in auto in coma, per una crisi glicemica, e poco distante viene ritrovata la figlia morta. Partono le indagini e si scopre subito che la donna, da sempre spacciata per figlia, in realtà è la donna delle pulizie dell'azienda del vecchio ingegnere. Quest'ultimo ha realmente una figlia che vive in Toscana con il compagno e con lui gestisce un agriturismo, ma non ha un buon rapporto con lei. La figlia viene avvisata dello stato di coma del padre e si reca immediatamente in Umbria. Al suo arrivo conosce Don Matteo. Anch'egli fino alla morte della donna delle pulizie, credeva che fosse la vera figlia. I carabinieri indagano, e altrettanto fa Don Matteo. Intanto si avvicina il compleanno del capitano Tommasi, e il maresciallo Cecchini organizza una festicciola in stile siculo e, sotto consiglio della nipote, gli regala la possibilità di fare un volo con il parapendio. Il cerchio si stringe e Don Matteo, grazie alle sue intuizioni, collega all'omicidio il compagno della figlia, che lei aveva conosciuto in una casa famiglia. L'assassino però non aveva mai confessato alla compagna di conoscerne il padre.

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Un'alunna di Don Matteo viene accusata di tentato omicidio dopo che un ragazzo che la tormentava su un social network viene aggredito. Assuntina torna da Roma per presentare a papà Cecchini il suo nuovo fidanzato, ma la famiglia di lui si rivela molto snob.

L'esplosione di una bomba rudimentale ferisce due giovani delle scuole medie, uno lievemente, mentre all'altro l'esplosione provoca lo stato di coma. Il bambino ferito lievemente è figlio di un medico molto dinamico, questi infatti è sempre in Africa, ove investe anima e corpo per la realizzazione di un ospedale. L'ordigno rudimentale è esploso vicino all'automobile del medico, cui don Matteo si era appena recato per donare l'offerta della parrocchia alla realizzazione dell'ospedale; i giovani vengono soccorsi. I carabinieri avviano le indagini e subito dopo appare tutto chiaro: il denaro è stato sottratto dal fondo del progetto ospedale dal cognato del medico, che viene posto in stato di fermo. Don Matteo non ci vede chiaro, indaga ed emerge una realtà completamente diversa. A realizzare la bomba era stato il figlio del medico e l'amico, nel tentativo di dissuadere lo sconsiderato gesto, era rimasto ferito. Per fortuna dopo qualche giorno il ragazzo esce dal coma. Il motivo per cui il figlio del medico voleva far esplodere la macchina del padre era per attirare la sua attenzione e per poter trascorrere insieme il compleanno, dato che il medico per motivi di lavoro era sempre via. Nel frattempo Lia finisce nei guai per aver posato per un calendario; Tommasi, che sta per ricevere un’onorificenza cittadina, l’aiuta affinché Cecchini non lo scopra.

Mentre Don Matteo e i carabinieri indagano su di uno studente modello coinvolto in una rapina, Spoleto è in fermento per una gara di tango in cui Natalina e Cecchini competono l’uno contro l’altro.

Una escort appena innamorata di un giovane operaio, decide di cambiare mestiere e diventare infermiera. Un giorno però viene aggredita brutalmente, in fin di vita verrà condotta in ospedale, ove rimarrà in stato di coma fino al risveglio. I carabinieri indagano. La giovane coppia, parrocchiani di don Matteo, suscitano in quest'ultimo un senso di giustizia, per cui questi, senza esitazione comincerà un'indagine parallela a quella dell'arma dei carabinieri. Nel frattempo Lia, nipote prediletta del maresciallo Cecchini, si ritroverà in una spiacevole situazione, avendo in buona fede trovato lavoro presso l'agenzia Lady Star che, dai modi poco trasparenti e ambigui, recluta giovani e belle ragazze per avviarle con discrezione alla prostituzione, ed è la stessa per cui lavorava la vittima. Fortuna vuole che il capitano Tommasi, accortosi che Lia stava cadendo nella trappola della gestrice dell'agenzia, riesce quindi a salvarla senza che il maresciallo Cecchini lo venga a sapere. Il capitano per questa situazione è talmente preoccupato da rivolgersi addirittura a don Matteo per un saggio consiglio. Le indagini dei carabinieri per l'aggressione alla prostituta, portano tutte al fidanzato della vittima, don Matteo però non ci vede chiaro e, fortunatamente, riesce dunque a prendere la pista giusta, ovvero quella dell'hotel. Infatti emergerà che il marito della proprietaria dell'hotel, perseguitava la vittima, era ossessionato e, quando la povera vittima si era innamorata del giovane operaio e, quindi lasciò il lavoro della prostituta, l'uomo continuerà a chiamarla con insistenza, fin che una sera la vittima stanca, andrà in hotel per chiarire una volta per tutte questa pesante situazione, la moglie dell'uomo e proprietaria dell'hotel, accecata dalla gelosia, aggredisce la ragazza. Don Matteo percepisce la colpevolezza della signora, grazie a una composizione di fiori che, la donna pentita dello sconsiderato gesto, porterà in ospedale alla vittima. I carabinieri invece arrivano alla soluzione tramite i tabulati telefonici, così quando arrivano per arrestare il marito, la donna ammetterà subito la propria colpevolezza.

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Lia deve accompagnare Martina all'asilo e prende l'auto del capitano che le raccomanda di non fermarsi e di andare direttamente a scuola, ma lei invece si ferma a comprare la merenda alla bambina. Mentre sta scendendo dalla macchina viene spinta da un ragazzo che sale sull'auto e scappa portando con sé la bambina. Lia scoppia in lacrime e chiama immediatamente Giulio e il maresciallo che si mettono immediatamente sulle tracce del ragazzo. Vanno a scuola perché un uomo dice che ha visto la scena e ritiene sia stato Alberto D'Ambrosio, il figlio della farmacista. Nella classe del ragazzo c'è Don Matteo che insegna religione. Alberto arriva in ritardo e appena vede i carabinieri scappa. Il capitano Tommasi lo prende e lo strattona facendogli sbattere la testa al muro. Nel frattempo Ghisoni accompagna Martina che è stata ritrovata, dal capitano ma il ragazzo si sente male e viene portato all'ospedale dove si scopre avere un ematoma cerebrale provocato da una violenta botta in testa. La madre del ragazzo sporge denuncia e il capitano viene accusato di violenza nei confronti di un minore. Così decide che fino a quando il caso non verrà risolto non andrà a lavoro e consegna così la pistola al maresciallo Cecchini. Alla fine si scopre che un compagno di Alberto, Ivan gli procurava ricette false dallo studio medico del padre che poi Alberto usava per prendere dalla farmacia della madre dei farmaci con i quali si drogavano lui e la sua amica Federica. Quella mattina lui e Federica, avevano rubato dei farmaci dalla farmacia e mentre li prendevano hanno litigato e lei gli ha dato una botta in testa facendogli sfondare il vetro. Appena si è ripreso è uscito fuori ed ha presola prima macchina che ha trovato. In realtà l'impiegato della farmacia aveva riconosciuto Alberto, ma per non mettersi nei guai e perdere il lavoro non ha detto niente. Le accuse sul capitano sono cadute e lui è potuto tornare al lavoro. Nel frattempo Natalina è alle prese con le multe e Tomàs convince Laura ad affrontare la maturità. Cecchini invece soddisfa tutti i desideri di Martina perché crede che abbia subito un trauma quando hanno rubato la macchina.

Dopo quasi due anni dalla scomparsa, la madre di una ragazza scomparsa si presenta dai carabinieri, sostenendo che una sua amica veggente ha avuto delle visioni nelle quali ha trovato il punto nel quale si troverebbe il corpo della ragazza scomparsa (Cecilia). Recatisi sul posto, i carabinieri trovano la scena che la veggente aveva descritto e il fascicolo viene riaperto. Le analisi dei RIS rivelano che si tratta di omicidio. Il primo ad essere sospettato è Guido Meregalli, ex fidanzato e responsabile di una cooperativa per persone con problemi sociali per la quale Cecilia lavorava. Le accuse, però si rivelano infondate non appena si scopre che il cappello rosso ed il computer che Cecilia aveva la sera della scomparsa si trovano nelle 2 case di Olga, vecchia amica di Cecilia, scappata a Milano. Interrogata dai carabinieri, confessa di avere venduto i diritti di un'applicazione che a Cecilia stava realizzando. Si pensa che sia stata lei ad averla assassinata ma alla fine si scopre che l'assassina, in realtà è Silvia, una ragazza divenuta cieca poco dopo la morte di Cecilia a causa di una malattia alla retina. La motivazione che questa fornirà sarà una sorta di messa in secondo piano da parte della cooperativa che voleva trasferirsi in America per avere più finanziamenti. Inoltre confessa di aver passato personalmente tutte le informazioni alla veggente per farla sembrare veggente. Il caso di Cecilia si intreccia con il ritorno di Carlo Brega, fidanzato della PM Bianca Venezia che è fermamente intenzionato a chiederle nuovamente la mano. Tommasi, però è convinto che Carlo tradisca Bianca con un'altra donna ed incarica Cecchini di fare delle indagini. Sembra che tutto vada secondo la teoria di Tommasi ma in realtà i due hanno preso una svista.....

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I carabinieri ricevono una richiesta di riscatto per i rapimento di un uomo a capo di una ditta di latticini. Mentre Ceccini si impegna a risollevare il morale di Bianca, in crisi totale dopo la rottura definitiva col fidanzato, Laura aiuta Tomàs a ritrovare sua sorella.

Gaetano, proprietario del Campo Volo dove sta lavorando Tomàs, viene trovato in fin di vita proprio dal ragazzo. Mentre Don Matteo indaga, Cecchini passa qualche giorno all'insegna del benessere in una Spa, lasciando il capitano Tommasi circondato da sole donne.

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Una tossicodipendente va a vendere in un Compro Oro una collanina rubata alla figlia, la quale ha una relazione segreta con il commesso del Compro Oro. La mattina dopo il proprietario del Compro Oro, Vito Intonti, viene trovato morto nel suo negozio e nei registri non è segnata alcuna collana. I Carabinieri prima sospettano la signora tossicodipendente, poi sua figlia e il commesso, ma Don Matteo è sicuro dell'innocenza di tutti e tre. Don Matteo fa confessare a Cesare, uno spazzino comunale, di rubare oro per Intonti, che lo trasformava in denaro con l'aiuto di persone poco raccomandabili. Il Capitano conduce un'operazione per scoprire la banda, ma, un colpo di pistola ferisce Severino che va in coma. Don Matteo però capisce che non possono essere state le persone arrestate dal Capitano ad aver ucciso Intonti. Intanto i Carabinieri scoprono che la collanina è stata venduta a un altro Compro Oro da Cesare... Severino si risveglia dal coma e durante la festa Lia dice a Cecchini di essere entrata nell'Arma ma Cecchini si rivela contrario. Natalina continua a frequentare Aldo ma le sue condizioni di salute non sono delle migliori: infatti ha continui mal di testa...

Alla fine le intenzioni di Aldo emergono come un fulmine a ciel sereno. Questi (sua madre è morta in carcere, Don Matteo l'aveva costretta a confessare la sua colpevolezza, e Aldo pensa che sia solo colpa del prete) dopo aver ucciso un medico (suo cliente di un farmaco) pone infatti la sua vendetta a Natalina, per colpire indirettamente don Matteo, e farlo soffrire. Natalina dopo vari svenimenti finisce in ospedale, e risulterà che da tempo il suo organismo assume veleno. Ma anche in ospedale sotto osservazione, a distanza di giorni non se ne viene a capo, e i vari responsi risulteranno ancora positivi al veleno. È come se Natalina anche in ospedale continuasse ad assumere veleno! Alla fine solo don Matteo ne intuisce la fonte: a provocare l'intossicazione è un braccialetto che lo stesso Aldo gli aveva appositamente regalato, appunto per vendicare la propria madre, arrestata per l'omicidio del marito. La donna insieme all'allora Aldo bambino, finì in carcere perché, convinta dal giovane parroco don Matteo, confessò alle autorità l'estremo gesto che l'aveva spinta ad uccidere il marito. Il carcere ha segnato profondamente Aldo, in primis per la morte della madre, ma anche per l'abbandono di don Matteo, che promise di aiutarli e invece seguì la sua vocazione e si recò in Brasile come prete missionario. Don Matteo si sente estremamente in colpa, ma non tollera che Natalina sia oggetto di vendetta, sicché lo fa arrestare, ed ella per fortuna riesce a sopravvivere. Intanto in casa Cecchini sale la tensione, per le seguenti motivazioni: Giulio riceve una proposta di lavoro dal ROS a Roma, ed è combattuto circa la scelta, e si aggiunge che Lia è stata promossa al concorso dell'arma, sicché è stata costretta ad avvisare lo zio maresciallo, e questi infuriatosi, punta il dito sul capitano. Le due contendenti, Lia e Bianca, con un colpo di testa nella stessa sera, arrivano a baciare con passione il bel capitano. Il giorno dopo però, entrambe le donne si pentono e, prima una poi l'altra, si scusano per il comportamento impulsivo, ma è chiaro che le ragazze sono pazzamente innamorate, ed entrambe hanno un grande ostacolo: Bianca quello dell'amicizia di sempre, Lia quello della parentela (infatti ella è la cugina di Patrizia, moglie deceduta del capitano). Cecchini giunge alla ragione, naturalmente solo dopo aver parlato con don Matteo, sia per la scelta di Lia che per quella del genero. Ecco il giorno dei saluti, Giulio e Martina partono per Roma, quasi tutti piangono, in particolare Lia e Bianca. Inaspettatamente però, dopo aver percorso una manciata di km, il capitano viene assalito da una forte emozione dopo che la figlia con una frase sentita dal nonno, dice: «Papà non essere triste! Lo sai cosa dice sempre il nonno? Che la felicità è dove stanno le persone a cui vuoi bene». Il capitano dunque ferma l'auto e torna indietro, quindi annunzia, a coloro che minuti prima aveva salutato: «Veramente non andiamo più a Roma, niente è più importante delle persone che ami».

Celeste, la zia di Tomàs, il ragazzo argentino che vive in canonica con Don Matteo dalla nona stagione, arriva a Spoleto. Il maresciallo Cecchini architetta il fidanzamento del capitano Tommasi con la maestra di Martina, la figlia del capitano. Tommasi è però innamorato di Lia, la nipote del maresciallo Cecchini, appena diventata carabiniere. Intanto Don Matteo va dall'avvocato Faggi per ritirare il certificato di proprietà della sua Ape e vede che la signora Faggi è stata aggredita. Una sera, Lia e Tommasi, vanno a fare una romantica passeggiata da fidanzati, ma Cecchini, ignaro dei loro sentimenti, li interrompe e conduce Tommasi a casa per presentarlo alla famiglia della maestra Marisa. Il maresciallo architetta una cena per Marisa e il capitano Tommasi, dove per caso vi sono anche Lia e il suo fidanzato di Roma, Daniele. Nel frattempo viene arrestato il marito della signora Faggi. Egli anni prima aveva provocato la perdita del figlio in un incidente d'auto. Di conseguenza i rapporti tra i coniugi si erano deteriorati e i carabinieri sospettano il marito di aver aggredito la moglie durante un ennesimo litigio. Laura e il prof. Alberto Torre, studente dell'università di Perugia, diventano amici. La zia di Tomàs ha un figlio che vuole affidare all'avvocato perché venga dato in adozione. I Carabinieri scoprono il segreto di Celeste e la arrestano. Tomàs scopre il segreto di sua zia e vuole tenersi lui il bambino. Lia si separa dal suo fidanzato e si fidanza con Tommasi. La signora Faggi si risveglia e racconta che ad aggredirla era stata l'assistente dello Studio Legale. Ovviamente Don Matteo lo aveva scoperto prima dei Carabinieri e si era recato nello Studio Legale prima degli altri. La zia di Tomàs viene rilasciata e se ne va con il bambino.

Lia sospetta di essere incinta, ma ha paura a fare il test e rinvia anche di dire al maresciallo dell'amore fra lei e Tommasi. Un allenatore di Ju Jitsu viene minacciato dal padre di un suo allievo. In seguito l'allenatore viene ucciso. Cecchini crede che Tommasi sia ancora fidanzato con Marisa. Martina, la figlia del capitano, vede suo padre baciarsi con una donna. Non vede bene chi è, ma va subito a dirlo al nonno, che pensa che sia la maestra. Il capitano indaga sull'omicidio dell'allenatore. La madre del ragazzo il cui padre aveva litigato con l'allenatore, da ragazza era stata violentata dallo stesso allenatore. Per questo i Carabinieri arrestano suo marito. Ester, la figlia di Laura, sogna di conoscere suo padre e Tomàs cerca di rintracciarlo. Cecchini organizza una cena in famiglia con la maestra Marisa. Lia scopre che è incinta, ma non trova il coraggio di confessarlo al capitano. Nel frattempo riescono a scoprire qualcosa riguardo alla morte di Germano, l'allenatore, attraverso delle telecamere delle gioielleria. Don Matteo parla con la direttrice della palestra dove è stato ucciso l'allenatore. Si scopre che l'allenatore era il padre biologico dell'allievo. Tomàs va a Roma e organizza un incontro tra il padre di Ester e la bambina. Cecchini trama per far mettere insieme Marisa e il capitano. La maestra fa una visita a sorpresa al capitano mentre Lia è in casa sua. Lia le fa una scenata e la manda via una volta per tutte. Tommasi confessa a Cecchini che è fidanzato con Lia e il maresciallo resta turbato. Laura porta Ester all'incontro con suo padre, ma lui non ha il coraggio di farsi vedere. Ester confessa a Tomàs che le sarebbe piaciuto un padre un po' come lui. Tomàs e Laura si fidanzano. Ad uccidere l'allenatore, è stata la direttrice della palestra.

È sera, e Don Matteo sulla strada guidando la sua ape nota una ragazza di nome Sabrina che cammina da sola, allora si offre di darle un passaggio e lei dice che deve andare in carcere. La mattina seguente, Natalina e Don Matteo escono per comprare una nuova bicicletta per Ester, ma sulla strada notano che una donna è stata investita e poco più in là dove si trova il cane della donna, Nerone, il cadavere di un uomo. I sospetti ricadono su Sabrina che viene accusata di omicidio, allora Don Matteo cerca in tutti i modi di aiutarla. Nel frattempo Cecchini progetta una nuova vita per la famiglia Tommasi - Cecchini, avendo già pronta la planimetria della villa bifamiliare dove si trasferiranno il capitano e Lia dopo essersi spostati e il maresciallo con sua moglie. In seguito all'investimento di Marisa Bosco, Nerone è affidato alle cure della perpetua e anche Ester si prende cura del cane. Nel frattempo arriva a Spoleto la sorella di Cecchini, la madre di Lia, la signora Concetta, che è felice di vedere tutti tranne il capitano, per il quale serba rancore visto che ha convinto la figlia a diventare carabiniere. Seguendo i consigli (sbagliati) di Cecchini, Giulio cerca di avvicinarsi alla futura suocera con dei regali a lei graditi, in particolare il libro dell'Iliade tradotto da Quasimodo che la signora cercava da tanto tempo, ma in seguito a numerosi equivoci Concetta pensa che sia il fratello a farle questi regali. Tomàs è nei guai con la finanza per il suo lavoro con gli aerei, in seguito a numerose tasse non pagate che si accumulano in una somma di 50.000 euro che non sa come pagare. Grazie ad un giornale di gossip si viene a sapere che Alberto, il professore di Laura, è molto ricco e la giovane pensa di aiutare Tomàs con i soldi che potrebbe chiedere ad Alberto, ma Tòmas si rifiuta e caccia via Laura in malo modo togliendo valore a quel bacio datosi la sera prima dicendo che di ragazze ne aveva baciate molte. Durante le indagini si viene a sapere che Gino Felluca, la vittima, assumeva ex carcerati per le agevolazioni fiscali, per pagare meno tasse e la sera del delitto qualcuno aveva preso la pistola della vittima. La sera del compleanno di Concetta, la signora e il capitano, nonostante lei abbia scoperto che i regali erano opera di Giulio, litigano, e in mezzo a questa situazione Lia soffre perché non sa come dire a Giulio che lei è incinta di Daniele. Grazie alle parole di Lia, Tommasi chiede scusa alla suocera e i due si riappacificano e la signora si fa una nuova idea del capitano. Nel frattempo, prima Don Matteo, e poi i carabinieri, scoprono che l'assassino è una dipendente della fabbrica che ha aperto un negozio da parrucchiere, Alice Licini, che la sera del delitto aveva preso la pistola della vittima in fabbrica per intimorire la direttrice della banca, Marisa Bosco, dato che voleva toglierle il fido bancario non rientrando nei suoi parametri e ciò avrebbe causato il fallimento del suo negozio e i servizi sociali avrebbero portato via sua figlia, la vittima tenta di fermarla ma dalla pistola parte un colpo e Gino Felluca muore. La signora Concetta parte per la Sicilia e Lia finalmente dice al capitano di essere incinta. Tomàs dice di essersi fatto prestare dei soldi da una banca di Perugia, ma in realtà a darglieli è stato un usuraio.

In chiesa i bambini giocano con Don Matteo, ma ad un certo punto una bambina di nome Francesca si sente male ed arrivano i soccorsi. Subito la madre accusa due egiziani Samuel e Kayla Negash di aver contagiato la figlia con l'ebola. All'ospedale i due fanno le analisi del sangue, ma Samuel viene aggredito e partono le indagini, che vedono subito sospettata la madre di Francesca, ossessionata dalle malattie in seguito alla morte del marito. Nel frattempo Tommasi non vuole parlare con Lia, e il maresciallo Cecchini dopo aver origliato e capito male una telefonata tra Giulio e Lia capisce che Tommasi ha messo incinta la maestra Marisa. Allora il maresciallo fa di tutto per risolvere la faccenda facendo incontrare l'assessore Zazzi col capitano ma capito il disguido, Lia confessa allo zio di essere incinta di Daniele, e Cecchini sviene. Nel frattempo Don Matteo e i carabinieri scoprono che Samuel è stato ferito dalla cognata che pur di restare con l'adorata nipote, avendo il cognato intenzione di ripartire per l'Egitto dopo gli episodi razzisti sempre più frequenti in paese, avrebbe fatto di tutto. Presa dalla disperazione tenta addirittura di suicidarsi con la sua pistola ma le amorevoli parole di Don Matteo la salvano. A fine puntata Tommasi e Lia parlano e il capitano decide di lasciare Lia, lasciandola nello sconforto. Don Matteo a fine puntata, riesce ad ottenere attraverso il consenso del giudice un lavoro per Sabrina, che lavorerà nel capannone degli aerei con Tomàs.

In chiesa Don Matteo trova una parrocchiana di nome Elisa che prega in preda alla disperazione in seguito ad un nuovo atto di violenza subito dal marito, allora Don Matteo cerca di confortarla, ma arriva il marito che con forza porta la moglie via. La sera tardi, sotto la pioggia, arriva in canonica la stessa Elisa che in lacrime confessa al prete di aver lasciato il marito. Allora Don Matteo le propone di stabilirsi di stabilirsi da Suor Maria, ma Elisa vuole rimanere con lui. Intanto a Spoleto arriva Assuntina, che confessa al padre di aver abbandonato l'università, facendo arrabbiare parecchio il padre. Cecchini da quel momento in poi tratta duramente la figlia facendole pagare i pasti e aiutandola a trovare lavoro presso un bar dove dovrà lavorare sodo, dicendo che la figlia deve assumersi le proprie responsabilità. I carabinieri arrestano dapprima Elisa, anche se poi si accorgono che l'ora del decesso corrisponde al momento in cui si trovava in canonica, poi su Sergio Manni, un idraulico, che rivendica l'appartenenza di un quadro in mano alla vittima, essendo essa un antiquario. A Spoleto arriva anche Daniele e Lia gli confessa di essere incinta di lui e così Daniele ha intenzione di andarsene. Uscita dal carcere, Elisa insiste nel voler restare in canonica con Don Matteo e lo bacia, ma nel frattempo arriva il capitano che li vede. Una lettera anonima dove si dice che Don Matteo ed Elisa abbiano una relazione complica la situazione tanto che Tommasi è costretto ad interrogarli, ma nonostante ciò le cose scritte sulla lettera risultano delle falsità. Assuntina è stufa, e dice al padre di non essere come Patrizia e quindi come i genitori volevano che fosse, e il padre comprendendola decide di accettare le sue scelte. L'omicidio, infine, si scoprirà che è stato proprio ad opera di Elisa che in seguito alla solita lite sfociata con le botte, ha pugnalato il marito e alzando la temperatura della casa per ritardare l'ora del decesso, si è creata un alibi grazie proprio a Don Matteo, al quale rivelerà di aver intenzione di ricominciare una nuova vita con lui, ecco il motivo che ha spinto la donna a mandare quella lettera anonima al capitano. Don Matteo si occupa anche di Sabrina che lavorerà come ragioniera nel campo volo di Tomàs, il quale stressato dalle continue oppressioni dell’usuraio, si mostra scorbutico nei confronti di Sabrina, la quale però capisce i guai finanziari del giovane. Assuntina, nel frattempo, riesce a trovare lavoro presso la Tim come tecnico di rete. A fine puntata Daniele accetta di restare con Lia e il bambino e con un bacio ritornano insieme.

Durante un temporale, il capitano nota una macchina ferma e preoccupato decide di controllare: all'interno c'è la fidanzata del PM Gualtiero Ferri, Margherita, che spaventata colpisce Giulio con la portiera e scappa. A Spoleto, intanto, muore il proprietario di un bar, Stefano Allievi, e i sospetti cadono su un ludopatico, Marco Costello. Il ragazzo ha già problemi in famiglia, visto che ha subìto sfratto (in seguito bloccato) insieme a sua madre, Anita, che non conosce i problemi del figlio. Nel frattempo, in caserma, procede l'identikit del presunto aggressore, che risulta somigliante al capitano. Per proteggerlo Margherita chiede di rifare l'identikit ispirandosi a Pippo, che vede passare per strada. Notando la somiglianza, il PM comincia a vessare Pippo. Alla fine grazie all'astuzia di Don Matteo, si riesce a capire chi ha ucciso il proprietario del bar, la donna delle pulizie, Federica Ortuso, che ha perso il marito, anch'esso ludopatico. La donna aveva scoperto che il proprietario del bar rubava i soldi dalle slot che i giocatori perdevano e non poteva accettare che fosse commessa una tale ingiustizia. Alla fine si capirà il malinteso che ha visto il povero Pippo coinvolto in una faccenda alla quale era del tutto estraneo.

Durante una festa una ragazza malata di tumore, Giada, cade dal tetto di un edificio e il giorno dopo viene trovata in fin di vita. Accanto alla ragazza vengono trovati dei medicinali tra cui dell'ossicodone, i sospetti inizialmente sono puntati verso lo psicologo che l'aveva in cura secondo cui l'avrebbe spinta al suicidio. Ma secondo Don Matteo Giada non si sarebbe suicidata anche perché lo poteva fare in altri modi per via dei medicinali che portava con sé. Solo dopo si scopre che Giada è stata spinta e i sospetti cadono sul fidanzato Tommy che era anch'esso presente alla festa avendo come movente la gelosia, infatti la ragazza era stata vista da lui con un altro ragazzo. Solo alla fine si scoprirà che a far cadere Giada è stata la sua compagna (Elena), grazie all'oncologo che gli ha prescritto l'ossicodone (il padre di Elena), durante un disperato tentativo di suicidio Giada ci ripensa ma Elena si voleva buttare lo stesso (per il fatto che la sua vita era un fallimento) e nel litigare Elena spinge giù Giada. Intanto il maresciallo Cecchini e il capitano Tommasi regalano al PM per il suo compleanno una bottiglia di champagne che avevano preso senza chiedere il permesso a Daniele. Solo dopo scopriranno che in quella bottiglia non c'era champagne ma era un'opera d'arte contenente urina di capriolo. Solo grazie a Margherita che sbadatamente rompe la bottiglia i due carabinieri riescono a salvare la loro carriera. Tomàs scopre dentro un barattolo di crema appartenente a Sabrina una bustina con della polvere bianca, in seguito l'affronta e Sabrina gli spiega che gli serve per sopravvivere e gli racconta anche quando il suo ex fidanzato stava per uccidere la madre.

Don Matteo accompagna Suor Maria dal medico e appena entrati trovano il corpo senza vita del medico, dr. Tagliabue, e di una donna incinta in fin di vita, Sara. In un primo momento le accuse cadono sul fidanzato (Ivan) ex tossico che era venuto a Spoleto per ricostruire una famiglia con Sara, secondo i carabinieri i due ragazzi stavano rubando nell'ambulatorio del dottore, il dottore li ha scoperti, ha colpito Sara e Ivan ha ucciso il dottore. Solo in seguito si scoprirà, attraverso l'assicuratore Tardoni che ha truffato la compagnia assicurativa insieme al dottor Tagliabue, che Sara doveva perdere il bambino. Quando Ivan scopre la verità vuole andarsene, ma Don Matteo lo convince a rimanere. Sara dopo che si risveglia dal coma non si ricorda più niente e racconta che aveva deciso di non perdere più il bambino, ma il dottore non era d'accordo e per questo è convinta che sia stata lei ad ucciderlo. Alla fine si scopre che ad uccidere il dottore è stata la sua assistente Ada che non era d'accordo con il folle intento del dottore, Don Matteo lo scoprirà anche dal fatto che Ada sapeva il sesso del nascituro. Infine Sara chiamerà la sua bambina Ada. Intanto durante l'assenza del PM Cecchini si rifugia a casa di Margherita per scappare dalle amiche melomani della moglie mentre Ester chiede aiuto a Tomàs per costruire un planetario che deve presentare a scuola ad un progetto di scienze: in un primo momento il ragazzo accetta, ma poi per via del lavoro non può più aiutarla. Alberto per fare in modo che la bambina non ci rimanga male lo costruisce lui dicendogli poi che l'ha fatto Tomàs.

Viene trovata in fin di vita una ragazza (Valentina) amica di Don Matteo che è cresciuta nella casa famiglia di Suor Maria. I sospetti cadono su Davide che era stato visto da dei testimoni la sera prima litigare con la ragazza e dalla continue chiamate che ha fatto alla ragazza. In seguito si scoprirà che la ragazza usava siti d'appuntamento online e che aveva un appuntamento con un altro uomo. Quell'uomo non è altro che Nicola Damiani suo datore di lavoro che ammette di non averla aggredita, ma che voleva solo avere un rapporto con lei, i carabinieri naturalmente non gli credono e lo arrestano. Alla fine si scoprirà, anche grazie a delle macchie di olio che sono state trovate nel vestito di Valentina, che ad averla aggredita è stata Marcella una collega di Valentina che l'aveva vista quella sera insieme al capo. Severino ha una nuova fidanzata, ma il maresciallo Cecchini non gli crede e pensa che sia una fidanzata immaginaria solo alla fine scoprirà che la ragazza è vera in un primo momento (anche perché origlia male le telefonate) avrà un cattivo approccio con la ragazza pensando che sia una escort e gli dice di lasciare stare suo nipote solo dopo scoprirà che la ragazza lavora in un albergo come cameriera. Intanto Alberto viene nominato cittadino onorario e invita tutta la canonica ad una festa dove parteciperanno anche Tommasi che accompagnerà Margherita, Cecchini, Lia e Daniele. Alberto andrà insieme a Laura mentre Tomàs farà in modo che ad esserci ci sia pure Sabrina grazie ad un permesso speciale del carcere. Tra le due coppie (Alberto-Laura e Tomàs-Sabrina) nascerà del tenero.

Viene trovato morto un uomo indiano (Salman) che faceva piccoli lavoretti per conto di un supermercato. Il proprietario dice di non conoscerlo, ma la moglie dell'uomo (Adele) ricorda che il direttore (Malusci) voleva fare un contratto a Salman nonostante stessero facendo tagli del personale. Cinzia (collega di Salman) confessa a Don Matteo che Malusci voleva fare il contratto a Salman perché aveva scoperto quattro dipendenti che rubavano nel supermercato e che erano stati licenziati. Tra questi due erano ancora a Spoleto (i coniugi Riganò). I carabinieri scoprono inoltre un messaggio di minacce sul cellulare della vittima spedito da Tiziano Riganò. I carabinieri arrestano quindi Tiziano. In seguito i sospetti cadranno su Malusci, si scopre che Malusci voleva riassumere i dipendenti che erano stati licenziati e scoprono inoltre che nella sua memory card ci sono foto con una sua dipendente con cui Salman ricattava Malusci. Don Matteo trova tra gli effetti personali di Salman delle poesia nella sua lingua, da queste poesia si scoprirà che ad aver ucciso Salman è stata Adele (la moglie del proprietario) che Don Matteo trova nell'intento di suicidarsi. Infatti Adele aveva una relazione con Salman e le poesie erano dedicate a lei, Salman voleva che Adele lasciasse il marito ma lei non voleva e durante un litigio lo ha ucciso. Il maresciallo Cecchini è alle prese con la sua maestra delle elementari che ha perso la memoria e non si ricorda nemmeno del maresciallo e pensa che sia un altro suo alunno (l'ultimo della classe). Cecchini con i suoi metodi cerca di fargli tornare la memoria. Intanto Lia decide di andare a vivere a Roma con Daniele. Prima di partire però cerca di riavvicinarsi con Tommasi, ma quest'ultimo ormai non ne vuole più sapere perché ormai aspetta un bambino da Daniele. Tomàs intanto cerca di usare la fantasia per divertirsi insieme a Sabrina nonostante lei non possa allontanarsi dal campo volo e non può fare le cose che fanno le altre ragazze.

Un ragazzo, Francesco, viene travolto da un'auto e il giorno dopo viene trovato da Don Matteo. Francesco purtroppo perderà l'uso delle gambe e non potrà più camminare. I sospetti cadono su Lavinia Kruger, la figlia di un ricco costruttore che alcuni avevano vista ubriaca a una festa la sera prima; in quella festa c'era anche Francesco. Inoltre la vernice trovata nel motore di Francesco sembra essere quella dell'auto di Lavinia. Durante la visita dei carabinieri Lavinia e i suoi genitori negano che sia stata lei dicendo che l'auto gli era stata rubata. Intanto in ospedale Riccardo, un amico di Francesco, dice a Don Matteo che si era lasciato con Lavinia perché si era innamorato di un'altra. Quella sera la madre di Lavinia incontra Giuliano, il padre di Francesco e i due litigano. La mattina seguente la signora Kruger viene trovata in fin di vita e viene subito arrestato il padre di Francesco che era stato visto la sera prima litigare con la Kruger. Don Matteo non crede che a colpire la Kruger sia stato Giuliano perché l'aggressione è avvenuta nel parcheggio, mentre loro hanno discusso vicino alla panchina. In seguito Lavinia confessa a Don Matteo e poi ai carabinieri che è stata lei ad investire Francesco e che poi il padre ha coperto tutto. Tuttavia si scoprirà che l'auto che aveva provocato l'incidente aveva il sedile troppo alto per Lavinia; inoltre Don Matteo trova nell'auto un fermacapelli appartenente alla ragazza di Riccardo. Infatti è stato Riccardo ad investire Francesco (visto che Lavinia non era in grado di guidare) e in seguito ad aggredire la Kruger che aveva inavvertitamente sentito la loro conversazione. Intanto Assuntina annuncia al maresciallo che vuole andare a convivere con il suo ragazzo; inizialmente Cecchini non è d'accordo, ma dopo si convince perché scopre (fraintendendo tutto) che il ragazzo è il figlio di un ricco produttore di olio. Solo alla fine scopre la verità mettendo in ridicolo anche il capitano Tommasi. Tomàs invece litiga con Sabrina che gli dice di essersi approfittata di lui solo perché gli serviva un lavoro per stare fuori dal carcere. Alla fine si riappacificano anche grazie a Laura che va a Parigi insieme ad Alberto ed Ester.

Durante una notte qualcuno spara ad una donna (Clara). La mattina seguente Don Matteo raggiunge Michele un amico di Clara che sta sulla sedia a rotelle che gli dice che non riesce a mettersi in contatto con Clara nonostante l'abbia chiamata diverse volte. Il parroco scopre che la donna è stata uccisa. In seguito si scopre che la vittima aveva denunciato per truffa il dottor Nicastro (suo datore di lavoro) che viene convocato in caserma. Nicastro rivela che la donna aveva una relazione con lui e che quando si sono lasciati lei l'ha denunciato inoltre afferma che quella sera non si è mosso dalla clinica, affermazione confermata anche da Roberta e dal signor Romei suo dipendente. Michele è convinto che ad uccidere Clara sia stato Nicastro che in passato si era rivolto a lui per poter riacquistare l'uso delle gambe e che in seguito scoprendo che era un truffatore voleva smascherarlo insieme a Clara. Inoltre Michele dice a Don Matteo che nella clinica l'unica che potrebbe parlare è Roberta che però è manovrata dal dottore. Don Matteo durante una visita nella clinica cerca di convincere Roberta che però non gli dice nulla mentre Nicastro cerca di convincerlo che non è un truffatore. In seguito Michele durante una corsa con la sua hand-bike accusa un malore provocato da un medicinale trovato nella sua borraccia stesso medicinale usato da Roberta che si autoaccusa di aver avvelenato Michele per proteggere il dottore. In seguito Nicastro svela a Don Matteo che non è stato lui ad uccidere Clara perché Clara lo amava ancora. Infine si scoprirà che è stato Michele ad uccidere Clara perché voleva lasciarlo e si è avvelenato per far cadere le colpe su Nicastro. Cecchini e Tommasi sono alle prese con Margherita che si deve sposare con il PM. Margherita spinta anche dai due carabinieri vorrebbe scegliere le cose che piacciono a lei, ma Gualtiero è sempre in disaccordo e vuole che per il suo matrimonio Margherita indossi l'abito appartenuto a sua madre. Abito che finirà prima in un cassonetto, poi da un contadino che lo usa come spaventapasseri ed infine finirà strappato e modificato da Natalina. Inoltre Margherita vincerà un concorso riguardante il suo libro di favole che Cecchini aveva senza dir niente a lei spedito. Ma Gualtiero sarà anche contrario a questo dicendo che non è il momento di pensare alle favole. Alla fine Margherita reagirà alle imposizioni del PM sia per quanto riguarda il vestito sia per la premiazione del suo libro.

Una ragazzina di 12 anni (Enrica) con un futuro d'attrice viene trovata in coma dalla madre nel suo letto dopo aver bevuto una bottiglia d'acqua contenente barbiturici. I sospetti cadono subito sulla sorella (Cecilia) perché è stata lei a portarle la bottiglia, inoltre, anche da quello che aveva scritto in un tema, nutre un profondo odio verso sua sorella per via del suo successo e delle particolari attenzioni che hanno i suoi genitori verso di lei ed infine per il fatto che non è andata in ospedale a vedere sua sorella. In seguito si scoprirà che Enrica doveva partecipare ad un provino ed è stato disdetto da qualcuno che diceva di essere suo padre. Dalla chiamata risulterà essere Raffaele (il coach di recitazione di Enrica) che in passato è stato anche un attore con grande successo fino a diventare con il tempo un personaggio di poco conto. Lui afferma di non aver avvelenato la ragazza anche se voleva disdire il provino considerato da lui troppo impegnativo per la ragazza, ma i carabinieri non gli credono e lo arrestano. Raffaele parlando con Don Matteo pensa che qualcuno sia rubato i suoi medicinali di cui ne faceva uso per tener lontano la droga per avvelenare Enrica pensando che sia stato Davide amico di Enrica. Davide spiega a Don Matteo che non va a trovare Enrica perché non sta simpatico al padre e appena se ne esce dall'aula si scorda un'agenda in cui ci sono dei disegni. Don Matteo dopo aver visto quei disegni capisce che ad avvelenarsi è stata Enrica che non voleva partire in America, ma non sapeva come dirlo per non deludere i genitori. Intanto Margherita dopo essersi lasciato con Gualtiero va a stare da Tommasi. Il PM sconvolto fa di tutto per scoprire chi sono Nina e Giuliana le amiche di Margherita che lo hanno fatto allontanare da lui. I due carabinieri nonostante ciò cercano di distrarlo fino a quando pedinando Margherita scoprirà che Nina e Giuliana sono Cecchini e Tommasi promettendogli che gliela farà pagare. Tomàs invece organizza nel suo campo volo insieme a Laura la festa di compleanno di Ester con tema la neve. Tomàs organizza una bellissima festa lasciando entusiasmati Ester, Pippo, Don Matteo e la stessa Laura. L'indomani Laura per ringraziarlo gli prepara la colazione e gli chiede se può venire alla festa della famiglia a scuola di Ester. Il ragazzo accetta, ma gli strozzini a cui deve i soldi gli fanno saltare un capannone con una bomba e questo porta Tomàs a non andare alla festa. La sera Laura lo rimprovera per non essere venuto alla festa e Tomàs gli risponde dicendo che lei e sua figlia non sono il centro del mondo.

Un ragazzo viene aggredito e trovato in fin di vita in un sottopasso. La prima sospettata è Giulia, una donna che si mette nuda in un sito di cam-girl e secondo i carabinieri Riccardo l'aveva scoperto e minacciava di dirlo alla figlia se non si fossero incontrati. In seguito i carabinieri scoprono nel computer di Riccardo un sacco di video di scherzi e pensano che l'aggressore potrebbe essere la vittima di uno di questi scherzi. In seguito sotto accusa finisce Milone, un insegnante di Riccardo che era stato vittima dei suoi scherzi e che gli aveva spedito dei messaggi con minacce, inoltre Milone aveva avuto uno sgradevole episodio con il padre del ragazzo che gli aveva sbattuto in testa il registro per aver messo un brutto voto al ragazzo. Dopo Delia (la figlia di Giulia) scappa di casa dopo un litigio con la madre, due studenti raccontano a Don Matteo che Riccardo voleva fare uno scherzo a Delia dandole un appuntamento nel sottopasso per farle vedere le foto della madre. Dopo Don Matteo trova Delia che gli racconta di non essere mai andata all'appuntamento perché il fratello Giuseppe, mentre lei era sotto la doccia, aveva risposto a una chiamata di Riccardo in cui disdiceva l'appuntamento. In realtà Giuseppe ha simulato la chiamata e per proteggere la sorella è andato all'appuntamento al posto della ragazza e lì ha aggredito Riccardo dopo che gli ha insultato la madre facendogli vedere anche le foto. I due carabinieri sono ai ferri corti con il PM che li minaccia di trasferirli a Gallicchio al primo errore che faranno. In seguito, dopo una serata passata con Margherita per festeggiare la pubblicazione del suo libro, si ritirano a casa con lei ubriaca, e dopo averla accompagnata a casa, Margherita esce di nascosto e ritorna a bere. In seguito Tommasi e Cecchini non hanno più notizie di Margherita e non riescono a mettersi nemmeno in contatto con lei. Da una descrizione fatta dalla figlia di Cecchini che l'aveva vista la sera prima e da alcune telefonate strane del PM pensano che Gualtiero abbia rapito Margherita e che la vuole drogare. Alla fine pedinando Gualtiero scoprono Margherita in un casolare con vicino delle siringhe e minacciano il PM di arrestarlo dandogli dell'assassino e del maniaco. Solo che le siringhe erano della sua cavalla incinta che anche Margherita era venuta a trovare. In canonica invece Pippo si allena con Natalina per partecipare ad una gara di burraco, ma Pippo non ha proprio idea di come si giochi e si fa aiutare da Alberto che gli suggerisce da un auricolare che mosse fare; alla fine prende coraggio e si toglie l'auricolare, pensando di farcela da solo, ma torna a casa e dice di aver perso.

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I nostri amici si trovano a Gubbio per festeggiare i 20 anni da quando don Matteo ha fondato l'associazione amici del Brasile. Durante la festa incontra un suo vecchio amico (Salvatore Marrias) che si scopre essere l'usuraio di Tomas. La sera Salvatore viene assassinato e la colpa cade su Tomas perché per la stradina dove è morta la vittima sono stati trovati tracce di pneumatici della moto del ragazzo, che era andato a cercare Sabrina. Poco dopo Sabrina va a parlare con don Matteo e gli spiega che aveva dato appuntamento a Salvatore: per salvare Tomas era disposta a consumare con lui, ma lui rifiutò. Così la colpa cade su Sabrina. Alla fine si scopre che è stato il " capo" di Marrias a ucciderlo perché Salvatore voleva smettere di rovinare le persone. Intanto Margherita ha procurato dei danni a Tommasi mandandolo più volte al pronto soccorso. Il PM Ferri ospite di Porta a Porta si addormenta durante la diretta per colpa dei biscotti di Margherita.

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Don Matteo trova in fin di vita un giovane investigatore privato. Intanto Lia ritorna a Spoleto ed oltre a fare i conti con le ultime novità deve affrontare anche la sua famiglia.

I carabinieri indagano su un uomo che soffre di un disturbo della memoria e potrebbe aver ucciso una donna senza ricordarsene. Intanto il parto di Lia è alle porte e Cecchini non vuole trovarsi impreparato

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