Carter torna dall'Africa e viene accolto freddamente da Abby, che gli chiede di restituirle le chiavi dell'appartamento.

Neela Rasgotra, una nuova studentessa, prende servizio al Pronto Soccorso e subito riceve le attenzioni di Pratt, attirandosi così le ire di Chen. Una donna sviene al volante della propria auto: nell'incidente resta gravemente ferita insieme ai suoi 3 figli. Neela si comporta bene nel prestarle le cure. Carter cura un uomo con Aids conclamato.

Il Pronto Soccorso è nel caos a causa di importanti lavori di ristrutturazione; la Weaver continua ad urlare contro gli operai impegnati nei lavori. All'accettazione del Pronto Soccorso arriva una telefonata shock che annuncia che Luka Kovac è morto. Carter decide di ritornare in Congo per recuperare il corpo del collega.

Carter fa ritorno in Congo per recuperare il corpo di Luka. La zona in cui dovrebbe trovarsi il corpo è però troppo pericolosa per entrarvi. John, quindi, con l'aiuto di Gillian convince Debbie, un'addetta della Croce Rossa che deve recarsi proprio in quella zona, a permettergli di accompagnarla.

Tramite flashback veniamo a sapere che dopo la partenza di John per Chicago, Luka ha contratto la malaria ed è stato fatto prigioniero dai Mai Mai. I soldati hanno risparmiato la vita del medico solo perché lo hanno creduto un prete, dopo che una sua paziente gli aveva donato una croce ed i Mai Mai lo avevano visto pregare poco prima della sua esecuzione.

Alla fine Carter, Debbie e Gillian trovano Luka in fin di vita e lo mettono su di un volo diretto a Chicago. Carter dà al medico una lettera per Abby con la quale la informa della sua decisione di fermarsi per un po' di tempo in Africa

Luka Kovac arriva al County General e viene ricoverato per le cure del caso. Gillian consegna ad Abby la lettera di Carter. Tutti al pronto Soccorso vengono a conoscenza del suo contenuto dopo che Frank la recupera dalla spazzatura e la passa in giro. Una cena fra Pratt e Chen viene disturbata dai genitori della ragazza. L'incontro convince Chen a troncare la sua relazione col medico di colore.

L'assicurazione di Romano non copre la protesi al braccio. Così l'uomo si procura un bell'uncino, il che lo rende ancora più intrattabile del solito. Alcuni degli infermieri più esperti si trovano l'orario di lavoro ridotto a causa di tagli sui costi ed organizzano di conseguenza uno sciopero selvaggio: Romano pensa di licenziarli tutti. Susan Lewis cura un'adolescente con un grave problema cardiaco.

Al County si presentano nuovi medici: uno di questi è Nick Cooper, uno studente al secondo anno. Coop viene quasi ucciso da Neela quando, durante un attacco di asma, riceve una dose troppo massiccia di epinefrina.

Confident second-year resident Pratt wants to prove his abilities when he works the graveyard shift (11 p.m. to 7 a.m.), but his heroics sometimes backfire. Pratt shows contempt for a man, Ed Gamble, who presents no symptoms of disease but temporarily loses his speech.

Ben Hollander is a distraught architect whose degenerating eyesight causes him despondent while a spirited new nurse, Samantha Taggart joins the staff. Elsewhere, disaster strikes when the doctors suspect a mother is abusing her child while Dr. Corday learns something shocking about the charismatic Dr. Dorset, and Dr. Archie Morris is overwhelmed by the chaos and grisly conditions of life in the E.R.

Pratt and Kovac clash over a miscarriage-prone young woman, Denny, who arrives to deliver a premature baby. Pratt wants to make heroic efforts to save the unborn child, while Kovac is adamantly against spending vast amounts of money to keep the forever sickly baby alive.

To everyone's amazement, Lewis makes a date to share a home-cooked dinner with the elderly Ben Hollander, her depressed patient who is going blind.

On Thanksgiving Day, a helicopter crash outside the ER leaves several injured, and kills Dr. Romano. Alex tries to bring Sam and Luka together.

Neela helps treat two Amish teens who were in a car crash. Sam argues with Dr. Kovac when he pays too much attention to her son.

Dr. Carter celebrates Christmas at a clinic in the Congo dealing with low supplies and anti-Americanism, but in the meantime, falling for an AIDS worker named Makemba.

Neela e Abby affrontano il turno più duro che ci sia mai stato all'Unità di Terapia Intensiva Neonatale: un volto familiare del pronto soccorso finisce per avere un urgente bisogno di aiuto...

Dr. Carter's girlfriend makes an impression as she observes ER operations. Dr. Gallant is almost shot during a domestic incident. Dr. Weaver dedicates a center to the memory of Dr. Romano.

Sam treats an abused, pregnant teen. Dr. Carter introduces African girlfriend Makemba to wintertime. ER chaos shocks a risk-assessment expert. Dr. Pratt and Abby restrain a man who has tuberculosis.

Carter misses his pregnant girlfriend who has returned to Africa. A family of four is rushed to the emergency room after suffering carbon monoxide poisoning from their faulty furnace--forcing the claustrophobic Neela to accompany a newborn baby into an extremely uncomfortable hyperbaric chamber.

Sam è preoccupata perché una vecchia fiamma africana è andata a trovare Kovac, mentre uno degli ex pazienti del County General, per vendetta, minaccia mezza Chicago con un carro armato. Intanto Corday è affascinata da un collega chirurgo e un membro dello staff diventa un paziente a causa di un infarto.

Carter sticks up for Neela when the other attendings doubt her future in the ER. Neela caves to the pressure and accidentally gives a patient the wrong medication. Gallant takes the blame for her though. Sam and Luka try to plan Alex's birthday party. Frank visits on his way to therapy. Chen's home nurse quits after her dad behaves poorly.

L'episodio si concentra principalmente sul crollo di un magazzino vuoto nel quale è coinvolta anche Sandy, la compagna della Weaver. Sandy morirà in sala operatoria sotto gli occhi di Kerry. Alla fine dell'episodio si vede Kerry andare a casa dei parenti di Sandy per riprendersi suo figlio ma le viene negata la visita e buttata fuori nonostante le resistenze della donna.

Micheal Gallant viene richiamato dall'esercito: deve partire per l'Iraq.

Sam si trova alle prese col suo ex, nonché padre di Alex, ripiombato nella sua vita all'improvviso; questa notizia le causerà alcune incomprensioni con Luka.

Pratt si trova ad eseguire un esame del seno ad un cliente che resta sconvolta da tale visita e lo accusa di molestie, allertando la Weaver che attaccherà il medico. Lo stesso Pratt, si ritrova ad assistere due vittime di un incidente. La donna, Reena Carlson, chiede di lui, avendolo conosciuto settimane prima nella metro, ma il medico non la ricorda.

Abby prosegue il suo tirocinio in psicologia destando anche in questo reparto l'apprezzamento di tutti i suoi colleghi e/o superiori; il tirocinio però, visti i trascorsi clinici della sua famiglia, la mette sempre un po' a disagio. Nel contempo Neela, autoconvintasi di non essere adatta al pronto soccorso comincia il tirocinio nel laboratorio di ricerca per seguire degli studi sull'ictus.

Intanto si presenta una giovane donna, Jordan Dann, in preda a crisi convulsive che, in seguito a varie analisi eseguite da Pratt e Kovac, risulteranno essere effetti di traumi inconsci.

Al Pronto Soccorso ritorna Jordan, la giovane affetta da pseudo-crisi convulsive, portata dal marito esasperato per il susseguirsi incessanti di tali crisi. Abby, si affeziona particolarmente al caso, e riesce, dopo vari tentativi, a convincere la paziente a ricoverarsi in psichiatria per indagare le ragioni di tali reazioni emotive. Dopo alcuni approcci, durante i quali, ancora una volta, sarà, suo malgrado, costretta ad analizzare anche la sua situazione, riesce ad individuare il trauma di cui all'origine, ma la paziente, da vigile, non riesce a collaborare più di tanto. In disaccordo col suo superiore, Abby convince Jordan a sottoporsi ad una seduta, tramite una sedazione indotta, per indagare più a fondo.

Kem ritorna a Chicago e Carter ne è entusiasta. Dopo averle mostrato i lavori eseguiti nella loro nuova casa, John mette al corrente il padre della sua decisione di donare il castello della nonna ad un ospedale e dirigere i fondi della fondazione verso nuovi obiettivi, a sfondo medico. Il padre disapprova la condotta del figlio, sia nel campo lavorativo, sia in quello dell'amministrazione dell'eredità di sua nonna, sia in quello sentimentale; dopo un diverbio, lascia Chicago.

Neela è sempre più dubbiosa sul suo futuro, e comincia a sentirsi contenta degli studi di laboratorio. Pratt la richiama spesso, non perdonandole di sprecare l'opportunità lasciatale da Gallant, che coprendola non le ha compromesso la carriera, e stimolandola a prendere una decisione definitiva.

Continua il gelo tra Sam e Luka, ancora disturbato per il ritorno del padre di Alex, che continua a dormire presso la loro abitazione. Sul finire dell'episodio, Abby, dopo aver superato il problema di Jordan, decide di riaffrontare l'esame di licenza.

Carter takes Kem to the hospital to check on their baby since it's not kicking anymore.

Kovacs stops to help a woman and her son whose car broke down. Steve is getting close to Alex, and Sam panics. Abby is looking for her letter whether to see she passed her boards. Pratt shows off his new Chrysler. Elgin tries to build a connection between him and Pratt. Jing-Mei might be battered by her senile father.