Gates corre sul luogo dell'esplosione dopo aver scoperto che nell'ambulanza c'era Pratt, non Sam. Pratt, ferito dall'esplosione, viene portato d'urgenza al Policlinico dove lo staff del Pronto Soccorso lavora per stabilizzarlo. Alla fine, Pratt muore in seguito alla rottura della carotide. Nel frattempo, Abby ha sbagliato la diagnosi di un paziente e parla dei suoi progetti di lasciare Chicago insieme a Luka. Anspaugh fa sapere che Pratt sarebbe diventato il capo del pronto soccorso. Morris cerca di riprendersi dopo la morte di Pratt.

Un nuovo gruppo di borsisti ed il nuovo capo del Pronto Soccorso arrivano al Policlinico per il loro primo giorno di lavoro mentre un bio terrorista con una borsa piena di Ricin viene medicato per una gamba rotta.

Abby ottiene un lavoro a Boston e prova a lasciare il Policlinico senza far sapere la novità, ma lo staff le dimostra quanto mancherà a tutti. Abby dice addio e parte per Boston con Luka e suo figlio.

Insoddisfatta per l'operato dei borsisti, la Banfiled decide di iniziare un nuovo sistema. Ogni borsista avrà un mentore: Daria è assegnata a Gates, Ryan a Morris e Tracy a Brenner. Brenner dice a Tracy come vuole procedere ma lei insiste nel fare le cose a modo suo.

Sam è occupata dai suoi studi per un esame di farmacologia e Gates si sente trascurato. Un litigio a scuola finisce con un accoltellamento, con Brenner che cura la vittima e cerca di scoprire la verità nascosta dietro a questa storia. Morris ha una sorpresa per Neela. Gates resta bloccato nella tromba delle scale insieme ad un ragazzino silenzioso nella notte di Halloween.

Dr. Banfield is irritated when Morris takes Chaz under his wing and teaches him risky medical procedures; Neela is unhappy when Dr. Banfield undermines her authority with an intern.

Dr. Banfield takes a run to clear her head but finds herself trying to rescue a three-year-old girl from drowning in a nearby lake. Gates tries to pull some strings in the ER to help his homeless war hero. Banfield is reminded of her own experience at County with Dr. Greene caring for her son as she tries to save the young three-year-old girl from certain death. Meanwhile, the interns continue to struggle to keep up in the ER.

Sam gets frustrated with Gates when he gets obsessed with finding a homeless war hero. Neela is upset at her intern after he gets the entire surgery department into a lawsuit. A husband and wife come into the ER after someone tried to burn down their home. Brenner loses his cool with a patient and it gets physical.

Banfield and Morris go to the coffee shop at 3 a.m. and are served by 20-year-old Debbie who is six-months pregnant. The doctors treat someone with a heart problem and Alex. Chaz must look for a missing 7-year-old boy who saw his sister die.

Morris' father arrives at the ER's doorstep and leaves him an unwanted package. Sam wants Alex to get off the ventilator as quick as possible following his accident. Meanwhile, a woman is in danger of being deported despite her high-risk pregnancy.

Alex is set to be released from the hospital. Doctors treat African-American brothers Curtis Bennet, 17, who has abdominal pain and 10-year-old Quincy Bennet who has a knee injury. Both were injured during a drug deal that went terribly wrong. There's still some residual tension between Gates and Sam. A female patient in police custody doesn't want to be examed by Morris. A 13-year-old patient named Anastasia messes with Neela's love life.

Neela has a recurring dream; Gates tries to save a patient who jumped out of a window while sleeping; Neela is surprised to see Dr. Corday.

Morris tries to help a girl who was hit while riding her bike; Gates can't get over his feelings for Sam; Neela is flustered when Dr. Brenner returns from Australia.

Morris and Gates treat an older man who was assaulted on the street; Sam gets a surprise visit from her sister; Dr. Morgenstern visits County General when he discovers an old mentor is ill.

Un'automobile si scontra con un'ambulanza nel parcheggio del pronto soccorso. Brenner si prende cura della bambina, che era nell'auto, in attesa del padre che però l'abbandona. Gates cerca di aumentare il suo indice di gradimento fra i pazienti cercando di convincere un uomo a farsi operare. Morris va all'appuntamento con l'agente Claudia, ma invece di un'uscita romantica si ritrova a dover impersonare Super Gary a una festa di compleanno per bambini.

It's Valentine's Day. Dr. John Carter is back at the County. Brenner and Neela are getting closer. Dr. Banfield is having a hard time trying to have a baby. And Puck and mushrooms may not be a good combination.

La dottoressa Banfield va ad un incontro come primo passo verso l'adozione di un bambino. Carter torna a lavorare al pronto soccorso ma Gates non si fida della sua esperienza. Morris è impegnato con due pazienti troppo osservanti delle regole. Arriva al pronto soccorso la madre di Sam che non la riconosce. Brenner pensa che una bambina subisca abusi dalla famiglia affidataria e non si sente compreso da Neela.

A camera crew interviews the staff at County General for a documentary on emergency medicine. Morris’ cop girlfriend gets injured on the job and is rushed into the ER with gunshot wounds. Neela wonders why her relationship with Brenner lacks so much communication. Sam struggles to make amends with her mother.

Un vecchio amico e mentore di Carter, Peter Benton, gli fa visita nel momento del bisogno, mentre è ricoverato in attesa di un trapianto. A Seattle Doug Ross e Carol Hathaway, nel frattempo divenuta medico, convincono una nonna, interpretata da Susan Sarandon, a consentire alla donazione degli organi del nipote. Doug, conversando con Neela, ricorda i tempi in cui era a Chicago.

Neela prova il suo valore quando si scontra con Dubenko su come procedere su due casi chirurgici. Brenner ha un momento di autoanalisi sulla sua dolorosa infanzia. Neela lascia il Policlinico per raggiungere Ray a Baton Rouge.

The ER doctors and nurses help out at Camp Del Corazon, a camp for kids who have had open-heart surgery, working alongside the camp counselor.

As Carter prepares to open a new facility for the underprivileged, some old friends/colleagues gather. Rachel Greene, Mark Greene's daughter, applies for an internship at County.